More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_1319 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1629  ribonuclease R  50.07 
 
 		 709 aa  664    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.290975 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1319  hypothetical protein  100 
 
 		 718 aa  1480    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.815351 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0462  exoribonuclease II  47.08 
 
 		 750 aa  675    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3715  ribonuclease R  48.12 
 
 		 795 aa  624  1e-177  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.713746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5873  ribonuclease R  43.3 
 
 		 825 aa  609  1e-173  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0830  ribonuclease R  43.57 
 
 		 742 aa  583  1.0000000000000001e-165  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03430  putative exoribonuclease  42.27 
 
 		 735 aa  580  1e-164  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1017  ribonuclease R  42.96 
 
 		 726 aa  575  1.0000000000000001e-163  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1721  ribonuclease R  43.96 
 
 		 702 aa  569  1e-161  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3671  ribonuclease R  43.74 
 
 		 705 aa  542  1e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0988555  normal  0.127593 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1200  ribonuclease R  42.33 
 
 		 751 aa  505  1e-141  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2247  ribonuclease R  37.17 
 
 		 788 aa  460  9.999999999999999e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.165281  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15730  ribonuclease R  36.38 
 
 		 706 aa  456  1e-127  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000333488  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0521  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  40.59 
 
 		 762 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00138071  normal  0.147067 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0752  ribonuclease R  39.38 
 
 		 794 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2955  ribonuclease R  37.2 
 
 		 762 aa  443  1e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000417995  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1962  ribonuclease R  38.07 
 
 		 791 aa  443  1e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197804  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3125  ribonuclease R  37.31 
 
 		 758 aa  442  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2108  ribonuclease R  37.05 
 
 		 716 aa  438  1e-121  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0218671  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0668  ribonuclease R  38.89 
 
 		 795 aa  437  1e-121  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000570881  normal  0.0119217 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1502  ribonuclease R  36.89 
 
 		 751 aa  437  1e-121  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.211368  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0450  VacB/RNase II family exoribonuclease  36.65 
 
 		 792 aa  434  1e-120  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0747  ribonuclease R  38.87 
 
 		 903 aa  436  1e-120  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.197271  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1292  ribonuclease R  36.75 
 
 		 751 aa  434  1e-120  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000149292  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0805  ribonuclease R  39.4 
 
 		 790 aa  431  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.127645  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2866  ribonuclease R  38.93 
 
 		 716 aa  431  1e-119  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0172601  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1911  ribonuclease R  38 
 
 		 770 aa  432  1e-119  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0765  ribonuclease R  38.24 
 
 		 795 aa  432  1e-119  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.429506  normal  0.51814 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0329  ribonuclease R  36.06 
 
 		 706 aa  431  1e-119  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00226264  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0821  ribonuclease R  39.4 
 
 		 790 aa  431  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5232  ribonuclease R  36.13 
 
 		 806 aa  427  1e-118  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5214  ribonuclease R  36.13 
 
 		 806 aa  427  1e-118  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.69895 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4956  ribonuclease R  35.99 
 
 		 808 aa  427  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.744879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4808  ribonuclease R (RNase R)  35.99 
 
 		 804 aa  427  1e-118  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000493308  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4818  ribonuclease R (RNase R)  36.13 
 
 		 810 aa  427  1e-118  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.174115  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5334  ribonuclease R  35.99 
 
 		 808 aa  427  1e-118  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000223572  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5709  ribonuclease R  36.22 
 
 		 812 aa  426  1e-118  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0120471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0482  ribonuclease R  37.59 
 
 		 791 aa  426  1e-118  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5243  ribonuclease R  35.99 
 
 		 808 aa  426  1e-118  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5278  ribonuclease R  36.13 
 
 		 806 aa  429  1e-118  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000124073  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4921  ribonuclease R  36.64 
 
 		 814 aa  428  1e-118  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.411267  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0146  ribonuclease R  37.1 
 
 		 757 aa  424  1e-117  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.234188  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1485  ribonuclease R, putative  36.2 
 
 		 763 aa  424  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36573  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0210  ribonuclease R  36.66 
 
 		 715 aa  421  1e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0123436  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1386  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II:ribonuclease R  37.65 
 
 		 759 aa  421  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000570433  normal  0.26711 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2010  ribonuclease R  37.05 
 
 		 709 aa  422  1e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000115062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3673  ribonuclease R  35.66 
 
 		 792 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0298135  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1243  ribonuclease R  35.67 
 
 		 752 aa  415  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0149067  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0205  ribonuclease R  36.19 
 
 		 710 aa  413  1e-114  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0207  ribonuclease R  36.05 
 
 		 710 aa  412  1e-113  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2699  ribonuclease R  34.97 
 
 		 763 aa  409  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0320356  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1976  ribonuclease R  35.48 
 
 		 755 aa  403  1e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0181  ribonuclease R  36.26 
 
 		 766 aa  399  9.999999999999999e-111  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.129563  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0273  ribonuclease R  35.68 
 
 		 770 aa  399  1e-109  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.112412  normal  0.673615 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3378  ribonuclease R  35.81 
 
 		 1055 aa  397  1e-109  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2152  exoribonuclease RNase R  34.32 
 
 		 720 aa  393  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1015  exoribonuclease R  35.2 
 
 		 810 aa  390  1e-107  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2219  ribonuclease R  34.63 
 
 		 863 aa  384  1e-105  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.892711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1581  ribonuclease R  36.92 
 
 		 813 aa  384  1e-105  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.917433  normal  0.242875 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1353  ribonuclease R  35.68 
 
 		 722 aa  385  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00219332  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1490  ribonuclease R  33.09 
 
 		 818 aa  381  1e-104  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2601  ribonuclease R  36.27 
 
 		 737 aa  381  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0821887  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1172  ribonuclease R  33.52 
 
 		 777 aa  382  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000369652  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0106  hypothetical protein  33.87 
 
 		 726 aa  378  1e-103  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0091  hypothetical protein  33.43 
 
 		 726 aa  377  1e-103  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2972  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II:ribonuclease R  34.07 
 
 		 805 aa  377  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0608  RNAse R  34.79 
 
 		 758 aa  377  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.189937 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1192  ribonuclease R  33.14 
 
 		 749 aa  377  1e-103  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1232  ribonuclease R  33.14 
 
 		 736 aa  377  1e-103  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2897  ribonuclease R  32.95 
 
 		 722 aa  374  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1625  ribonuclease R  35.65 
 
 		 737 aa  375  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0770  ribonuclease R  34 
 
 		 708 aa  373  1e-102  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.246847  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2388  ribonuclease R  31.82 
 
 		 815 aa  370  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1482  VacB/Rnb family exoribonuclease  34.07 
 
 		 801 aa  369  1e-100  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0098629  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07620  ribonuclease R  33.08 
 
 		 861 aa  367  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0280  exoribonuclease II  34.43 
 
 		 705 aa  369  1e-100  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000108449  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0351  ribonuclease R  32.47 
 
 		 803 aa  365  2e-99  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0643  RNAse R  31.73 
 
 		 828 aa  365  2e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135735 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4936  ribonuclease R  32.78 
 
 		 857 aa  364  3e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000328048 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1054  RNAse R  31.64 
 
 		 937 aa  364  3e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.947842  normal  0.977325 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1513  ribonuclease R  34.53 
 
 		 704 aa  364  3e-99  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0815616  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0886  ribonuclease R  31.9 
 
 		 801 aa  362  1e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.127406  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3965  ribonuclease R  30.13 
 
 		 827 aa  362  2e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.120955  normal  0.449748 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4880  ribonuclease R  32.49 
 
 		 857 aa  361  3e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3935  ribonuclease R  33.08 
 
 		 808 aa  360  4e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4760  ribonuclease R  32.49 
 
 		 857 aa  360  4e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.334111  normal  0.140366 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04046  exoribonuclease R, RNase R  32.9 
 
 		 813 aa  360  5e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.765624  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04008  hypothetical protein  32.9 
 
 		 813 aa  360  5e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.863156  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5695  exoribonuclease R  32.9 
 
 		 813 aa  360  6e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3814  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  32.95 
 
 		 813 aa  359  8e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4670  ribonuclease R  32.04 
 
 		 859 aa  359  9e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.425963  normal  0.0849008 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5664  exoribonuclease RNase R  31.77 
 
 		 906 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4422  exoribonuclease R  32.9 
 
 		 813 aa  358  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4650  exoribonuclease R  32.9 
 
 		 813 aa  358  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.526461 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3834  exoribonuclease R  32.9 
 
 		 813 aa  358  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000264601 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4738  exoribonuclease R  32.9 
 
 		 813 aa  358  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.604978  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1066  ribonuclease R  33.09 
 
 		 827 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152985  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1522  ribonuclease R  33.09 
 
 		 827 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.351431  normal  0.0857248 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1546  ribonuclease R  33.09 
 
 		 827 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0569328  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0697  RNAse R  32.93 
 
 		 809 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00112836  hitchhiker  0.000328486 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>