More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_0912 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010830  Aasi_0912  hypothetical protein  100 
 
 
640 aa  1316    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.121689 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3370  DNA primase  44.81 
 
 
674 aa  575  1.0000000000000001e-162  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0927  DNA primase  43.32 
 
 
653 aa  564  1.0000000000000001e-159  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.584516  normal  0.012532 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5973  DNA primase  43.79 
 
 
703 aa  545  1e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.328857 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0276  DNA primase  43.03 
 
 
660 aa  543  1e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121752  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6451  DNA primase  39.22 
 
 
662 aa  477  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.6099  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1814  DNA primase  41.29 
 
 
673 aa  454  1.0000000000000001e-126  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0910  DNA primase  43.15 
 
 
656 aa  449  1e-125  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1790  DNA primase  36.18 
 
 
704 aa  448  1.0000000000000001e-124  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06600  putative DNA primase  38.46 
 
 
657 aa  427  1e-118  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  38.36 
 
 
619 aa  414  1e-114  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  39.44 
 
 
599 aa  323  7e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  35.88 
 
 
595 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1964  DNA primase  32.28 
 
 
632 aa  306  6e-82  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.985881  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  38.81 
 
 
601 aa  306  6e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0548  DNA primase  31.84 
 
 
660 aa  306  8.000000000000001e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00859761  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1589  DNA primase  31.9 
 
 
633 aa  300  4e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.567407  normal  0.0206676 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  37.35 
 
 
613 aa  298  1e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  36.67 
 
 
588 aa  296  6e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  36.9 
 
 
587 aa  295  2e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0586  DNA primase  37.94 
 
 
632 aa  295  2e-78  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.284459  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1128  DNA primase  35.55 
 
 
598 aa  294  3e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0012752  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  36.34 
 
 
587 aa  292  1e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  37.04 
 
 
598 aa  292  1e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  37.04 
 
 
598 aa  292  1e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  36.83 
 
 
600 aa  292  1e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  37.04 
 
 
598 aa  291  2e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  37.04 
 
 
598 aa  291  2e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  37.04 
 
 
598 aa  291  2e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  37.04 
 
 
598 aa  291  2e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  37.04 
 
 
598 aa  291  3e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  37.04 
 
 
571 aa  291  4e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  37.74 
 
 
598 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  37.19 
 
 
600 aa  289  1e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  36.81 
 
 
598 aa  288  2e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  35.92 
 
 
626 aa  288  2e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  34.03 
 
 
583 aa  288  2e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  34.35 
 
 
582 aa  288  2e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  34.42 
 
 
588 aa  286  5.999999999999999e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1620  DNA primase  35.56 
 
 
605 aa  284  4.0000000000000003e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0393306  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  37.26 
 
 
598 aa  284  4.0000000000000003e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2265  DNA primase  36.94 
 
 
595 aa  284  4.0000000000000003e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0225159  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1654  DNA primase  35.56 
 
 
605 aa  284  4.0000000000000003e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000285307  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2679  DNA primase  36.26 
 
 
604 aa  283  5.000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0602  DNA primase  31.11 
 
 
636 aa  283  5.000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  38.5 
 
 
664 aa  283  8.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  38.35 
 
 
663 aa  282  1e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1105  DNA primase  38.55 
 
 
574 aa  281  3e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000782839  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2995  DNA primase  38.26 
 
 
575 aa  280  5e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0193814  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2053  DNA primase  38.4 
 
 
576 aa  279  9e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.399908  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0326  DNA primase  36.83 
 
 
539 aa  279  1e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3168  DNA primase  38.55 
 
 
574 aa  278  2e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00053583  normal  0.343709 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  39.19 
 
 
655 aa  278  2e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1222  DNA primase  38.55 
 
 
574 aa  278  2e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0573251  normal  0.615941 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1976  DNA primase  36.26 
 
 
595 aa  278  2e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00122543  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0728  DNA primase  31.9 
 
 
631 aa  278  3e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  38.07 
 
 
638 aa  277  3e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1189  DNA primase  38.31 
 
 
574 aa  278  3e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0497692  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0997  DNA primase  38.16 
 
 
601 aa  277  4e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.941593  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2907  DNA primase  38.24 
 
 
574 aa  276  6e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000550507  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1145  DNA primase  38.31 
 
 
574 aa  276  7e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000553498  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  38.61 
 
 
660 aa  276  8e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  38.61 
 
 
660 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1286  DNA primase  38.24 
 
 
574 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2989  DNA primase  38.24 
 
 
574 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00884135  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3086  DNA primase  38.24 
 
 
574 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000597352  hitchhiker  0.000480435 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  38.89 
 
 
660 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3785  DNA primase  37.59 
 
 
646 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3836  DNA primase  37.59 
 
 
646 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0564656  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1154  DNA primase  36.5 
 
 
575 aa  274  4.0000000000000004e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000263916  normal  0.0506591 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4299  DNA primase  37.65 
 
 
582 aa  274  4.0000000000000004e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136989  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  36.6 
 
 
584 aa  273  5.000000000000001e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  39.84 
 
 
660 aa  273  6e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1369  DNA primase  39.78 
 
 
572 aa  273  6e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0240791  normal  0.628544 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1073  DNA primase  35.84 
 
 
573 aa  273  8.000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.096623  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  38.61 
 
 
652 aa  272  1e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  35.75 
 
 
605 aa  272  1e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3522  DNA primase  37.04 
 
 
596 aa  272  1e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.884792  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  38.5 
 
 
651 aa  272  2e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2833  DNA primase  36.76 
 
 
574 aa  271  2e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0310817  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1508  DNA primase, DNAG  38.38 
 
 
593 aa  271  2e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.083335  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3037  DNA primase  37.38 
 
 
599 aa  271  2.9999999999999997e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.735679 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0540  DNA primase  35.42 
 
 
604 aa  270  4e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398394  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4027  DNA primase  35.04 
 
 
663 aa  270  5e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570104  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0659  DNA primase  40.51 
 
 
583 aa  270  5e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.250836  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0717  DNA primase  39.44 
 
 
656 aa  270  5.9999999999999995e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.261682  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1727  DNA primase  37.19 
 
 
611 aa  270  7e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1783  DNA primase  35.29 
 
 
553 aa  268  2e-70  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.461465  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0631  DNA primase  36.95 
 
 
630 aa  268  2e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1895  DNA primase  37.53 
 
 
573 aa  268  2e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.158344  normal  0.0137969 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0554  DNA primase  38.2 
 
 
582 aa  268  2.9999999999999995e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000322663  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3369  DNA primase  36.52 
 
 
584 aa  268  2.9999999999999995e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000957959  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0044  DNA primase  36.6 
 
 
574 aa  267  2.9999999999999995e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.723286  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2458  DNA primase  40.62 
 
 
567 aa  268  2.9999999999999995e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00693823  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0635  DNA primase  38.2 
 
 
582 aa  268  2.9999999999999995e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000955759  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0302  DNA primase  38.2 
 
 
582 aa  268  2.9999999999999995e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000195537  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0784  DNA primase  37.38 
 
 
584 aa  267  4e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00105379  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0394  DNA primase  35.06 
 
 
572 aa  267  5e-70  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2517  DNA primase  33.01 
 
 
617 aa  266  5.999999999999999e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.986794  normal  0.570872 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3488  DNA primase  38.81 
 
 
584 aa  266  1e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00314359  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>