143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_0749 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010830  Aasi_0749  hypothetical protein  100 
 
 
271 aa  560  1.0000000000000001e-159  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1962  transcriptional regulator, AraC family  65.04 
 
 
271 aa  368  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.17826 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6750  transcriptional regulator, AraC family  63.91 
 
 
327 aa  367  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1643  transcriptional regulator, AraC family  46.42 
 
 
259 aa  233  2.0000000000000002e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4652  transcriptional regulator, AraC family  24.41 
 
 
272 aa  89.4  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.629583  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3282  transcriptional regulator, AraC family  23.83 
 
 
271 aa  87.4  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0185565 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3242  transcriptional regulator, AraC family  30.05 
 
 
274 aa  87  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0462  helix-turn-helix domain-containing protein  28.86 
 
 
277 aa  79.7  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1479  helix-turn-helix domain-containing protein  29.71 
 
 
299 aa  78.6  0.00000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0993365  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1931  helix-turn-helix, AraC type  29.52 
 
 
274 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1384  transcriptional regulator, AraC family  23.9 
 
 
269 aa  78.2  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.976076 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2715  putative regulatory protein  25.19 
 
 
272 aa  77  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.241271  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1310  transcriptional regulator, AraC family  25.58 
 
 
244 aa  75.1  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.497978 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5387  transcriptional regulator, AraC family  22.81 
 
 
279 aa  74.7  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0433  transcriptional regulator, AraC family  27.57 
 
 
274 aa  73.9  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2016  transcriptional regulator, AraC family  26.05 
 
 
279 aa  72.8  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1886  transcriptional regulator, AraC family  31.21 
 
 
280 aa  72  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.979359  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1190  AraC family transcriptional regulator  23.92 
 
 
271 aa  72  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000541539 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1925  transcriptional regulator  24.69 
 
 
252 aa  70.5  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3305  transcriptional regulator, AraC family  23.32 
 
 
271 aa  70.5  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000908006 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0310  transcriptional regulator, AraC family  27.03 
 
 
268 aa  69.7  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1287  helix-turn-helix domain-containing protein  25.1 
 
 
272 aa  69.3  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3504  transcriptional regulator, AraC family  22.62 
 
 
281 aa  67.8  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2241  helix-turn-helix domain-containing protein  24.81 
 
 
277 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1076  transcriptional regulator, AraC family  23.38 
 
 
231 aa  67.8  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1835  helix-turn-helix domain-containing protein  23.97 
 
 
277 aa  66.2  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.140482  normal  0.818318 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1684  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  33.06 
 
 
288 aa  65.9  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.465215  normal  0.801994 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1649  transcriptional regulator, AraC family  23.44 
 
 
271 aa  64.7  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3797  AraC family transcriptional regulator  35.19 
 
 
257 aa  64.3  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.101891 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4454  helix-turn-helix domain-containing protein  24 
 
 
280 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.663382  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1932  AraC family transcriptional regulator  23.37 
 
 
236 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2409  AraC family transcriptional regulator  25.48 
 
 
285 aa  63.5  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0099  transcriptional regulator, AraC family  24.71 
 
 
287 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17370  hypothetical protein  26.55 
 
 
275 aa  63.2  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.457096  normal  0.0989396 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2108  transcriptional regulator, AraC family  23.77 
 
 
263 aa  63.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0188933 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6692  transcriptional regulator, AraC family  24.59 
 
 
260 aa  63.2  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2660  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 
278 aa  62.4  0.000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3571  transcriptional regulator, AraC family  24.44 
 
 
269 aa  62.4  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0312904  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1550  transcriptional regulator, AraC family  22.43 
 
 
272 aa  62.4  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4318  transcriptional regulator, AraC family  21.54 
 
 
267 aa  61.6  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.642666  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1425  AraC family transcriptional regulator  21.26 
 
 
271 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.333229  normal  0.212879 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5120  transcriptional regulator, AraC family  25.75 
 
 
275 aa  61.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.282168 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4542  Helix-turn-helix, AraC domain protein  40.79 
 
 
265 aa  60.1  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2329  AraC family transcriptional regulator  22.73 
 
 
310 aa  58.9  0.00000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3275  transcriptional regulator, AraC family  26.11 
 
 
229 aa  58.9  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.672112  normal  0.145248 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3491  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  24.43 
 
 
248 aa  58.9  0.00000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.873447  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0676  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  23.36 
 
 
260 aa  58.9  0.00000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.425757  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0825  AraC family transcriptional regulator  32.32 
 
 
289 aa  58.2  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2824  helix-turn-helix domain-containing protein  26.4 
 
 
251 aa  58.5  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0253929  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2318  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 
278 aa  58.9  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4320  AraC family transcriptional regulator  24.62 
 
 
255 aa  58.2  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.400643  normal  0.300736 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4694  AraC family transcriptional regulator  22.09 
 
 
272 aa  57.4  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6449  AraC family transcriptional regulator  22.31 
 
 
239 aa  57.4  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0145  transcriptional regulator, AraC family  25.1 
 
 
255 aa  56.6  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.818844  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5306  transcriptional regulator, AraC family  22.94 
 
 
244 aa  56.2  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5627  transcriptional regulator, AraC family  28.44 
 
 
256 aa  55.8  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0030  transcriptional regulator, AraC family  25.82 
 
 
241 aa  55.8  0.0000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0102  two component transcriptional regulator, AraC family  26.64 
 
 
519 aa  54.7  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1733  helix-turn-helix domain-containing protein  22.68 
 
 
305 aa  54.3  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0271524  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2463  helix-turn-helix domain-containing protein  26.87 
 
 
257 aa  54.3  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7200  AraC family transcriptional regulator  34.78 
 
 
297 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0106  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  23 
 
 
325 aa  54.3  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0383824  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1655  hypothetical protein  25 
 
 
271 aa  54.3  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2569  transcriptional regulator, AraC family  20.43 
 
 
309 aa  53.9  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1278  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  25.97 
 
 
252 aa  53.9  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.711886  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3512  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 
292 aa  53.5  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0827399 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1097  AraC family transcriptional regulator  31.19 
 
 
261 aa  53.9  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4438  helix-turn-helix domain-containing protein  32.17 
 
 
255 aa  53.5  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5692  transcriptional regulator, AraC family  22.36 
 
 
271 aa  53.5  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0876527  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2942  AraC family transcriptional regulator  37.14 
 
 
309 aa  53.1  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1304  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  34.75 
 
 
255 aa  52.8  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.407333  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0111  AraC family transcriptional regulator  21.78 
 
 
274 aa  52.8  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2898  AraC family transcriptional regulator  22.01 
 
 
221 aa  52.8  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0979  transcriptional regulator, AraC family  22.36 
 
 
279 aa  52.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.560002  normal  0.0613388 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2463  transcriptional regulator, AraC family  26.79 
 
 
248 aa  52.8  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1833  helix-turn-helix domain-containing protein  23.79 
 
 
274 aa  52.8  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0887778  normal  0.832681 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2597  transcriptional regulator, AraC family  36.56 
 
 
253 aa  52.4  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00366269  normal  0.225275 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3318  Helix-turn-helix, AraC domain protein  22.17 
 
 
239 aa  52.4  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2350  transcriptional regulator, AraC family  22.45 
 
 
263 aa  52  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0397043 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2483  AraC family transcriptional regulator  21.76 
 
 
273 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2830  AraC family transcriptional regulator  22.04 
 
 
264 aa  51.6  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6058  transcriptional regulator, AraC family  19.85 
 
 
291 aa  51.6  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7339  AraC family transcriptional regulator  24.26 
 
 
278 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.725809  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2672  transcriptional regulator, AraC family  25.73 
 
 
273 aa  51.2  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3448  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 
281 aa  50.4  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.327362  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1440  transcriptional regulator, AraC family  25.45 
 
 
275 aa  50.1  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3635  helix-turn-helix domain-containing protein  21.77 
 
 
249 aa  50.1  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000440298 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4151  transcriptional regulator, AraC family  24.58 
 
 
252 aa  49.7  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0354643  normal  0.109267 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2325  Helix-turn-helix, AraC domain protein  22.78 
 
 
249 aa  49.3  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0165435  normal  0.523007 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5791  transcriptional regulator, AraC family  32.65 
 
 
253 aa  49.3  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5515  transcriptional regulator, AraC family  32.69 
 
 
291 aa  49.3  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184351  normal  0.0529906 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3502  transcriptional regulator, AraC family  20.3 
 
 
278 aa  48.9  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1375  transcriptional regulator, AraC family  36.84 
 
 
275 aa  48.9  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.372829  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1656  transcriptional regulator, AraC family  25.47 
 
 
273 aa  48.9  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0328818 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0546  AraC family transcriptional regulator  26.09 
 
 
257 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.493534  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0958  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  20.68 
 
 
268 aa  48.9  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0644351  decreased coverage  0.00475018 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4242  AraC family transcriptional regulator  21.81 
 
 
267 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0581638 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4393  transcriptional regulator, AraC family  21.05 
 
 
246 aa  48.9  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.287242  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2688  helix-turn-helix domain-containing protein  21.36 
 
 
221 aa  47.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.977146  normal  0.242396 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0370  AraC family transcriptional regulator  31.71 
 
 
281 aa  47  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>