More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0083 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0083  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 
423 aa  821    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0039  major facilitator superfamily transporter  77.86 
 
 
420 aa  553  1e-156  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.19043 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0613  major facilitator superfamily transporter  71.73 
 
 
422 aa  523  1e-147  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0055  major facilitator superfamily MFS_1  77.64 
 
 
415 aa  518  1e-146  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.628299  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1556  putative transmembrane transport protein  69.19 
 
 
422 aa  521  1e-146  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.233072  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0059  major facilitator transporter  72.77 
 
 
417 aa  503  1e-141  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2012  major facilitator transporter  64.42 
 
 
421 aa  452  1.0000000000000001e-126  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.147119 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1946  major facilitator transporter  51.19 
 
 
420 aa  395  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.086986  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1964  major facilitator transporter  48.79 
 
 
440 aa  347  3e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2824  major facilitator transporter  46.33 
 
 
420 aa  332  7.000000000000001e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.263377 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1507  major facilitator transporter  45.5 
 
 
411 aa  327  3e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2216  major facilitator superfamily transporter  46.23 
 
 
411 aa  323  4e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.167097 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1850  major facilitator superfamily MFS_1  44.15 
 
 
417 aa  317  3e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1885  major facilitator transporter  46.45 
 
 
402 aa  265  1e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2519  major facilitator transporter  37.2 
 
 
414 aa  190  4e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.573813 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0005  major facilitator superfamily MFS_1  34.31 
 
 
394 aa  182  1e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.695547  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0005  major facilitator superfamily MFS_1  33.6 
 
 
394 aa  178  2e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.32076  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0005  major facilitator superfamily MFS_1  35.04 
 
 
396 aa  171  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0005  major facilitator superfamily MFS_1  35.22 
 
 
396 aa  167  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3708  major facilitator transporter  34.46 
 
 
405 aa  153  5e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2034  major facilitator superfamily MFS_1  33.5 
 
 
419 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.836232  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4393  major facilitator transporter  32.67 
 
 
403 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1566  major facilitator transporter  34.97 
 
 
405 aa  151  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.646941 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0689  major facilitator superfamily permease  31.61 
 
 
407 aa  139  8.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3770  major facilitator superfamily MFS_1  25.59 
 
 
418 aa  119  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2766  major facilitator transporter  24.68 
 
 
429 aa  82  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3640  major facilitator superfamily MFS_1  28.32 
 
 
410 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4717  major facilitator superfamily MFS_1  28.32 
 
 
410 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00521537 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3928  major facilitator superfamily MFS_1  26.98 
 
 
420 aa  78.6  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2522  major facilitator superfamily MFS_1  25.19 
 
 
440 aa  77.4  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.636456  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3973  major facilitator superfamily MFS_1  26.61 
 
 
449 aa  76.3  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0156  major facilitator superfamily MFS_1  26.52 
 
 
408 aa  74.3  0.000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1587  major facilitator transporter  27.81 
 
 
412 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3147  major facilitator transporter  28.12 
 
 
434 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3645  major facilitator transporter  29.35 
 
 
398 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.212684 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1844  major facilitator transporter  30.53 
 
 
389 aa  70.1  0.00000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0751  major facilitator superfamily MFS_1  27.15 
 
 
398 aa  69.7  0.00000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.207207  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1603  major facilitator superfamily MFS_1  25.17 
 
 
399 aa  69.7  0.00000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0711095  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0539  fosmidomycin resistance protein  27.34 
 
 
406 aa  69.3  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0546  fosmidomycin resistance protein  27.34 
 
 
406 aa  69.3  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.268965  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0556  fosmidomycin resistance protein  27.34 
 
 
406 aa  69.3  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.809506 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0600  fosmidomycin resistance protein  27.34 
 
 
406 aa  69.3  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.184073  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4496  major facilitator transporter  28.12 
 
 
434 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1260  fosmidomycin resistance protein  26.92 
 
 
404 aa  68.9  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0237353  hitchhiker  0.0000222003 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3131  major facilitator superfamily MFS_1  26.44 
 
 
406 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3137  major facilitator transporter  26.44 
 
 
406 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.546423  hitchhiker  0.000000426482 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0523  fosmidomycin resistance protein  26.44 
 
 
406 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0541  fosmidomycin resistance protein  26.99 
 
 
406 aa  68.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.404971  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0358  major facilitator superfamily MFS_1  33.81 
 
 
423 aa  68.9  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.359815 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0571  fosmidomycin resistance protein  26.44 
 
 
406 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.652835  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0556  fosmidomycin resistance protein  26.44 
 
 
406 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2124  major facilitator superfamily transporter  32.02 
 
 
431 aa  68.6  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204693  normal  0.329933 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3033  fosmidomycin resistance protein  26.92 
 
 
404 aa  68.9  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00068897  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8222  major facilitator superfamily MFS_1  25.71 
 
 
422 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41082  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0518  fosmidomycin resistance protein  26.1 
 
 
406 aa  67  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00430  predicted fosmidomycin efflux system  26.44 
 
 
406 aa  66.6  0.0000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00435  hypothetical protein  26.44 
 
 
406 aa  66.6  0.0000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1681  major facilitator transporter  27.37 
 
 
402 aa  66.6  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112178  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2392  major facilitator superfamily MFS_1  30.67 
 
 
416 aa  65.9  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0023  major facilitator transporter  27.39 
 
 
409 aa  66.2  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1166  major facilitator transporter  26.47 
 
 
421 aa  66.2  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0958  major facilitator transporter  27.15 
 
 
406 aa  65.5  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4025  major facilitator superfamily fosmidomycin resistant protein  25.17 
 
 
401 aa  65.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.164373  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1340  major facilitator superfamily multidrug (fosmidomycin) efflux transporter  26.09 
 
 
420 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0273  major facilitator transporter  23.04 
 
 
405 aa  65.1  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.473201  normal  0.019317 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5727  major facilitator transporter  27.56 
 
 
434 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3799  fosmidomycin resistance protein  28.22 
 
 
402 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.319996  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4112  major facilitator transporter  26.1 
 
 
397 aa  64.3  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0806371  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0609  major facilitator superfamily transporter  24.32 
 
 
420 aa  64.3  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.315746  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0394  major facilitator transporter  31.97 
 
 
414 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1146  major facilitator transporter  25.61 
 
 
406 aa  63.2  0.000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155488  unclonable  0.000000029988 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5132  major facilitator transporter  28.48 
 
 
412 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4105  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  27.4 
 
 
437 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2794  major facilitator superfamily MFS_1  25.75 
 
 
419 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.572754  normal  0.513078 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5303  major facilitator transporter  26.86 
 
 
436 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5122  major facilitator transporter  31.97 
 
 
414 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3939  major facilitator superfamily MFS_1  31.67 
 
 
407 aa  62.4  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4588  major facilitator transporter  25.74 
 
 
412 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1365  major facilitator transporter  26.44 
 
 
412 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.399503 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5072  major facilitator family transporter  31.97 
 
 
425 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.348741  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6220  major facilitator superfamily MFS_1  27.46 
 
 
437 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000198759  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4945  major facilitator transporter  31.97 
 
 
414 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.395119  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2207  major facilitator superfamily MFS_1  24.57 
 
 
396 aa  61.2  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.78926  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0962  major facilitator transporter  26.67 
 
 
412 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1444  major facilitator transporter  26.67 
 
 
412 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1472  major facilitator transporter  32.28 
 
 
458 aa  61.2  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.302932  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1794  Xaa-Pro dipeptidase  29.86 
 
 
389 aa  61.2  0.00000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1871  major facilitator transporter  26.07 
 
 
413 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.565485  hitchhiker  0.00660368 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0216  hypothetical protein  25.2 
 
 
393 aa  60.8  0.00000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0734  major facilitator transporter  25.35 
 
 
404 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.459587 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0701  MFS efflux transporter, putative  25.35 
 
 
404 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2341  major facilitator superfamily MFS_1  31.28 
 
 
417 aa  60.5  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0735  major facilitator transporter  25.35 
 
 
404 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4252  regulatory protein UhpC  25.91 
 
 
439 aa  60.8  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1326  major facilitator transporter  26.1 
 
 
412 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686197  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2084  major facilitator superfamily MFS_1  23.96 
 
 
395 aa  60.8  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.942608 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1422  major facilitator transporter  25.8 
 
 
412 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5052  major facilitator transporter  27.15 
 
 
423 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344485  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5808  major facilitator transporter  27.15 
 
 
423 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499125  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2437  major facilitator superfamily MFS_1  27.33 
 
 
396 aa  60.5  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.905943  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>