More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_1616 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010830  Aasi_1616  hypothetical protein  100 
 
 
339 aa  706    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.787812 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0401  radical SAM enzyme, Cfr family  59.58 
 
 
399 aa  404  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.213699  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3329  hypothetical protein  55.69 
 
 
428 aa  404  1e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0709  hypothetical protein  58.68 
 
 
398 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2859  radical SAM protein  57.77 
 
 
408 aa  402  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3068  radical SAM protein  57.77 
 
 
413 aa  399  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0093  hypothetical protein  58.08 
 
 
399 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.82991  normal  0.435247 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0241  putative pyruvate formate lyase activating enzyme 2 (yfgB)  57.43 
 
 
403 aa  397  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.283575  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1122  radical SAM protein  55.14 
 
 
430 aa  396  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3311  radical SAM enzyme  55.29 
 
 
406 aa  394  1e-108  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.853243  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0035  hypothetical protein  56.64 
 
 
399 aa  391  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2966  radical SAM enzyme, Cfr family  54.76 
 
 
399 aa  393  1e-108  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.80573 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2700  radical SAM protein  54.95 
 
 
390 aa  391  1e-108  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.83245  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1380  radical SAM protein  56.64 
 
 
399 aa  392  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0398  radical SAM protein  55.49 
 
 
414 aa  393  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0578367  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4047  radical SAM enzyme, Cfr family  55.36 
 
 
409 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0076  hypothetical protein  56.08 
 
 
411 aa  389  1e-107  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.525724  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0041  radical SAM protein  55.16 
 
 
392 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2806  hypothetical protein  56.05 
 
 
427 aa  388  1e-107  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0090  radical SAM protein  54.84 
 
 
411 aa  388  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1382  radical SAM superfamily protein  55.46 
 
 
392 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1640  radical SAM protein  55.33 
 
 
425 aa  389  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.100638  normal  0.136917 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0050  radical SAM protein  55.46 
 
 
392 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.890909  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0269  hypothetical protein  55.06 
 
 
410 aa  390  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.169274 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3626  hypothetical protein  57.23 
 
 
397 aa  391  1e-107  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.674584  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1922  radical SAM enzyme, Cfr family  55.62 
 
 
425 aa  390  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0056484 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3724  radical SAM enzyme, Cfr family  55.07 
 
 
408 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4168  Fe-S-cluster redox protein  54.8 
 
 
410 aa  390  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.433493  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0077  hypothetical protein  55.79 
 
 
411 aa  386  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0759  radical SAM protein  55.17 
 
 
391 aa  387  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1592  radical SAM enzyme, Cfr family  54.47 
 
 
425 aa  386  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.368814  normal  0.725987 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4488  radical SAM enzyme, Cfr family  54 
 
 
431 aa  382  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0185  radical SAM protein  55.32 
 
 
404 aa  380  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.582725 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1362  radical SAM protein  55.79 
 
 
414 aa  379  1e-104  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.627333  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0085  radical SAM enzyme, Cfr family  50.89 
 
 
404 aa  378  1e-104  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.176991  normal  0.136088 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0028  radical SAM protein  54.95 
 
 
396 aa  380  1e-104  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4556  radical SAM protein  53.14 
 
 
431 aa  378  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.15006  decreased coverage  0.00152892 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2505  radical SAM protein  53.73 
 
 
391 aa  380  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.282858  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0703  hypothetical protein  51.12 
 
 
420 aa  376  1e-103  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2962  radical SAM protein  52.87 
 
 
402 aa  375  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.161045 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3014  hypothetical protein  52.82 
 
 
397 aa  369  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.327469 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1436  hypothetical protein  51.14 
 
 
429 aa  367  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2993  radical SAM protein  49.55 
 
 
356 aa  328  1.0000000000000001e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00523882  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2089  hypothetical protein  47.24 
 
 
384 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0732  radical SAM enzyme, Cfr family  48.15 
 
 
377 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1212  hypothetical protein  46.95 
 
 
383 aa  317  2e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2109  hypothetical protein  46.93 
 
 
384 aa  315  9e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.207444 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1167  radical SAM protein  47.46 
 
 
374 aa  314  1.9999999999999998e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2232  radical SAM protein  47.45 
 
 
378 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.750735  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1837  radical SAM protein  47.15 
 
 
378 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.323888  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1056  radical SAM enzyme, Cfr family  46.04 
 
 
383 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0486076  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1347  radical SAM protein  47.15 
 
 
378 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2230  radical SAM protein  47.15 
 
 
378 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1109  radical SAM protein  47.15 
 
 
378 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.545154  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2357  radical SAM protein  47.15 
 
 
378 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1148  radical SAM enzyme, Cfr family  46.04 
 
 
383 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187802  normal  0.550837 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0060  radical SAM protein  47.15 
 
 
378 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0447485  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2192  radical SAM protein  47.15 
 
 
378 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0838123  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1087  radical SAM enzyme, Cfr family  47.46 
 
 
383 aa  313  2.9999999999999996e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.486861  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1124  radical SAM protein  47.87 
 
 
369 aa  313  2.9999999999999996e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.371918  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5115  hypothetical protein  46.85 
 
 
379 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0159423  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1838  radical SAM protein  46.85 
 
 
379 aa  311  9e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.662917 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6265  hypothetical protein  46.85 
 
 
379 aa  311  9e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1814  radical SAM protein  46.85 
 
 
379 aa  311  9e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1336  radical SAM family enzyme  48.3 
 
 
370 aa  310  2e-83  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1397  radical SAM protein  48.3 
 
 
370 aa  310  2e-83  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.724249  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3503  radical SAM protein  46.95 
 
 
382 aa  310  2e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1422  radical SAM protein  46.29 
 
 
382 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12366  normal  0.0354941 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1725  radical SAM protein  46.55 
 
 
379 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.246342 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1461  radical SAM protein  46.85 
 
 
378 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0453987  normal  0.563899 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1752  radical SAM protein  46.55 
 
 
379 aa  309  4e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1999  hypothetical protein  48.06 
 
 
394 aa  309  5e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.175204 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1592  hypothetical protein  46.29 
 
 
383 aa  309  5e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.325288 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2051  radical SAM protein  47.56 
 
 
376 aa  307  1.0000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0429585  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2543  radical SAM enzyme, Cfr family  45.99 
 
 
383 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180565  hitchhiker  0.00648935 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1623  hypothetical protein  46.6 
 
 
362 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00271207 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1421  radical SAM protein  46.71 
 
 
373 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.196113  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1479  hypothetical protein  46.27 
 
 
382 aa  305  5.0000000000000004e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1292  radical SAM protein  46.49 
 
 
402 aa  305  7e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000206153  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1308  hypothetical protein  46.65 
 
 
378 aa  305  7e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14830  hypothetical protein  46.65 
 
 
379 aa  305  9.000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1869  radical SAM protein  47.73 
 
 
382 aa  305  9.000000000000001e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2611  hypothetical protein  47.43 
 
 
382 aa  304  1.0000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00319585  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2887  hypothetical protein  47.22 
 
 
366 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2184  radical SAM enzyme, Cfr family  47.13 
 
 
382 aa  303  2.0000000000000002e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1504  hypothetical protein  46.27 
 
 
382 aa  303  3.0000000000000004e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40320  hypothetical protein  45.73 
 
 
381 aa  302  5.000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.666991  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2379  hypothetical protein  47.24 
 
 
365 aa  302  6.000000000000001e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.444977  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5022  radical SAM protein  45.81 
 
 
397 aa  302  6.000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.380261  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0893  radical SAM protein  45.23 
 
 
381 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000355307 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0850  radical SAM enzyme, Cfr family  45.23 
 
 
381 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4328  radical SAM protein  45.54 
 
 
381 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000000214748 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3393  radical SAM enzyme, Cfr family  46.29 
 
 
382 aa  300  3e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0880  radical SAM protein  45.23 
 
 
381 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.588351  normal  0.297118 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1245  hypothetical protein  45.85 
 
 
382 aa  299  5e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2022  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  45.96 
 
 
371 aa  298  8e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2310  hypothetical protein  46.22 
 
 
382 aa  298  9e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.102281  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0663  radical SAM enzyme, Cfr family  45.61 
 
 
383 aa  298  1e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0103846  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0591  hypothetical protein  45.02 
 
 
372 aa  297  1e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.196855  normal  0.247417 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2871  radical SAM protein  46.11 
 
 
393 aa  297  1e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>