39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0057 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_0057  integral membrane protein  100 
 
 		 328 aa  612  9.999999999999999e-175  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1012  hypothetical protein  35.71 
 
 		 323 aa  125  9e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.58279 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2300  hypothetical protein  37.7 
 
 		 322 aa  116  5e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0170913  hitchhiker  0.00842153 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1947  hypothetical protein  31.76 
 
 		 315 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.789852  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1703  hypothetical protein  30.8 
 
 		 335 aa  92  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6876  hypothetical protein  31.77 
 
 		 344 aa  86.7  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3499  hypothetical protein  33.45 
 
 		 319 aa  79  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.140229  normal  0.790833 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3529  hypothetical protein  30.53 
 
 		 327 aa  77.8  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1965  hypothetical protein  32.08 
 
 		 320 aa  74.3  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1413  hypothetical protein  23.41 
 
 		 318 aa  70.5  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00553932  normal  0.0166848 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0481  hypothetical protein  31.85 
 
 		 325 aa  70.9  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1403  hypothetical protein  23.72 
 
 		 318 aa  70.1  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.209526  normal  0.367043 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0153  hypothetical protein  30.74 
 
 		 326 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0782  hypothetical protein  28.47 
 
 		 339 aa  61.6  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2791  hypothetical protein  28.42 
 
 		 309 aa  61.2  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4029  hypothetical protein  39.64 
 
 		 326 aa  58.5  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.579086 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1494  hypothetical protein  21.77 
 
 		 333 aa  58.5  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.060435 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1200  hypothetical protein  30.38 
 
 		 337 aa  54.3  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.160085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1769  glycosyl transferase family protein  25.5 
 
 		 586 aa  53.1  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.162316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1082  hypothetical protein  25.83 
 
 		 304 aa  52  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.789813  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2685  hypothetical protein  23.53 
 
 		 342 aa  52  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0770  hypothetical protein  22.04 
 
 		 340 aa  51.6  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0163  hypothetical protein  33.33 
 
 		 320 aa  51.6  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00309358 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1791  hypothetical protein  24.68 
 
 		 346 aa  49.7  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1628  hypothetical protein  21.64 
 
 		 321 aa  49.7  0.00008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.119039  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3582  hypothetical protein  26.09 
 
 		 378 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1614  hypothetical protein  23.95 
 
 		 320 aa  48.9  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4270  hypothetical protein  25.23 
 
 		 370 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1018  hypothetical protein  21.79 
 
 		 338 aa  48.5  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0042  hypothetical protein  22.64 
 
 		 316 aa  46.6  0.0005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000066001 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3900  hypothetical protein  34.18 
 
 		 331 aa  46.6  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3135  hypothetical protein  29.33 
 
 		 338 aa  46.6  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0053  hypothetical protein  23.29 
 
 		 340 aa  46.2  0.0008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1148  hypothetical protein  23.29 
 
 		 340 aa  45.8  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1188  glycosyl transferase family 2  29.93 
 
 		 606 aa  43.9  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.017563  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0140  hypothetical protein  26.37 
 
 		 351 aa  42.7  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167342 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0835  hypothetical protein  20.41 
 
 		 340 aa  42.7  0.007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1628  hypothetical protein  26.61 
 
 		 340 aa  42.7  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1008  hypothetical protein  27.84 
 
 		 330 aa  42.4  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00036444  hitchhiker  0.0000000000115467 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>