More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_1314 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010830  Aasi_1314  hypothetical protein  100 
 
 
226 aa  472  1e-132  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3856  phosphoribosyltransferase  46.9 
 
 
232 aa  209  3e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0877  phosphoribosyltransferase  41.4 
 
 
232 aa  174  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01730  putative amidophosphoribosyl-transferase  38.22 
 
 
226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.398316  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5516  phosphoribosyltransferase  38.67 
 
 
239 aa  171  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0797  amidophosphoribosyltransferase-like protein  42.36 
 
 
206 aa  169  3e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.582256  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1381  phosphoribosyltransferase protein-like protein  36.77 
 
 
229 aa  158  7e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.431166  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3495  amidophosphoribosyltransferase  34.67 
 
 
236 aa  155  4e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.552167 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3693  amidophosphoribosyl-transferase  35.19 
 
 
230 aa  139  4.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.303537 
 
 
-
 
NC_002950  PG0158  competence protein F-related protein  34.5 
 
 
246 aa  138  7.999999999999999e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0200  competence protein  35.62 
 
 
269 aa  134  9e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2240  phosphoribosyltransferase  32.02 
 
 
230 aa  128  9.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0336  phosphoribosyltransferase  35.65 
 
 
230 aa  124  1e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2183  phosphoribosyltransferase  32.31 
 
 
230 aa  123  2e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000715358  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  35.22 
 
 
229 aa  122  5e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0226  competence protein  32.84 
 
 
236 aa  122  6e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2248  phosphoribosyltransferase  33.04 
 
 
220 aa  121  7e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000079712  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  32.75 
 
 
243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  33.63 
 
 
259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0784  ComF family protein  35.98 
 
 
251 aa  115  6e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0887705  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2371  phosphoribosyltransferase  31.98 
 
 
231 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.115381  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0124  competence protein F, putative  31.36 
 
 
238 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2014  phosphoribosyltransferase  29.39 
 
 
230 aa  110  1.0000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.545639 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0090  phosphoribosyltransferase  30.7 
 
 
220 aa  110  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4125  amidophosphoribosyltransferase-like protein  31.91 
 
 
238 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000102342  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  32.59 
 
 
233 aa  107  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1259  amidophosphoribosyltransferase-like protein  32.88 
 
 
233 aa  107  1e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000170778  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06360  putative phosphoribosyl transferase  33.64 
 
 
241 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00829668  normal  0.955973 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5199  hypothetical protein  33.05 
 
 
243 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0391  phosphoribosyltransferase  35.43 
 
 
243 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.214316 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0938  competence protein ComF, putative  32.43 
 
 
207 aa  107  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.536329 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2252  hypothetical protein  31.2 
 
 
234 aa  106  3e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2971  phosphoribosyltransferase  30.41 
 
 
268 aa  106  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.566762 
 
 
-
 
NC_002936  DET1458  comF family protein, putative  32.74 
 
 
233 aa  106  4e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000115929  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  29.36 
 
 
242 aa  106  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2731  competence protein F, putative  31.33 
 
 
245 aa  105  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000243751  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2280  hypothetical protein  31.2 
 
 
234 aa  105  6e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0143  putative competence protein F  29.54 
 
 
230 aa  105  6e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3090  phosphoribosyltransferase  32.07 
 
 
255 aa  104  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.318018  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0480  phosphoribosyltransferase  29.91 
 
 
270 aa  104  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1405  competence protein F  33.62 
 
 
256 aa  103  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.509153  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0165  phosphoribosyltransferase  32.13 
 
 
223 aa  103  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000298653  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5177  phosphoribosyltransferase  32.71 
 
 
246 aa  103  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.039124  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1875  amidophosphoribosyltransferase-like protein  32.39 
 
 
215 aa  103  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3771  phosphoribosyltransferase  33.79 
 
 
239 aa  103  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3855  phosphoribosyltransferase  31.98 
 
 
239 aa  103  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00709027 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0109  phosphoribosyltransferase  39.58 
 
 
245 aa  102  4e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0864582 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0248  amidophosphoribosyltransferase  28.1 
 
 
245 aa  102  5e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.067407  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1236  ComF  31.86 
 
 
233 aa  101  9e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.105721  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3415  ComF family protein  33.17 
 
 
241 aa  101  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0387  amidophosphoribosyltransferase-like protein  32.7 
 
 
243 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4688  phosphoribosyltransferase  33.02 
 
 
244 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.482553  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2675  competence protein F  30.77 
 
 
253 aa  100  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0592  putative phosphoribosyl transferase  32.71 
 
 
241 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.173105  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1140  phosphoribosyltransferase  31.14 
 
 
264 aa  99.8  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0794906  normal  0.739937 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0385  phosphoribosyltransferase  29.31 
 
 
271 aa  99.8  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.543655  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0617  phosphoribosyltransferase  32.2 
 
 
247 aa  99.4  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4202  phosphoribosyltransferase  37.91 
 
 
213 aa  99.8  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0030984 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0093  competence protein F  31.03 
 
 
230 aa  99  5e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  28.91 
 
 
247 aa  99  5e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1623  phosphoribosyltransferase  32.44 
 
 
227 aa  99  6e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.933338  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2102  competence protein F  31.36 
 
 
246 aa  98.6  7e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0493  competence protein ComF, putative  32.72 
 
 
244 aa  98.2  9e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2284  phosphoribosyltransferase  34.2 
 
 
258 aa  97.4  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0107952 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3970  competence protein F  30.9 
 
 
236 aa  97.4  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4754  phosphoribosyltransferase  32.39 
 
 
276 aa  97.4  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000245098  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7594  putative competence protein F (COMF)  30.97 
 
 
267 aa  97.1  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0419159 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0531  hypothetical protein  31.3 
 
 
217 aa  96.3  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4841  competence protein ComF  32.23 
 
 
245 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.399762  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0548  amidophosphoribosyltransferase  31.3 
 
 
217 aa  96.3  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05970  amidophosphoribosyltransferase  33.17 
 
 
238 aa  96.3  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.096525  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1128  phosphoribosyltransferase  30 
 
 
239 aa  95.9  4e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0361  competence protein ComF, putative  31.28 
 
 
243 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  36.49 
 
 
239 aa  95.5  6e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1736  phosphoribosyltransferase  31.17 
 
 
258 aa  95.1  8e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0317  hypothetical protein  30.87 
 
 
230 aa  94.4  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4174  putative competence protein f-related protein  33.02 
 
 
261 aa  94.4  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3527  competence protein F, putative  30.99 
 
 
244 aa  94.4  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.343371  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0572  ComF family protein  28.84 
 
 
204 aa  93.6  2e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2863  phosphoribosyltransferase  38.46 
 
 
242 aa  93.6  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0383  competence protein F  29.91 
 
 
255 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366991  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0215  putative competence protein F-related protein  44.44 
 
 
240 aa  94  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.162002 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1047  amidophosphoribosyltransferase family protein  34.91 
 
 
221 aa  93.6  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1907  phosphoribosyltransferase  33.97 
 
 
279 aa  93.6  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000754112  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3540  ComF family protein  38.46 
 
 
242 aa  93.6  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4090  amidophosphoribosyltransferase-like protein  31.8 
 
 
246 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1537  putative competence protein F  29.6 
 
 
228 aa  93.2  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0559  phosphoribosyltransferase  34.69 
 
 
248 aa  93.2  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.230828  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0541  phosphoribosyltransferase  34.9 
 
 
269 aa  93.6  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2264  phosphoribosyltransferase  30.46 
 
 
255 aa  93.2  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.200709  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2183  competence protein F  31.51 
 
 
256 aa  92.8  4e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0808644  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0307  competence protein F  30.25 
 
 
255 aa  91.7  7e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0737  phosphoribosyltransferase  28.81 
 
 
246 aa  91.7  8e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113594  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3140  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  29.55 
 
 
296 aa  91.7  8e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.012105  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0541  phosphoribosyltransferase  31.65 
 
 
261 aa  91.7  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.380195  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3532  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  29.29 
 
 
258 aa  91.3  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3081  phosphoribosyltransferase  35.19 
 
 
237 aa  91.3  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000295242  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4231  amidophosphoribosyltransferases-like  31.84 
 
 
240 aa  91.3  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0026  phosphoribosyltransferase  29.13 
 
 
254 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1028  competence protein F, putative  29.18 
 
 
262 aa  90.1  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>