30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0007 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_0007  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 209 aa  411  1e-114  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0094  hypothetical protein  49.17 
 
 		 192 aa  179  2e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2615  DNA polymerase beta subunit  44.33 
 
 		 195 aa  175  5e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.506514  normal  0.0510048 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0103  DNA polymerase beta subunit  44.68 
 
 		 206 aa  172  2.9999999999999996e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4942  regulatory protein ArsR  46.24 
 
 		 199 aa  166  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.480424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3611  hypothetical protein  40.41 
 
 		 215 aa  141  9e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.559317  normal  0.0155573 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1731  putative transcriptional regulator  40.21 
 
 		 210 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2343  putative transcriptional regulator  40.21 
 
 		 210 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1516  nucleotidyltransferase domain-containing protein  34.39 
 
 		 203 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.387412  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0359  DNA polymerase, beta-like region  40.35 
 
 		 196 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193538  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0842  DNA polymerase beta subunit  40.35 
 
 		 196 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0461071  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0814  DNA polymerase beta subunit  40.35 
 
 		 185 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.626754  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5390  DNA polymerase beta domain protein region  39.66 
 
 		 191 aa  108  6e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.536785  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0701  hypothetical protein  28.9 
 
 		 176 aa  81.6  0.000000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000726563  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3250  putative transcriptional regulator, GntR family  28.48 
 
 		 191 aa  72  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1617  hypothetical protein  28.03 
 
 		 182 aa  70.5  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0533  hypothetical protein  27.42 
 
 		 183 aa  69.7  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2115  DNA polymerase beta subunit  31.08 
 
 		 205 aa  66.6  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3684  hypothetical protein  27.68 
 
 		 176 aa  65.5  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3725  regulatory protein ArsR  32.45 
 
 		 197 aa  62  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1495  DNA polymerase beta domain protein region  31.5 
 
 		 218 aa  49.7  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00270  hypothetical protein  30.77 
 
 		 190 aa  48.9  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3015  DNA polymerase beta subunit  41.33 
 
 		 142 aa  48.5  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.914629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2688  DNA polymerase beta domain protein region  36.36 
 
 		 229 aa  48.1  0.00009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.373799  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2688  hypothetical protein  26.78 
 
 		 212 aa  47.4  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.100137  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0362  DNA polymerase beta subunit  24.32 
 
 		 205 aa  43.1  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0234  DNA polymerase beta domain protein region  35.56 
 
 		 265 aa  42.7  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.126142  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0317  DNA polymerase beta domain protein region  29.49 
 
 		 121 aa  42  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4420  DNA polymerase beta subunit  39.19 
 
 		 118 aa  42  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478946  normal  0.142305 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0041  DNA polymerase beta domain protein region  34.88 
 
 		 117 aa  42  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>