109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_1081 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010830  Aasi_1081  hypothetical protein  100 
 
 
102 aa  192  1e-48  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.738335 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2461  hypothetical protein  57.84 
 
 
99 aa  102  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0675  PAAR repeat-containing protein  58.82 
 
 
99 aa  100  5e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3002  PAAR  55.88 
 
 
99 aa  100  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4114  PAAR repeat-containing protein  59.8 
 
 
96 aa  99.8  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.916002  hitchhiker  0.00152888 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3928  PAAR repeat-containing protein  57.58 
 
 
100 aa  98.6  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00719724  normal  0.0225395 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5249  PAAR repeat-containing protein  56.86 
 
 
96 aa  92  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000530651 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3156  PAAR repeat-containing protein  55.1 
 
 
96 aa  89.7  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2373  PAAR repeat-containing protein  56.86 
 
 
96 aa  89.7  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0352022 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2358  PAAR repeat-containing protein  56.12 
 
 
96 aa  86.3  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1664  PAAR repeat-containing protein  54.9 
 
 
96 aa  86.3  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.121011 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3584  PAAR repeat-containing protein  57.47 
 
 
84 aa  86.3  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2816  PAAR repeat-containing protein  54.9 
 
 
96 aa  85.5  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0368  PAAR repeat-containing protein  55.34 
 
 
100 aa  84  7e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1168  putative type VI secretion protein VasV-1, PAAR domain protein  53.54 
 
 
98 aa  83.2  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.173375  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000030  hypothetical protein  48.48 
 
 
96 aa  73.2  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0699  PAAR repeat-containing protein  45.92 
 
 
113 aa  63.9  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1907  PAAR repeat-containing protein  56.16 
 
 
93 aa  63.9  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0142709  hitchhiker  0.000734481 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0335  phosphomethylpyrimidine kinase  47.06 
 
 
466 aa  62  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.135685 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3826  PAAR repeat-containing protein  44.83 
 
 
99 aa  60.1  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6210  RHS protein  41.67 
 
 
1421 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0158165  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3775  helix-turn-helix, AraC type  45.35 
 
 
540 aa  58.5  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3608  PAAR  54.17 
 
 
92 aa  57  0.00000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000736395 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3017  PAAR repeat-containing protein  38.75 
 
 
444 aa  55.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.501568  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1266  YD repeat-containing protein  40.85 
 
 
1381 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2662  PAAR repeat-containing protein  50 
 
 
323 aa  55.1  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4258  PAAR repeat-containing protein  45.35 
 
 
169 aa  54.7  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3426  hypothetical protein  39.51 
 
 
386 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.967185  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2570  YD repeat-containing protein  40.85 
 
 
1541 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3606  PAAR repeat-containing protein  46.51 
 
 
96 aa  54.3  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0238  YD repeat-containing protein  40.85 
 
 
1541 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.691901  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0509  YD repeat-containing protein  40.85 
 
 
1541 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575036  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1403  substrate-binding repeat-containing protein  40.85 
 
 
1541 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1322  substrate-binding repeat-containing protein  40.85 
 
 
1541 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1059  YD repeat-containing protein  40.85 
 
 
1541 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4081  Rhs family protein  42.86 
 
 
1140 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.451767  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4775  PAAR repeat-containing protein  39.25 
 
 
105 aa  53.9  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.110358  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1578  Rhs family protein  43.48 
 
 
1556 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.883586  normal  0.184607 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53640  hypothetical protein  45 
 
 
172 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0232155  hitchhiker  0.000303708 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2560  PAAR repeat-containing protein  41.38 
 
 
174 aa  53.5  0.0000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.801514  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0985  hypothetical protein  49.35 
 
 
98 aa  53.1  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0761318  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  38.96 
 
 
1385 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  38.96 
 
 
1400 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2758  PAAR repeat-containing protein  44 
 
 
406 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.011226  normal  0.594441 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  41.43 
 
 
1386 aa  52  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0650  YD repeat protein  34.07 
 
 
1422 aa  52.4  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.614814  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  38.96 
 
 
1409 aa  52  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1762  S-type Pyocin domain protein  38.74 
 
 
592 aa  51.6  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.842268  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  37.65 
 
 
1446 aa  51.2  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  38.46 
 
 
1379 aa  51.2  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1434  YD repeat-containing protein  39.44 
 
 
1553 aa  50.8  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.16383  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3344  PAAR  37.5 
 
 
1494 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.0030504  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5023  YD repeat-containing protein  37.5 
 
 
1494 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00366927  normal  0.185239 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0373  Rhs family protein  38.96 
 
 
855 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5261  YD repeat-containing protein  37.5 
 
 
1487 aa  50.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.792751 
 
 
-
 
NC_003296  RS05482  putative RHS-related transmembrane protein  38.89 
 
 
1517 aa  50.4  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.489685  normal  0.876645 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0034  hypothetical protein  41.86 
 
 
94 aa  50.4  0.000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.543283  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01140  hypothetical protein  37.08 
 
 
439 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.337487  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0167  PAAR motif-containing protein  37.08 
 
 
434 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4805  YD repeat-containing protein  36.36 
 
 
1229 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.739306  normal  0.809733 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1043  hypothetical protein  46.84 
 
 
92 aa  48.9  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0093  hypothetical protein  40.23 
 
 
481 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1157  PAAR repeat-containing protein  39.47 
 
 
100 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.811725  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4951  YD repeat-containing protein  37.5 
 
 
1495 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.746977 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3237  PAAR repeat-containing protein  40.54 
 
 
456 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0943  hypothetical protein  41.67 
 
 
87 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00127142  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1878  hypothetical protein  41.67 
 
 
87 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0199793  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3827  PAAR repeat-containing protein  41.67 
 
 
87 aa  48.5  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.86819  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5592  PAAR  39 
 
 
469 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2512  PAAR repeat-containing protein  46.15 
 
 
461 aa  48.1  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0685  PAAR  37.76 
 
 
379 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4969  PAAR  39.13 
 
 
102 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3019  hypothetical protein  37.23 
 
 
84 aa  47.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.746993 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3806  PAAR  40.4 
 
 
165 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.159045 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0240  PAAR repeat-containing protein  41.98 
 
 
113 aa  47.8  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5383  PAAR repeat-containing protein  47.95 
 
 
93 aa  47.4  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5430  hypothetical protein  46.88 
 
 
174 aa  47  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0945  hypothetical protein  40.7 
 
 
176 aa  47  0.00009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00120455  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4085  RHS family protein, putative  45.61 
 
 
1530 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  0.0133781 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2253  PAAR repeat-containing protein  38.1 
 
 
105 aa  46.2  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.175584  hitchhiker  0.000480373 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0895  hypothetical protein  46.58 
 
 
89 aa  45.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.457574 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1039  PAAR  46.58 
 
 
89 aa  45.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0341  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  34.25 
 
 
1527 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1609  YD repeat protein  35.53 
 
 
1447 aa  46.2  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3756  hypothetical protein  36.73 
 
 
386 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.136459  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2551  PAAR repeat-containing protein  48.57 
 
 
89 aa  45.4  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2824  PAAR repeat-containing protein  39.64 
 
 
456 aa  45.4  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1680  PAAR repeat-containing protein  48.57 
 
 
89 aa  45.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0056  PAAR repeat-containing protein  36.76 
 
 
88 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  37.18 
 
 
1411 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1832  hypothetical protein  39.19 
 
 
118 aa  43.5  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.643007 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2694  YD repeat protein  34.21 
 
 
1428 aa  43.5  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00194911  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6683  PAAR repeat-containing protein  37.8 
 
 
88 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2373  hypothetical protein  44.64 
 
 
94 aa  43.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0420  YD repeat protein  33.78 
 
 
1475 aa  43.5  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1160  YD repeat protein  34.21 
 
 
1423 aa  43.5  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00301652  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1504  YD repeat protein  33.78 
 
 
1457 aa  43.5  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3692  RHS/YD repeat-containing protein  32.47 
 
 
1419 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333413  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0051  YD repeat protein  31.87 
 
 
1437 aa  42.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4045  hypothetical protein  30 
 
 
88 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>