More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_1420 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010830  Aasi_1420  hypothetical protein  100 
 
 
461 aa  948    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.735378 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1209  hypothetical protein  88.91 
 
 
481 aa  860    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000430892 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4063  pyruvate kinase  52.26 
 
 
488 aa  492  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.910781  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3378  pyruvate kinase  51.83 
 
 
479 aa  486  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1400  pyruvate kinase  49.24 
 
 
470 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4190  pyruvate kinase  49.89 
 
 
476 aa  464  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.85429 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0833  pyruvate kinase  47.35 
 
 
479 aa  425  1e-118  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.117468  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2321  pyruvate kinase  43.17 
 
 
496 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.238455  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03130  pyruvate kinase  43.29 
 
 
476 aa  405  1.0000000000000001e-112  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0435027  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1063  pyruvate kinase  42.42 
 
 
488 aa  402  1e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.175798  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1141  pyruvate kinase  42.33 
 
 
477 aa  400  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1796  pyruvate kinase  42.83 
 
 
581 aa  392  1e-108  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3331  pyruvate kinase  42.89 
 
 
480 aa  389  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.616475  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1266  pyruvate kinase  42.95 
 
 
585 aa  391  1e-107  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000010731  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1179  pyruvate kinase  41.96 
 
 
476 aa  387  1e-106  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0098  pyruvate kinase  43.07 
 
 
594 aa  385  1e-106  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4409  pyruvate kinase  46.17 
 
 
480 aa  388  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000010448  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2602  pyruvate kinase  43.76 
 
 
471 aa  385  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.272565  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1694  pyruvate kinase  42.21 
 
 
589 aa  383  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0122  pyruvate kinase  44.18 
 
 
480 aa  384  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000177516  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1613  pyruvate kinase  44.3 
 
 
480 aa  384  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0729902  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2040  pyruvate kinase  42.39 
 
 
582 aa  382  1e-105  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0815  pyruvate kinase  40.6 
 
 
583 aa  382  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417655 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2254  pyruvate kinase  42.67 
 
 
472 aa  381  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2305  pyruvate kinase  42.46 
 
 
472 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.810817 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4428  pyruvate kinase  41.96 
 
 
471 aa  380  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.132665  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1428  pyruvate kinase  42.18 
 
 
478 aa  377  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.262848  hitchhiker  0.00576902 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3211  pyruvate kinase  41.18 
 
 
471 aa  378  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2926  pyruvate kinase  43.32 
 
 
587 aa  375  1e-103  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0381  pyruvate kinase  40 
 
 
578 aa  378  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2208  pyruvate kinase  42.76 
 
 
590 aa  378  1e-103  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1056  pyruvate kinase  43.78 
 
 
585 aa  374  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00524039  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09671  pyruvate kinase  40.69 
 
 
485 aa  372  1e-102  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.290889  normal  0.0962448 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3093  pyruvate kinase  42.08 
 
 
481 aa  373  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2354  pyruvate kinase  41.72 
 
 
476 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0295  pyruvate kinase  40.69 
 
 
485 aa  371  1e-101  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0312  pyruvate kinase  43.78 
 
 
474 aa  370  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.838542  normal  0.668363 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03220  pyruvate kinase  41.08 
 
 
584 aa  372  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000682258  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0005  pyruvate kinase  39.65 
 
 
482 aa  365  1e-100  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0168768  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1693  pyruvate kinase  40.43 
 
 
496 aa  367  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.119526  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1692  pyruvate kinase  42.18 
 
 
479 aa  367  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309469  unclonable  0.00000000134054 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3905  pyruvate kinase  42.37 
 
 
600 aa  365  1e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.252836 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3162  pyruvate kinase  41 
 
 
477 aa  364  1e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0597738  normal  0.419031 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3440  pyruvate kinase  41.72 
 
 
601 aa  364  2e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.386221 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1182  pyruvate kinase  41 
 
 
481 aa  363  5.0000000000000005e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4234  pyruvate kinase  42.12 
 
 
489 aa  362  6e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2953  Pyruvate kinase  40.65 
 
 
476 aa  362  9e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4390  pyruvate kinase  41.9 
 
 
489 aa  362  1e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.474716  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1505  pyruvate kinase  40.34 
 
 
478 aa  361  1e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.33251  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1688  pyruvate kinase  40.43 
 
 
496 aa  361  2e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000849836 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4367  pyruvate kinase  41.68 
 
 
489 aa  360  2e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.569542  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3042  pyruvate kinase  39.48 
 
 
472 aa  360  2e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.139243  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3101  pyruvate kinase  39.48 
 
 
472 aa  360  2e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.509766  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3058  pyruvate kinase  39.48 
 
 
472 aa  360  2e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.947696  normal  0.788477 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2983  pyruvate kinase  41.04 
 
 
483 aa  360  3e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2940  pyruvate kinase  39.83 
 
 
477 aa  359  6e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.324729  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0913  pyruvate kinase  40.43 
 
 
477 aa  358  8e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00173367  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3524  pyruvate kinase  42.3 
 
 
592 aa  358  8e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2582  pyruvate kinase  42.3 
 
 
592 aa  358  8e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2862  pyruvate kinase  39.39 
 
 
476 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222457  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2755  pyruvate kinase  39.91 
 
 
577 aa  356  5e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000113903  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1195  pyruvate kinase., pyruvate, water dikinase  40.13 
 
 
583 aa  356  5.999999999999999e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000647409  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5687  pyruvate kinase  39.7 
 
 
474 aa  355  6.999999999999999e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0177756  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3160  pyruvate kinase  39.57 
 
 
482 aa  355  6.999999999999999e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0251321 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11633  pyruvate kinase  39.26 
 
 
472 aa  355  6.999999999999999e-97  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.104788 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1867  pyruvate kinase  39.57 
 
 
582 aa  355  8.999999999999999e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1461  pyruvate kinase  39.57 
 
 
474 aa  355  1e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.566125  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1980  pyruvate kinase  39.57 
 
 
478 aa  355  1e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.237893  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0004  pyruvate kinase  39.35 
 
 
474 aa  354  2e-96  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00236484  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2685  pyruvate kinase  39.35 
 
 
588 aa  354  2e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000142008  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1221  pyruvate kinase  38.39 
 
 
472 aa  353  2.9999999999999997e-96  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.724591  normal  0.678636 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0004  pyruvate kinase  39.35 
 
 
474 aa  353  4e-96  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.328541  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2490  pyruvate kinase  39.39 
 
 
476 aa  353  5e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24770  pyruvate kinase  38.1 
 
 
474 aa  353  5e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4383  pyruvate kinase  41.04 
 
 
491 aa  352  5.9999999999999994e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.116424 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4669  pyruvate kinase  40.78 
 
 
509 aa  352  5.9999999999999994e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.725037  normal  0.411009 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15431  pyruvate kinase  41.56 
 
 
605 aa  352  5.9999999999999994e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.284197 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3385  pyruvate kinase  39 
 
 
482 aa  352  8.999999999999999e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.468525  normal  0.558043 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0778  pyruvate kinase  39.52 
 
 
587 aa  351  1e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0494  pyruvate kinase  38.13 
 
 
476 aa  351  2e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.109734 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3804  pyruvate kinase  39.35 
 
 
476 aa  350  2e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00347272 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2824  pyruvate kinase  38.61 
 
 
472 aa  350  2e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0888  pyruvate kinase  40.35 
 
 
597 aa  350  3e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.918446  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1701  pyruvate kinase  38.53 
 
 
478 aa  350  3e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1063  pyruvate kinase  40.26 
 
 
483 aa  348  1e-94  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0550  pyruvate kinase  38.26 
 
 
580 aa  348  1e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0357286  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1788  pyruvate kinase  39.27 
 
 
585 aa  348  2e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1754  pyruvate kinase  39.27 
 
 
585 aa  348  2e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.723076  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09951  pyruvate kinase  41 
 
 
596 aa  347  2e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0833  pyruvate kinase  38.73 
 
 
582 aa  347  3e-94  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.964411  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2569  pyruvate kinase  38.83 
 
 
580 aa  346  4e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0396442  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3591  pyruvate kinase  39.05 
 
 
472 aa  346  4e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.802913  normal  0.0255261 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08471  pyruvate kinase  40.82 
 
 
580 aa  346  5e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.892496  hitchhiker  0.00279179 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2352  pyruvate kinase  40 
 
 
472 aa  346  6e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.401076  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3070  pyruvate kinase  37.72 
 
 
472 aa  345  7e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000899763  hitchhiker  0.00558917 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0178  pyruvate kinase  38.26 
 
 
474 aa  345  1e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1436  pyruvate kinase  40.13 
 
 
494 aa  344  2e-93  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.952527  normal  0.144303 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3452  pyruvate kinase  39.57 
 
 
488 aa  344  2e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.824418  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09471  pyruvate kinase  39.7 
 
 
596 aa  344  2e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3295  pyruvate kinase  38.91 
 
 
487 aa  343  4e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101413  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>