More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_0805 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010830  Aasi_0805  hypothetical protein  100 
 
 
258 aa  532  1e-150  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.15567 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0127  diaminopimelate epimerase  49.05 
 
 
261 aa  254  7e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1455  diaminopimelate epimerase  50 
 
 
257 aa  249  3e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0568169  normal  0.427819 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5091  diaminopimelate epimerase  46.18 
 
 
259 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000000217016  normal  0.274183 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12773  Diaminopimelate epimerase  48.09 
 
 
261 aa  241  1e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0208  diaminopimelate epimerase  46.59 
 
 
261 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0882102 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0018  diaminopimelate epimerase  46.18 
 
 
260 aa  229  3e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4694  diaminopimelate epimerase  48.09 
 
 
261 aa  226  2e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.483748  normal  0.0110449 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1614  diaminopimelate epimerase  45.17 
 
 
264 aa  216  2.9999999999999998e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0342  diaminopimelate epimerase  44.94 
 
 
270 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00240422  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0057  diaminopimelate epimerase  37.5 
 
 
287 aa  170  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.809521 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1977  diaminopimelate epimerase  38.58 
 
 
268 aa  170  3e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00347642  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0218  diaminopimelate epimerase  39.34 
 
 
266 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0044  Diaminopimelate epimerase  38.18 
 
 
274 aa  162  4.0000000000000004e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.315608 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2694  diaminopimelate epimerase  38.01 
 
 
268 aa  161  9e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000359695  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0181  diaminopimelate epimerase  39.48 
 
 
272 aa  159  4e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00086691  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0273  diaminopimelate epimerase  39.18 
 
 
264 aa  155  5.0000000000000005e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000651876  decreased coverage  0.0000261892 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0304  diaminopimelate epimerase  38.61 
 
 
256 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.684099  hitchhiker  0.00244199 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0259  diaminopimelate epimerase  36.2 
 
 
277 aa  149  4e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0755  diaminopimelate epimerase  33.33 
 
 
292 aa  148  8e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.277533  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2316  diaminopimelate epimerase  35.97 
 
 
274 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0560  diaminopimelate epimerase  37.09 
 
 
274 aa  143  3e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00795649 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1516  diaminopimelate epimerase  39.42 
 
 
249 aa  142  4e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1702  diaminopimelate epimerase  39.66 
 
 
249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2431  diaminopimelate epimerase  34.98 
 
 
275 aa  140  3e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.410157  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1883  diaminopimelate epimerase  39.22 
 
 
249 aa  139  4.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1165  diaminopimelate epimerase  35.53 
 
 
277 aa  138  8.999999999999999e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1873  diaminopimelate epimerase  34.59 
 
 
281 aa  137  1e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00642624 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0648  diaminopimelate epimerase  38.43 
 
 
279 aa  135  5e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.312023  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0454  diaminopimelate epimerase  37.91 
 
 
279 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.691704  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2160  diaminopimelate epimerase  35.31 
 
 
272 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1297  diaminopimelate epimerase  34.16 
 
 
282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0270469  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1798  diaminopimelate epimerase  35.29 
 
 
283 aa  130  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000300974  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34582  predicted protein  32 
 
 
334 aa  129  3e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1694  diaminopimelate epimerase  32.99 
 
 
284 aa  125  7e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0561  diaminopimelate epimerase  34.69 
 
 
282 aa  124  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00183817 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1764  diaminopimelate epimerase  34.05 
 
 
269 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2322  diaminopimelate epimerase  31.79 
 
 
277 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000212903  hitchhiker  0.00476007 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3837  diaminopimelate epimerase  29.47 
 
 
277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0489107  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0063  diaminopimelate epimerase  34.85 
 
 
273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3088  diaminopimelate epimerase  31.38 
 
 
282 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.233699  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0153  diaminopimelate epimerase  31.56 
 
 
288 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0039  diaminopimelate epimerase  30.24 
 
 
292 aa  119  6e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0045  Diaminopimelate epimerase  31.01 
 
 
278 aa  119  7e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0072  diaminopimelate epimerase  35.9 
 
 
247 aa  118  7.999999999999999e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1814  diaminopimelate epimerase  32.86 
 
 
272 aa  118  7.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3102  diaminopimelate epimerase  28.9 
 
 
309 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0054  diaminopimelate epimerase  38.32 
 
 
249 aa  117  9.999999999999999e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000506343  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0790  diaminopimelate epimerase  31.93 
 
 
276 aa  117  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0033  diaminopimelate epimerase  29.9 
 
 
292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2989  diaminopimelate epimerase  32.06 
 
 
285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000823328  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1738  diaminopimelate epimerase  30.8 
 
 
277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0164  diaminopimelate epimerase  31.14 
 
 
277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.543882  normal  0.191958 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4373  diaminopimelate epimerase  28.67 
 
 
287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2100  diaminopimelate epimerase  32.5 
 
 
272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.312969  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11570  Diaminopimelate epimerase  30.24 
 
 
284 aa  116  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1015  diaminopimelate epimerase  30.82 
 
 
274 aa  117  3e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2730  diaminopimelate epimerase  30.83 
 
 
268 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0948067  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0724  diaminopimelate epimerase  31.14 
 
 
277 aa  116  5e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0456566  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3131  diaminopimelate epimerase  28.57 
 
 
289 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0077  diaminopimelate epimerase  30.95 
 
 
276 aa  115  8.999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6435  diaminopimelate epimerase  29.55 
 
 
289 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.497527 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0172  diaminopimelate epimerase  27.76 
 
 
289 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3907  Diaminopimelate epimerase  29.96 
 
 
283 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.739136  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1382  diaminopimelate epimerase  34.04 
 
 
279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1927  diaminopimelate epimerase  30.67 
 
 
280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3080  diaminopimelate epimerase  29.33 
 
 
387 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.188461 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2471  diaminopimelate epimerase  28.24 
 
 
309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4074  diaminopimelate epimerase  32.19 
 
 
276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3085  diaminopimelate epimerase  28.24 
 
 
309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1874  diaminopimelate epimerase  36.64 
 
 
232 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2006  diaminopimelate epimerase  29.83 
 
 
284 aa  113  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0322  diaminopimelate epimerase  31.23 
 
 
284 aa  113  3e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.217655  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3587  diaminopimelate epimerase  30.85 
 
 
276 aa  113  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.335636  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2046  diaminopimelate epimerase  34.87 
 
 
257 aa  113  3e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2115  diaminopimelate epimerase  30.85 
 
 
278 aa  113  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0349  diaminopimelate epimerase  28 
 
 
299 aa  112  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0714  diaminopimelate epimerase  35.24 
 
 
269 aa  112  7.000000000000001e-24  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0198  diaminopimelate epimerase  31.16 
 
 
288 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09951  diaminopimelate epimerase  30.88 
 
 
284 aa  111  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.51158 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3113  diaminopimelate epimerase  27.99 
 
 
277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.534786  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0380  diaminopimelate epimerase  29.47 
 
 
281 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0549  diaminopimelate epimerase  30.66 
 
 
280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0192  diaminopimelate epimerase  29.07 
 
 
276 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2377  diaminopimelate epimerase  31.14 
 
 
281 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.63698  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0196  diaminopimelate epimerase  30.1 
 
 
290 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.465069  hitchhiker  0.000651224 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1173  diaminopimelate epimerase  32.99 
 
 
278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  hitchhiker  0.0076294 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15041  diaminopimelate epimerase  29.49 
 
 
323 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.476128 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0495  diaminopimelate epimerase  30.71 
 
 
308 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1418  diaminopimelate epimerase  29.21 
 
 
279 aa  110  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0076  diaminopimelate epimerase  27.67 
 
 
286 aa  109  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08761  diaminopimelate epimerase  29.72 
 
 
284 aa  109  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0472927  hitchhiker  0.000801401 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0197  diaminopimelate epimerase  28.52 
 
 
289 aa  109  5e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.925339  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3435  diaminopimelate epimerase  30.17 
 
 
295 aa  109  6e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2326  diaminopimelate epimerase  30.8 
 
 
281 aa  109  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5143  diaminopimelate epimerase  29.37 
 
 
281 aa  108  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75804e-23 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09701  diaminopimelate epimerase  31.94 
 
 
286 aa  108  6e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0227672  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2994  diaminopimelate epimerase  28.33 
 
 
282 aa  108  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0384566 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1913  Diaminopimelate epimerase  30.39 
 
 
299 aa  108  9.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1604  diaminopimelate epimerase  28.93 
 
 
278 aa  108  9.000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>