More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_0578 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02547  alanyl-tRNA synthetase  43.18 
 
 
876 aa  662    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00107354  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0992  alanyl-tRNA synthetase  43.29 
 
 
876 aa  664    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777298  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2833  alanyl-tRNA synthetase  43.29 
 
 
876 aa  662    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000353011  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1611  alanyl-tRNA synthetase  40.97 
 
 
903 aa  640    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0248511  hitchhiker  0.0000135737 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0148  alanyl-tRNA synthetase  40.72 
 
 
875 aa  640    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.379709  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1246  alanyl-tRNA synthetase  50.46 
 
 
876 aa  875    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2668  alanyl-tRNA synthetase  44.64 
 
 
888 aa  734    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3172  alanyl-tRNA synthetase  42.95 
 
 
875 aa  655    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0289065  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2978  alanyl-tRNA synthetase  42.95 
 
 
876 aa  657    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.471212  decreased coverage  0.000181445 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0843  alanyl-tRNA synthetase  42.52 
 
 
892 aa  673    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000200247  unclonable  0.0000000309197 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1842  alanyl-tRNA synthetase  41.23 
 
 
874 aa  654    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.742593  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2946  alanyl-tRNA synthetase  42.84 
 
 
876 aa  655    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00651312  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0330  alanyl-tRNA synthetase  45.58 
 
 
886 aa  744    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.43097  normal  0.0181617 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0206  alanyl-tRNA synthetase  43.53 
 
 
888 aa  727    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1763  alanyl-tRNA synthetase  42.43 
 
 
860 aa  652    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1763  alanyl-tRNA synthetase  42.41 
 
 
860 aa  657    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0883  alanyl-tRNA synthetase  41.85 
 
 
865 aa  646    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000818492  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0222  alanyl-tRNA synthetase  39.49 
 
 
876 aa  638    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2903  alanyl-tRNA synthetase  41.87 
 
 
892 aa  641    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0357783  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0302  alanyl-tRNA synthetase  45.81 
 
 
885 aa  738    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.125416 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0578  alanyl-tRNA synthetase  100 
 
 
879 aa  1818    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0635  alanyl-tRNA synthetase  42.3 
 
 
860 aa  646    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.427199  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04755  alanyl-tRNA synthetase  51.83 
 
 
870 aa  881    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.604916  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1952  alanyl-tRNA synthetase  43.39 
 
 
887 aa  681    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.491503  normal  0.143708 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0369  alanyl-tRNA synthetase  45.06 
 
 
886 aa  717    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.134799  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0201  alanyl-tRNA synthetase  41.22 
 
 
876 aa  654    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0035752 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2374  alanyl-tRNA synthetase  39.33 
 
 
880 aa  638    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0815913  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0990  alanyl-tRNA synthetase  41.74 
 
 
865 aa  645    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2820  alanyl-tRNA synthetase  43.29 
 
 
876 aa  662    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000729274  hitchhiker  0.00002729 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0127  alanyl-tRNA synthetase  50.28 
 
 
877 aa  850    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0445567  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1644  alanyl-tRNA synthetase  41.28 
 
 
881 aa  638    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.859756  normal  0.0937796 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0446  alanyl-tRNA synthetase  54.29 
 
 
871 aa  956    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3029  alanyl-tRNA synthetase  43.07 
 
 
876 aa  659    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0315037  decreased coverage  0.0000367228 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3136  alanyl-tRNA synthetase  43.07 
 
 
876 aa  659    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299814  hitchhiker  0.000378627 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3013  alanyl-tRNA synthetase  43.07 
 
 
876 aa  659    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.627309  decreased coverage  0.00000132365 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02512  hypothetical protein  43.18 
 
 
876 aa  662    Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00356315  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1894  alanyl-tRNA synthetase  51.48 
 
 
879 aa  873    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3223  alanyl-tRNA synthetase  41.68 
 
 
931 aa  668    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0831  alanyl-tRNA synthetase  40.65 
 
 
884 aa  635    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.168627  normal  0.137566 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1015  alanyl-tRNA synthetase  43.18 
 
 
876 aa  663    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00108503  hitchhiker  0.000252417 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3180  alanyl-tRNA synthetase  43.29 
 
 
876 aa  662    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000208446  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1653  alanyl-tRNA synthetase  41.92 
 
 
863 aa  641    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.149949  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0096  alanyl-tRNA synthetase  42.56 
 
 
894 aa  655    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.172086  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3015  alanyl-tRNA synthetase  40.29 
 
 
865 aa  655    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.071786  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4612  alanyl-tRNA synthetase  41.23 
 
 
874 aa  644    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1446  alanyl-tRNA synthetase  57.55 
 
 
877 aa  1087    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.714674  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3154  alanyl-tRNA synthetase  39.71 
 
 
876 aa  639    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4054  alanyl-tRNA synthetase  41.32 
 
 
874 aa  635    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100715  normal  0.103124 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1120  alanyl-tRNA synthetase  40.38 
 
 
874 aa  642    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00495062  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1560  alanyl-tRNA synthetase  46.21 
 
 
953 aa  816    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80417  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002521  alanyl-tRNA synthetase  40.46 
 
 
860 aa  640    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.226197  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5667  alanyl-tRNA synthetase  50.85 
 
 
886 aa  954    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2378  alanyl-tRNA synthetase  53.71 
 
 
890 aa  962    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.188776  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3711  alanyl-tRNA synthetase  41.12 
 
 
905 aa  659    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.296443  hitchhiker  0.000064855 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2535  alanyl-tRNA synthetase  53.23 
 
 
900 aa  976    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52600  alanyl-tRNA synthetase  41.21 
 
 
874 aa  640    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1906  alanyl-tRNA synthetase  40.38 
 
 
879 aa  647    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03511  alanyl-tRNA synthetase  40.26 
 
 
865 aa  642    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0983  alanyl-tRNA synthetase  41.81 
 
 
875 aa  639    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0820082  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2980  alanyl-tRNA synthetase  43.29 
 
 
876 aa  663    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000468314  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3176  alanyl-tRNA synthetase  40.02 
 
 
878 aa  642    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0243  alanyl-tRNA synthetase  44.22 
 
 
888 aa  739    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0072  alanyl-tRNA synthetase  41.18 
 
 
860 aa  639    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.163524  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3944  alanyl-tRNA synthetase  43.18 
 
 
876 aa  661    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000803556  normal  0.620679 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3838  alanyl-tRNA synthetase  39.66 
 
 
937 aa  634  1e-180  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.894742 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3211  alanyl-tRNA synthetase  42.3 
 
 
875 aa  634  1e-180  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.277669  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1979  alanyl-tRNA synthetase  41.66 
 
 
874 aa  634  1e-180  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3556  alanyl-tRNA synthetase  41.34 
 
 
899 aa  635  1e-180  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.118826  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0850  alanyl-tRNA synthetase  41.21 
 
 
874 aa  634  1e-180  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1590  alanyl-tRNA synthetase  41.84 
 
 
864 aa  634  1e-180  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.136396  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1670  alanyl-tRNA synthetase  40.76 
 
 
872 aa  633  1e-180  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.503814 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1779  alanyl-tRNA synthetase  41.66 
 
 
874 aa  635  1e-180  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3238  alanyl-tRNA synthetase  41.69 
 
 
875 aa  630  1e-179  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000222674  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0898  alanyl-tRNA synthetase  41.69 
 
 
875 aa  629  1e-179  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000010723  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3339  alanyl-tRNA synthetase  41.21 
 
 
874 aa  629  1e-179  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0101035  hitchhiker  0.000000688194 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3373  alanyl-tRNA synthetase  41.69 
 
 
875 aa  630  1e-179  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0247326  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34460  alanyl-tRNA synthetase  41.63 
 
 
874 aa  629  1e-179  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.440747  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3904  alanyl-tRNA synthetase  39.89 
 
 
904 aa  632  1e-179  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.639044  normal  0.0112827 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1116  alanyl-tRNA synthetase  42.3 
 
 
875 aa  631  1e-179  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0502279  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4474  alanyl-tRNA synthetase  42.05 
 
 
874 aa  627  1e-178  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.41358  normal  0.184311 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3979  alanyl-tRNA synthetase  41.83 
 
 
897 aa  627  1e-178  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.567891  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05750  alanyl-tRNA synthetase  39.4 
 
 
876 aa  629  1e-178  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.214182  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0934  alanyl-tRNA synthetase  41.7 
 
 
877 aa  627  1e-178  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1318  alanyl-tRNA synthetase  40.76 
 
 
874 aa  626  1e-178  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0106685  hitchhiker  0.00151314 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4275  alanyl-tRNA synthetase  41.45 
 
 
874 aa  627  1e-178  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0551773  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2408  alanyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 
882 aa  627  1e-178  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00604857  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0311  alanyl-tRNA synthetase  39.69 
 
 
880 aa  628  1e-178  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3181  alanyl-tRNA synthetase  39.64 
 
 
879 aa  628  1e-178  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1441  alanyl-tRNA synthetase  41.94 
 
 
897 aa  627  1e-178  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0440336  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3267  alanyl-tRNA synthetase  41.18 
 
 
874 aa  626  1e-178  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.235906  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1052  alanyl-tRNA synthetase  41.7 
 
 
877 aa  627  1e-178  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.103695 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1289  alanyl-tRNA synthetase  40.72 
 
 
865 aa  627  1e-178  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3115  alanyl-tRNA synthetase  41.07 
 
 
874 aa  625  1e-178  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0471495  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3763  alanyl-tRNA synthetase  41.53 
 
 
897 aa  622  1e-177  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.469111  normal  0.276016 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3784  alanyl-tRNA synthetase  39.98 
 
 
905 aa  622  1e-177  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0683735  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1213  alanyl-tRNA synthetase  40.16 
 
 
874 aa  624  1e-177  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0239363  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0965  alanyl-tRNA synthetase  40.53 
 
 
876 aa  624  1e-177  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.171678  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2527  alanyl-tRNA synthetase  39.35 
 
 
885 aa  624  1e-177  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1128  alanyl-tRNA synthetase  40.87 
 
 
874 aa  624  1e-177  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.12986  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3380  alanyl-tRNA synthetase  42.22 
 
 
867 aa  623  1e-177  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.030284  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>