17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0058 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_0058  GtrA family protein  100 
 
 		 143 aa  283  4e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0167  hypothetical protein  63.85 
 
 		 141 aa  166  8e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.319127  normal  0.557481 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0892  hypothetical protein  60.77 
 
 		 141 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0326  hypothetical protein  58.33 
 
 		 133 aa  160  5.0000000000000005e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3790  hypothetical protein  60.31 
 
 		 141 aa  156  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.400207 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1553  hypothetical protein  59.7 
 
 		 143 aa  154  3e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1704  GtrA-like protein  52.42 
 
 		 129 aa  117  6e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0141  GtrA family protein  48.06 
 
 		 141 aa  115  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4796  hypothetical protein  41.86 
 
 		 631 aa  99.8  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.518847  normal  0.599204 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3488  GtrA family protein  37.41 
 
 		 141 aa  77  0.00000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3164  GtrA family protein  36.69 
 
 		 141 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3360  GtrA family protein  34.09 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2429  GtrA family protein  19.31 
 
 		 194 aa  44.7  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.859714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5592  hypothetical protein  39.71 
 
 		 165 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.586213  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5008  GtrA family protein  25.35 
 
 		 162 aa  42.7  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.780646 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5947  hypothetical protein  27.13 
 
 		 163 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0058  GtrA family protein  27.01 
 
 		 133 aa  42  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>