More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_0929 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02463  GTP-binding protein LepA  54.79 
 
 
599 aa  664    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.412386  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1099  GTP-binding protein LepA  54.79 
 
 
599 aa  664    Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000732833  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0334  GTP-binding protein LepA  54.44 
 
 
602 aa  666    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.257548  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1266  GTP-binding protein LepA  58.53 
 
 
600 aa  742    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00508967  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1431  GTP-binding protein LepA  52.85 
 
 
599 aa  672    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1241  GTP-binding protein LepA  68.74 
 
 
595 aa  861    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1893  GTP-binding protein LepA  56.49 
 
 
601 aa  720    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000413124  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1152  GTP-binding protein LepA  55.97 
 
 
607 aa  706    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.667226  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1466  GTP-binding protein LepA  54.64 
 
 
601 aa  668    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1060  GTP-binding protein LepA  54.94 
 
 
598 aa  669    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.203517  normal  0.568837 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4400  GTP-binding protein LepA  58.18 
 
 
607 aa  744    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.751687  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4124  GTP-binding protein LepA  54.53 
 
 
596 aa  668    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1174  GTP-binding protein LepA  53.69 
 
 
598 aa  667    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0906  GTP-binding protein LepA  58.49 
 
 
610 aa  749    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.310817  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1039  GTP-binding protein LepA  53.69 
 
 
602 aa  674    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1346  GTP-binding protein LepA  54.45 
 
 
596 aa  683    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4220  GTP-binding protein LepA  53.86 
 
 
595 aa  689    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.438138  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4218  GTP-binding protein LepA  58.18 
 
 
607 aa  744    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00198782  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4056  GTP-binding protein LepA  58.18 
 
 
607 aa  745    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000612977  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4066  GTP-binding protein LepA  58.18 
 
 
607 aa  745    Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0084757  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0541  GTP-binding protein LepA  54.87 
 
 
597 aa  678    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.270144  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1837  GTP-binding protein LepA  53.52 
 
 
610 aa  692    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1834  GTP-binding protein LepA  53.36 
 
 
610 aa  691    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3954  GTP-binding protein LepA  53.19 
 
 
598 aa  680    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0330  GTP-binding protein LepA  52.68 
 
 
598 aa  666    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2026  GTP-binding protein LepA  56.04 
 
 
596 aa  687    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.788972  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0829  GTP-binding protein LepA  57 
 
 
614 aa  725    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1754  GTP-binding protein LepA  56.64 
 
 
603 aa  694    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.570485  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2255  GTP-binding protein LepA  53.52 
 
 
597 aa  679    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.357862  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2089  GTP-binding protein LepA  55.33 
 
 
599 aa  673    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0343  GTP-binding protein LepA  52.68 
 
 
603 aa  668    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.697436  normal  0.31273 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0440  GTP-binding protein LepA  58.01 
 
 
603 aa  715    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.239909  normal  0.261131 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2897  GTP-binding protein LepA  54.87 
 
 
597 aa  678    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2461  GTP-binding protein LepA  53.95 
 
 
606 aa  684    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0992  GTP-binding protein LepA  53.19 
 
 
598 aa  679    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.376719  normal  0.284155 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2088  GTP-binding protein LepA  54.64 
 
 
599 aa  689    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1618  GTP-binding protein LepA  56.49 
 
 
599 aa  719    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000183904  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4244  GTP-binding protein LepA  54.36 
 
 
597 aa  692    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1471  GTP-binding protein LepA  61.31 
 
 
605 aa  779    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.472946  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1582  GTP-binding protein LepA  55.8 
 
 
602 aa  680    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.314683  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0490  GTP-binding protein LepA  61.11 
 
 
605 aa  771    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0799  GTP-binding protein LepA  57.31 
 
 
606 aa  699    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.274116  normal  0.0311101 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1766  GTP-binding protein LepA  58.36 
 
 
629 aa  744    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000017953  normal  0.0160194 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2817  GTP-binding protein LepA  56.06 
 
 
601 aa  711    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4544  GTP-binding protein LepA  58.35 
 
 
607 aa  744    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0416  GTP-binding protein LepA  54.62 
 
 
602 aa  678    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.879299  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0479  GTP-binding protein LepA  57.38 
 
 
604 aa  711    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1751  GTP-binding protein LepA  56.47 
 
 
597 aa  714    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.951642  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0581  GTP-binding protein LepA  60.03 
 
 
602 aa  773    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.810707  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1728  GTP-binding protein LepA  54.53 
 
 
597 aa  674    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1614  GTP-binding protein LepA  57.58 
 
 
601 aa  734    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1262  GTP-binding protein LepA  54.97 
 
 
682 aa  695    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0559574 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3431  GTP-binding protein LepA  53.36 
 
 
599 aa  685    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116192  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1740  GTP-binding protein LepA  53.57 
 
 
603 aa  669    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0723803  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2246  GTP-binding protein LepA  55.37 
 
 
599 aa  687    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0193182 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0860  GTP-binding protein LepA  55.03 
 
 
597 aa  691    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0198649 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1004  GTP-binding protein LepA  55.03 
 
 
597 aa  691    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.29213  normal  0.0141271 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3638  GTP-binding protein LepA  54.56 
 
 
603 aa  672    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0492611  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1083  GTP-binding protein LepA  55.03 
 
 
597 aa  701    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.632342  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2768  GTP-binding protein LepA  55.29 
 
 
596 aa  687    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000363833  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0364  GTP-binding protein LepA  52.68 
 
 
598 aa  665    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0832209 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2421  GTP-binding protein LepA  53.69 
 
 
597 aa  680    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.417593  normal  0.344469 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0244  GTP-binding protein LepA  58.25 
 
 
601 aa  723    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.471518  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0678  GTP-binding protein LepA  53.86 
 
 
599 aa  695    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0691872 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0652  GTP-binding protein LepA  53.86 
 
 
597 aa  672    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3493  GTP-binding protein LepA  53.29 
 
 
639 aa  686    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.105385  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1516  GTP-binding protein LepA  54.47 
 
 
600 aa  667    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3151  GTP-binding protein LepA  54.38 
 
 
598 aa  667    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000523336  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4075  GTP-binding protein LepA  54.03 
 
 
605 aa  686    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1717  GTP-binding protein LepA  76.01 
 
 
596 aa  946    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000391378  normal  0.794394 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2295  GTP-binding protein LepA  56.88 
 
 
600 aa  700    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2010  GTP-binding protein LepA  57.05 
 
 
600 aa  700    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1242  GTP-binding protein LepA  53.95 
 
 
598 aa  666    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2425  GTP-binding protein LepA  56.38 
 
 
601 aa  700    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.21881 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2850  GTP-binding protein LepA  54.12 
 
 
596 aa  680    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000704584  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2932  GTP-binding protein LepA  54.12 
 
 
596 aa  680    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000771458  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1344  GTP-binding protein LepA  54.19 
 
 
627 aa  692    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.269651  normal  0.813727 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2931  GTP-binding protein LepA  54.79 
 
 
596 aa  683    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0135754  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1583  GTP-binding protein LepA  56.3 
 
 
599 aa  705    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0013667  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0148  GTP-binding protein LepA  54.03 
 
 
608 aa  681    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1008  GTP-binding protein LepA  54.03 
 
 
597 aa  674    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54370  GTP-binding protein LepA  54.87 
 
 
599 aa  692    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1210  GTP-binding protein LepA  58.15 
 
 
607 aa  740    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0824  GTP-binding protein LepA  52.19 
 
 
612 aa  672    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1191  GTP-binding protein LepA  54.62 
 
 
620 aa  693    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.859695  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0932  GTP-binding protein LepA  57.98 
 
 
610 aa  744    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0636523  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2240  GTP-binding protein LepA  54.33 
 
 
617 aa  692    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.191927  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1132  GTP-binding protein LepA  53.86 
 
 
597 aa  672    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1361  GTP-binding protein LepA  55.87 
 
 
598 aa  686    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.194273  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0905  GTP-binding protein LepA  55.87 
 
 
598 aa  716    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.446358  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3028  GTP-binding protein LepA  53.95 
 
 
596 aa  678    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000110121  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0778  GTP-binding protein LepA  55.35 
 
 
606 aa  701    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0607569  normal  0.011752 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2331  GTP-binding protein LepA  56.21 
 
 
598 aa  715    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000282409  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1859  GTP-binding protein LepA  61.14 
 
 
605 aa  771    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.365032  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4417  GTP-binding protein LepA  53.46 
 
 
614 aa  676    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.558912  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1891  GTP-binding protein LepA  56.28 
 
 
635 aa  716    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.647784  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3556  GTP-binding protein LepA  53.29 
 
 
639 aa  686    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.984313 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3881  GTP-binding protein LepA  53.96 
 
 
652 aa  693    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.288489 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2248  GTP-binding protein LepA  53.85 
 
 
600 aa  664    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2261  GTP-binding protein LepA  57.41 
 
 
607 aa  722    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>