166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0040 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_0040  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 471 aa  905    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3501  Outer membrane efflux protein  35.79 
 
 		 489 aa  147  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1877  Outer membrane efflux protein  37.06 
 
 		 413 aa  143  6e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3836  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin HmvC  34.88 
 
 		 445 aa  139  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1176  Outer membrane efflux protein  33.87 
 
 		 429 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2171  outer membrane efflux protein  35.47 
 
 		 415 aa  129  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00952498  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0045  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  29.01 
 
 		 423 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0062  outer membrane efflux protein  29.01 
 
 		 423 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000405972 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0059  outer membrane efflux protein  29.01 
 
 		 423 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.56854 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0059  outer membrane efflux protein  29.01 
 
 		 394 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00860018 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2110  outer membrane efflux protein  30.5 
 
 		 437 aa  84.7  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.313002  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1641  Outer membrane efflux protein  30.22 
 
 		 479 aa  84.7  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1551  outer membrane efflux protein  29.33 
 
 		 443 aa  80.9  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2433  outer membrane efflux protein  29.66 
 
 		 440 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6170  outer membrane efflux protein  28.38 
 
 		 435 aa  72  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.446847 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4686  outer membrane efflux protein  29.41 
 
 		 439 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432562  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3677  outer membrane efflux protein  29.41 
 
 		 439 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.621392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3845  outer membrane efflux protein  29.41 
 
 		 437 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0447  outer membrane efflux protein  25.95 
 
 		 438 aa  71.2  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.109934 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1373  heavy metal resistance protein CzcC  32.63 
 
 		 443 aa  70.1  0.00000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0705  RND heavy metal ion efflux pump, outer membrane protein  29.07 
 
 		 458 aa  70.1  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.199067  normal  0.26582 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0502  outer membrane efflux protein  27.93 
 
 		 433 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1031  heavy metal resistance protein CzcC  31.37 
 
 		 443 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0033  heavy metal resistance protein CzcC  31.37 
 
 		 443 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.299983  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2553  outer membrane efflux protein  27.3 
 
 		 421 aa  68.6  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0013  heavy metal resistance protein CzcC  31.37 
 
 		 461 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.238799  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0399  heavy metal resistance protein CzcC  31.37 
 
 		 461 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.132876  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1527  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcC  31.37 
 
 		 452 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1442  cobalt-zinc-cadmium resistance efflux protein  31.37 
 
 		 461 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0705718  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1183  heavy metal resistance protein CzcC  31.37 
 
 		 461 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.84848  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1420  Outer membrane efflux protein  27.03 
 
 		 472 aa  67.4  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1111  Outer membrane efflux protein  27.84 
 
 		 492 aa  66.6  0.0000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.33067  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7183  putative outer membrane protein precursor CzcC  27.06 
 
 		 422 aa  66.6  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3802  Outer membrane efflux protein  26.98 
 
 		 465 aa  66.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1847  outer membrane efflux protein  26.36 
 
 		 451 aa  66.2  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2639  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.73 
 
 		 461 aa  64.3  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4801  Outer membrane efflux protein  26.97 
 
 		 408 aa  63.9  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249818 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0617  outer membrane efflux protein  27.06 
 
 		 438 aa  63.2  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0802  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.9 
 
 		 453 aa  62.8  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3287  outer membrane efflux protein  33.56 
 
 		 464 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3723  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.9 
 
 		 512 aa  61.6  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0377  metal ion efflux outer membrane protein, putative  27.16 
 
 		 408 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2408  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcC, putative  33.56 
 
 		 425 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00195815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2298  outer membrane efflux protein  24.84 
 
 		 423 aa  60.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0610  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.17 
 
 		 480 aa  60.5  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7201  outer membrane efflux protein  25 
 
 		 418 aa  58.5  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1126  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.76 
 
 		 450 aa  58.2  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2352  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.16 
 
 		 446 aa  58.2  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2568  outer membrane efflux protein  26.97 
 
 		 438 aa  58.2  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.316597 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2142  outer membrane efflux protein  23.27 
 
 		 423 aa  57  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.143725 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3619  outer membrane channel protein  25.4 
 
 		 469 aa  57  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3623  Outer membrane efflux protein  26.25 
 
 		 415 aa  57  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1664  Type I secretion outer membrane protein, TolC  27.39 
 
 		 453 aa  56.6  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1764  outer membrane efflux protein  26.76 
 
 		 418 aa  56.2  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715826  normal  0.306921 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3648  outer membrane efflux protein  24.75 
 
 		 424 aa  56.6  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.856557 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4977  outer membrane efflux protein TolC, putative  21.94 
 
 		 479 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0150  Outer membrane efflux protein  28.1 
 
 		 415 aa  55.5  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.921658  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2344  outer membrane efflux protein  24.84 
 
 		 423 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5982  cation proton antiporter efflux protein CzcC  27.14 
 
 		 418 aa  55.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000196082  normal  0.0745476 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4120  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin HmyC  26.27 
 
 		 460 aa  55.5  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3777  outer membrane channel protein  22.71 
 
 		 470 aa  55.5  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2042  outer membrane efflux protein  32.56 
 
 		 417 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.367282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6550  outer membrane efflux protein  26.15 
 
 		 433 aa  55.1  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.125608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1848  outer membrane efflux protein  25.83 
 
 		 423 aa  55.1  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3958  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.22 
 
 		 491 aa  55.1  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.753849  normal  0.338977 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1990  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.31 
 
 		 498 aa  55.1  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2628  Outer membrane efflux protein  25.69 
 
 		 432 aa  54.3  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.753633 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3274  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.32 
 
 		 495 aa  54.7  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3448  outer membrane channel protein  23.39 
 
 		 494 aa  54.7  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.203909 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0543  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.88 
 
 		 479 aa  53.9  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.991736 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3332  outer membrane channel protein  24.91 
 
 		 431 aa  53.9  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0563453  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0294  Outer membrane efflux protein  26.51 
 
 		 420 aa  53.9  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1022  Type I secretion outer membrane protein, TolC  27.55 
 
 		 489 aa  53.5  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.15714  normal  0.470087 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1455  Outer membrane efflux protein  25.16 
 
 		 423 aa  53.1  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.170729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3330  outer membrane channel protein  24.16 
 
 		 493 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3557  outer membrane efflux protein  27.16 
 
 		 442 aa  52.8  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4530  outer membrane efflux protein  27.48 
 
 		 425 aa  53.1  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4596  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin  28.62 
 
 		 431 aa  52.8  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0688687  hitchhiker  0.005842 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5705  outer membrane efflux protein  23.73 
 
 		 481 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0665  outer membrane efflux protein  23.02 
 
 		 453 aa  52.8  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000306808  hitchhiker  0.00231848 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4268  outer membrane channel protein  22.15 
 
 		 497 aa  52.8  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0102816 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02907  outer membrane channel precursor protein  24.16 
 
 		 493 aa  52  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0665  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.16 
 
 		 493 aa  52  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3371  outer membrane efflux protein  26.56 
 
 		 407 aa  52.4  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.252246  normal  0.409086 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3367  outer membrane channel protein  23.25 
 
 		 489 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3437  outer membrane channel protein  23.25 
 
 		 489 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3539  outer membrane channel protein  23.25 
 
 		 489 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.735558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3793  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.78 
 
 		 495 aa  52.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.351966 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3372  outer membrane channel protein  23.25 
 
 		 489 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.258775 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0662  outer membrane channel protein  24.16 
 
 		 493 aa  52  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.120975  normal  0.0171626 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3499  outer membrane channel protein  24.16 
 
 		 495 aa  52  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0404091  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3468  outer membrane channel protein  23.22 
 
 		 495 aa  52  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0175451  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31970  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  27.85 
 
 		 428 aa  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65750  putative outer membrane efflux protein precursor  23.73 
 
 		 482 aa  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2929  outer membrane efflux protein  25.56 
 
 		 443 aa  52.4  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2504  outer membrane efflux protein  29.79 
 
 		 436 aa  52  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.10477  normal  0.0160345 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1714  outer membrane efflux protein  26.52 
 
 		 443 aa  52.4  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.664423 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1175  outer membrane efflux protein  28.01 
 
 		 416 aa  52  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3213  outer membrane channel protein  24.16 
 
 		 495 aa  52  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00955114  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7266  putative outer membrane cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcC precursor  25.67 
 
 		 424 aa  52  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.217099  normal  0.831215 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>