More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0200 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  100 
 
 
349 aa  695    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  88.33 
 
 
330 aa  541  1e-153  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  88.33 
 
 
330 aa  541  1e-153  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  75.67 
 
 
327 aa  483  1e-135  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  66.77 
 
 
330 aa  447  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  68.79 
 
 
328 aa  431  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  67.79 
 
 
331 aa  419  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  47.66 
 
 
328 aa  332  8e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  51.18 
 
 
327 aa  330  3e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  51.18 
 
 
325 aa  330  3e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  53.69 
 
 
324 aa  325  6e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  50.45 
 
 
331 aa  324  1e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  51.82 
 
 
328 aa  322  4e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  50.3 
 
 
336 aa  322  6e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  50.15 
 
 
339 aa  319  3.9999999999999996e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  49.53 
 
 
333 aa  319  5e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  49.66 
 
 
330 aa  317  2e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  51.3 
 
 
360 aa  316  3e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  49.5 
 
 
330 aa  317  3e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  50.34 
 
 
322 aa  316  4e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  48.12 
 
 
327 aa  315  5e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  48.9 
 
 
328 aa  315  7e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  49.67 
 
 
328 aa  313  1.9999999999999998e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  49.12 
 
 
335 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  49.33 
 
 
328 aa  312  4.999999999999999e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  50 
 
 
345 aa  312  5.999999999999999e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  49.4 
 
 
328 aa  312  5.999999999999999e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  50 
 
 
345 aa  312  6.999999999999999e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  49.01 
 
 
330 aa  311  1e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  51.16 
 
 
327 aa  310  2e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  49.32 
 
 
325 aa  310  2e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  50 
 
 
326 aa  308  6.999999999999999e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  47.25 
 
 
344 aa  308  1.0000000000000001e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  45.21 
 
 
327 aa  306  3e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  48.04 
 
 
335 aa  306  3e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  48 
 
 
304 aa  305  7e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  48.08 
 
 
314 aa  305  9.000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  48.33 
 
 
335 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  49.66 
 
 
333 aa  304  1.0000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  49.01 
 
 
324 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  51.16 
 
 
336 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  47.67 
 
 
335 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  47.62 
 
 
328 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  47.55 
 
 
358 aa  303  4.0000000000000003e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0843  hypothetical protein  47.99 
 
 
323 aa  302  6.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159621  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7860  hypothetical protein  44.61 
 
 
324 aa  302  6.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.266797 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4526  twin-arginine translocation pathway signal  48.97 
 
 
337 aa  300  3e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  47.81 
 
 
322 aa  298  7e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0797  hypothetical protein  50.61 
 
 
386 aa  298  1e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  48.09 
 
 
335 aa  296  2e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  48.83 
 
 
324 aa  297  2e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  49.83 
 
 
321 aa  296  3e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  48.66 
 
 
338 aa  296  4e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  45.37 
 
 
331 aa  296  5e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  45.37 
 
 
331 aa  295  9e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  49.5 
 
 
328 aa  294  1e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  43.87 
 
 
325 aa  293  3e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  47.85 
 
 
333 aa  293  3e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0288  hypothetical protein  50 
 
 
325 aa  293  3e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1757  hypothetical protein  51.16 
 
 
325 aa  293  4e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207491  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  45.59 
 
 
325 aa  293  4e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  47.9 
 
 
334 aa  293  4e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  48.84 
 
 
333 aa  292  5e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  45.79 
 
 
331 aa  292  6e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  46.71 
 
 
330 aa  292  7e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4598  hypothetical protein  51.01 
 
 
332 aa  291  8e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  48.11 
 
 
338 aa  291  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  47 
 
 
332 aa  290  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  49.01 
 
 
310 aa  290  2e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  46.25 
 
 
339 aa  290  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  49.16 
 
 
323 aa  290  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0208  hypothetical protein  47.28 
 
 
335 aa  290  3e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5203  hypothetical protein  49.66 
 
 
332 aa  290  4e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0847  hypothetical protein  45.43 
 
 
331 aa  288  8e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.318374  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  46.83 
 
 
330 aa  288  8e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5709  hypothetical protein  48.81 
 
 
327 aa  288  9e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21123  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1128  putative tricarboxylate transporter, periplasmic ligand binding protein (TctC subunit))  50.17 
 
 
328 aa  287  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  45.76 
 
 
325 aa  287  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  47.7 
 
 
322 aa  287  2e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  47.12 
 
 
330 aa  287  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  47 
 
 
323 aa  287  2e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  45.51 
 
 
336 aa  287  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  46.25 
 
 
320 aa  286  2.9999999999999996e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  46.2 
 
 
332 aa  286  5e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  47.83 
 
 
334 aa  286  5e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  45.68 
 
 
344 aa  286  5e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  47.51 
 
 
326 aa  285  5.999999999999999e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2485  hypothetical protein  45.06 
 
 
346 aa  285  5.999999999999999e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0644524  normal  0.0188147 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  46.41 
 
 
329 aa  285  5.999999999999999e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  48.15 
 
 
339 aa  285  9e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  45.16 
 
 
325 aa  285  9e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4453  hypothetical protein  51.34 
 
 
336 aa  285  1.0000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00304817 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  47.92 
 
 
331 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  46.46 
 
 
339 aa  284  2.0000000000000002e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2114  hypothetical protein  48.64 
 
 
325 aa  283  4.0000000000000003e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00328294 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  45.66 
 
 
337 aa  282  5.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  45.57 
 
 
332 aa  282  5.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  45.81 
 
 
322 aa  282  6.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  45.97 
 
 
321 aa  282  6.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  46.15 
 
 
339 aa  282  7.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>