More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0039 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0039  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 
403 aa  788    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3837  heavy metal cation tricomponent efflux membrane fusion protein HmvB  46.63 
 
 
405 aa  293  5e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.613806  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3502  secretion protein HlyD  47.92 
 
 
402 aa  268  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0531156  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1876  secretion protein HlyD  48.68 
 
 
375 aa  250  3e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.748539  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1177  secretion protein HlyD  43.04 
 
 
397 aa  194  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2170  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.39 
 
 
390 aa  194  2e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000873754  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1640  secretion protein HlyD  39 
 
 
384 aa  186  6e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0918  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.45 
 
 
366 aa  164  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.581959 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4057  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.08 
 
 
374 aa  164  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3727  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.22 
 
 
359 aa  160  4e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00335506  normal  0.0890337 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2627  secretion protein HlyD  32.64 
 
 
399 aa  157  4e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.524182 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0829  CzcB family heavy metal efflux protein  34.52 
 
 
423 aa  156  6e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0747  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.71 
 
 
405 aa  156  7e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.413213  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2136  CzcB family heavy metal efflux protein  34.52 
 
 
418 aa  155  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2253  secretion protein HlyD  32.87 
 
 
398 aa  155  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.706134 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0979  transporter, putative  35.97 
 
 
253 aa  153  5e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3561  secretion protein HlyD  33.33 
 
 
413 aa  152  8e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.398677 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0579  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30 
 
 
362 aa  152  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.087454  normal  0.0363138 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3803  secretion protein HlyD  30.13 
 
 
386 aa  151  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.545346  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2275  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.2 
 
 
427 aa  151  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.178981 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.53 
 
 
428 aa  151  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0295  secretion protein HlyD  32.8 
 
 
379 aa  149  7e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.438063  normal  0.535582 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2988  hypothetical protein  31.56 
 
 
416 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1342  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.64 
 
 
365 aa  145  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.754197  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5330  heavy metal cation tricomponent efflux protein HmxB  33.6 
 
 
385 aa  145  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0257182  normal  0.961677 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1112  secretion protein HlyD  33.8 
 
 
383 aa  144  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.941  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3361  RND family efflux transporter MFP subunit  32.14 
 
 
410 aa  144  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0152  secretion protein HlyD  29.82 
 
 
382 aa  142  8e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4121  heavy metal cation tricomponent efflux membrane fusion protein HmyB  31.66 
 
 
384 aa  142  9e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0503  secretion protein HlyD  30.91 
 
 
390 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3508  secretion protein HlyD  30.31 
 
 
424 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2010  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.19 
 
 
412 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.2279  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0830  cation eflux system protein  24.59 
 
 
368 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0187806  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2746  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.59 
 
 
366 aa  140  6e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4764  RND family efflux transporter MFP subunit  32.69 
 
 
405 aa  139  7e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0953346  normal  0.423915 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4294  RND family efflux transporter MFP subunit  24.38 
 
 
361 aa  139  7e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02378  cation transporter transmembrane protein  33.88 
 
 
382 aa  139  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.571869  normal  0.441465 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0537  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.19 
 
 
400 aa  138  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0791  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.78 
 
 
373 aa  138  2e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2550  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.15 
 
 
359 aa  136  6.0000000000000005e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0105666  normal  0.0985719 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3606  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.66 
 
 
406 aa  136  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.335838  normal  0.676056 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4683  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.66 
 
 
406 aa  136  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0376338  normal  0.281701 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4284  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.33 
 
 
382 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4394  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.33 
 
 
382 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.321467  normal  0.9163 
 
 
-
 
NC_003296  RS00408  putative cation efflux protein  32.69 
 
 
344 aa  134  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000967818  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0448  secretion protein HlyD  27.67 
 
 
388 aa  134  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.192124 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2436  RND family efflux transporter MFP subunit  28.18 
 
 
581 aa  132  9e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.287598  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1812  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.48 
 
 
364 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3686  RND family efflux transporter MFP subunit  30.56 
 
 
440 aa  130  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.98045  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3518  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.27 
 
 
376 aa  131  3e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1182  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.89 
 
 
421 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.272919 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2732  RND family efflux transporter MFP subunit  24.57 
 
 
361 aa  130  6e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0844309  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1241  RND family efflux transporter MFP subunit  29.22 
 
 
417 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.975545 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1403  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.81 
 
 
417 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.424837  normal  0.123182 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4263  RND family efflux transporter MFP subunit  31.06 
 
 
504 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0959435 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00705  cation efflux system protein  32.53 
 
 
371 aa  126  5e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.333087  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5320  heavy metal cation tricomponent efflux protein ZniB  30.03 
 
 
404 aa  127  5e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.666286 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0088  RND family efflux transporter MFP subunit  29.03 
 
 
468 aa  127  5e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1545  HlyD family heavy metal efflux pump  27.75 
 
 
415 aa  126  7e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.453732  normal  0.148664 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3470  HlyD family heavy metal efflux pump  30 
 
 
375 aa  126  8.000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2842  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.49 
 
 
587 aa  126  9e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.609412  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2165  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.06 
 
 
456 aa  126  9e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3566  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.49 
 
 
671 aa  124  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.707704  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1297  RND family efflux transporter MFP subunit  31.35 
 
 
403 aa  122  9e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4105  secretion protein HlyD  32.89 
 
 
527 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3649  RND family efflux transporter MFP subunit  24.93 
 
 
472 aa  121  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0686  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.79 
 
 
380 aa  119  9e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00268178 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2530  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.81 
 
 
384 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.389098 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3078  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.6 
 
 
460 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1671  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.12 
 
 
384 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2928  RND family efflux transporter MFP subunit  27.42 
 
 
455 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2945  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.12 
 
 
384 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.905544  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2505  RND family efflux transporter MFP subunit  28.76 
 
 
416 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0949204  normal  0.0148068 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1078  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.58 
 
 
459 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.465461  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1549  RND family efflux transporter MFP subunit  32.34 
 
 
402 aa  118  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1848  RND family efflux transporter MFP subunit  29.82 
 
 
538 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.485461  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2311  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.12 
 
 
705 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1529  secretion protein HlyD  31.17 
 
 
467 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1548  secretion protein HlyD  27.76 
 
 
466 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0420429  normal  0.648627 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4986  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.45 
 
 
384 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00839264 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0354  RND family efflux transporter MFP subunit  35.32 
 
 
518 aa  116  6e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.564378  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1465  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.74 
 
 
519 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.817622  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2057  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.45 
 
 
465 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000291349 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3297  secretion protein HlyD  26.61 
 
 
418 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3622  secretion protein HlyD  32.48 
 
 
397 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106281  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0412  secretion protein HlyD  29.94 
 
 
537 aa  113  5e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2912  secretion protein HlyD  26.65 
 
 
418 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0019  RND family efflux transporter MFP subunit  30.67 
 
 
382 aa  112  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3556  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.9 
 
 
433 aa  110  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1331  RND family efflux transporter MFP subunit  30 
 
 
451 aa  110  5e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4233  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31 
 
 
568 aa  109  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1301  RND family efflux transporter MFP subunit  28.48 
 
 
419 aa  109  9.000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.837432  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4256  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31 
 
 
526 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1407  secretion protein HlyD  28.72 
 
 
540 aa  108  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3969  secretion protein HlyD  29.06 
 
 
407 aa  107  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0953607  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1176  RND family efflux transporter MFP subunit  32.51 
 
 
421 aa  107  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.771785  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2457  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.33 
 
 
457 aa  107  4e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.704065  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1766  heavy metal efflux system protein, putative  28.15 
 
 
376 aa  106  7e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6171  RND family efflux transporter MFP subunit  28.8 
 
 
491 aa  106  8e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.442702 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1554  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.25 
 
 
363 aa  105  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0484603  hitchhiker  0.00000015248 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>