More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_1185 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010830  Aasi_1185  hypothetical protein  100 
 
 
194 aa  401  1e-111  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.130682 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6108  Ribonuclease H  62.83 
 
 
191 aa  251  6e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3847  Ribonuclease H  59.69 
 
 
208 aa  238  4e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.297829  normal  0.541693 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1724  hypothetical protein  62.9 
 
 
196 aa  234  8e-61  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0420025 
 
 
-
 
NC_002950  PG0736  ribonuclease HII  56.08 
 
 
201 aa  229  1e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0404  ribonuclease HII  57.89 
 
 
203 aa  224  6e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.505687 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0747  ribonuclease HII  53.61 
 
 
198 aa  216  2e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2825  RNase HII  54.26 
 
 
202 aa  208  5e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0851  Ribonuclease H  54.87 
 
 
220 aa  206  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05540  putative ribonuclease HII  50.52 
 
 
199 aa  203  1e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.734266  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1923  ribonuclease HII  47.2 
 
 
221 aa  188  2.9999999999999997e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0018  ribonuclease HII  47.67 
 
 
206 aa  178  4e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000692909  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0038  ribonuclease HII  50 
 
 
205 aa  178  5.999999999999999e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  52.81 
 
 
198 aa  176  2e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2102  ribonuclease HII  52.84 
 
 
210 aa  176  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0812  ribonuclease HII  51.37 
 
 
256 aa  173  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000539552  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1166  ribonuclease HII  51.69 
 
 
206 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  52.84 
 
 
277 aa  171  5e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0017  ribonuclease HII  49.22 
 
 
299 aa  169  2e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.851734  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1481  Ribonuclease H  51.67 
 
 
226 aa  167  1e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.581957  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  51.65 
 
 
201 aa  166  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  51.1 
 
 
201 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3310  Ribonuclease H  47.51 
 
 
207 aa  165  2.9999999999999998e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  50.83 
 
 
212 aa  166  2.9999999999999998e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1019  RNase HII  48.3 
 
 
209 aa  165  4e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0388624  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1303  ribonuclease HII  50 
 
 
255 aa  163  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00555633  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1328  ribonuclease HII  50 
 
 
255 aa  163  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.506161  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2650  ribonuclease HII  49.72 
 
 
229 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38850  ribonuclease HII  52.25 
 
 
207 aa  162  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1531  Ribonuclease H  49.16 
 
 
203 aa  162  3e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00536473  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0011  ribonuclease HII  49.73 
 
 
208 aa  160  8.000000000000001e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000000150276  normal  0.177364 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  50.57 
 
 
242 aa  160  8.000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  49.16 
 
 
211 aa  160  9e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0018  ribonuclease HII  46.6 
 
 
207 aa  160  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000987865  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  51.14 
 
 
257 aa  159  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  50 
 
 
208 aa  159  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2020  Ribonuclease H  47.75 
 
 
197 aa  159  2e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.395926  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  48.89 
 
 
206 aa  159  3e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1993  ribonuclease HII  49.18 
 
 
206 aa  158  4e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0765  ribonuclease HII  47.75 
 
 
253 aa  158  4e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.587559  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0721  ribonuclease HII  46.32 
 
 
198 aa  158  5e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  49.43 
 
 
202 aa  157  8e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  48.59 
 
 
203 aa  157  8e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0955  ribonuclease HII  46.59 
 
 
198 aa  157  9e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2022  ribonuclease H  48.59 
 
 
201 aa  156  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3420  Ribonuclease H  45.74 
 
 
198 aa  156  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00118566  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  46.93 
 
 
268 aa  156  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1548  ribonuclease HII  50.55 
 
 
217 aa  156  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0391  ribonuclease H  47.8 
 
 
199 aa  156  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.451839 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0176  ribonuclease HII  45.74 
 
 
198 aa  156  2e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0723713  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0187  ribonuclease HII  45.74 
 
 
198 aa  156  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000269157  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0194  ribonuclease HII  45.74 
 
 
198 aa  156  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00608058  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  49.43 
 
 
257 aa  156  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0185  ribonuclease HII  45.74 
 
 
198 aa  156  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000292767  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0193  ribonuclease HII  45.74 
 
 
198 aa  156  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0271  ribonuclease HII  45.21 
 
 
198 aa  155  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0252  ribonuclease HII  45.21 
 
 
198 aa  155  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.653457 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0268  ribonuclease HII  45.21 
 
 
198 aa  155  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.443462  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0252  ribonuclease HII  45.21 
 
 
198 aa  155  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.553168 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1756  ribonuclease HII  51.09 
 
 
196 aa  155  3e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.384083  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1516  RNase HII  49.45 
 
 
193 aa  155  3e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0256  ribonuclease HII  45.21 
 
 
198 aa  155  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3776  ribonuclease HII  45.55 
 
 
197 aa  155  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0312514  hitchhiker  0.00441554 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00181  ribonuclease HII  45.74 
 
 
198 aa  155  4e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0135226  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3477  ribonuclease HII  45.74 
 
 
198 aa  155  4e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000111932  normal  0.110141 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1027  ribonuclease HII  46.45 
 
 
198 aa  155  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3151  ribonuclease HII  47.16 
 
 
198 aa  155  4e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0033757  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00180  hypothetical protein  45.74 
 
 
198 aa  155  4e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.010735  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3421  ribonuclease HII  46.45 
 
 
198 aa  155  4e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.329934  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1080  ribonuclease HII  46.45 
 
 
198 aa  155  5.0000000000000005e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1357  ribonuclease HII  49.45 
 
 
218 aa  154  8e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2534  ribonuclease H  46.37 
 
 
227 aa  154  9e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1282  ribonuclease HII  45.95 
 
 
225 aa  153  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000227459  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1272  ribonuclease H  46.32 
 
 
207 aa  153  1e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3346  ribonuclease HII  46.63 
 
 
198 aa  153  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.114641  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0278  ribonuclease HII  45.51 
 
 
283 aa  153  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4574  ribonuclease H  49.44 
 
 
202 aa  152  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1115  ribonuclease HII  49.44 
 
 
213 aa  152  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0017  ribonuclease HII  48.62 
 
 
206 aa  153  2e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00136282  unclonable  0.000000928974 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0482  ribonuclease HII  46.45 
 
 
211 aa  152  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0914  ribonuclease HII  46.77 
 
 
250 aa  152  2e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000211389 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  47.51 
 
 
207 aa  152  2.9999999999999998e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0300  ribonuclease HII  46.07 
 
 
283 aa  151  5e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2400  ribonuclease HII  49.71 
 
 
254 aa  151  5e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105442  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2164  ribonuclease HII  46.84 
 
 
203 aa  151  5e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.159466  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1357  ribonuclease HII  46.11 
 
 
211 aa  151  5e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  50.27 
 
 
202 aa  151  5e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  50.27 
 
 
202 aa  151  5e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1324  ribonuclease HII  49.73 
 
 
191 aa  151  5.9999999999999996e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0289  ribonuclease HII  45.51 
 
 
283 aa  151  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.267831  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2962  ribonuclease H  47.28 
 
 
204 aa  151  7e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1327  ribonuclease HII  49.73 
 
 
191 aa  150  8e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4068  ribonuclease HII  49.45 
 
 
207 aa  150  8e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0312759 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1160  ribonuclease HII  49.45 
 
 
207 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.392772  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1568  ribonuclease HII  45.45 
 
 
214 aa  150  1e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0878508  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1850  RNase HII  50.84 
 
 
198 aa  150  1e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.26934  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  48.07 
 
 
198 aa  149  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2966  ribonuclease HII  44.81 
 
 
198 aa  149  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208356  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0302  ribonuclease HII  45.81 
 
 
338 aa  149  3e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0995743  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3752  ribonuclease HII  52.27 
 
 
260 aa  149  4e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719683  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>