More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_0554 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010830  Aasi_0554  hypothetical protein  100 
 
 
314 aa  657  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    unclonable  2.79647e-10 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1273  hypothetical protein  90.45 
 
 
314 aa  598  1e-170  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0999856 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0952  hypothetical protein  87.3 
 
 
320 aa  558  1e-158  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1176  hypothetical protein  90.22 
 
 
284 aa  526  1e-148  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.118975 
 
 
-
 
NC_002978  WD0176  transposase, putative  60.66 
 
 
320 aa  387  1e-106  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1296  integrase, catalytic region  59.34 
 
 
316 aa  382  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1717  integrase, catalytic region  59.34 
 
 
316 aa  382  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0171721  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2818  integrase, catalytic region  59.34 
 
 
316 aa  382  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2899  integrase, catalytic region  59.34 
 
 
327 aa  382  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0219368 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1097  integrase, catalytic region  59.34 
 
 
316 aa  382  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.495543  normal  0.303219 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2918  integrase, catalytic region  59.34 
 
 
316 aa  381  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0481  integrase, catalytic region  59.34 
 
 
316 aa  382  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.791017  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0308  integrase, catalytic region  59.34 
 
 
316 aa  382  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2225  integrase, catalytic region  59.02 
 
 
316 aa  380  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00213091  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1293  integrase, catalytic region  60.84 
 
 
329 aa  369  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.345302  normal  0.407109 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0366  integrase, catalytic region  60.49 
 
 
329 aa  367  1e-100  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.680873 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2917  integrase, catalytic region  57.74 
 
 
321 aa  362  4e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.437302 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1668  Integrase catalytic region  53.61 
 
 
330 aa  345  6e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.412192  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3258  Integrase catalytic region  53.61 
 
 
330 aa  345  6e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0692  Integrase catalytic region  53.61 
 
 
330 aa  345  6e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.229145  normal  0.133209 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2721  Integrase catalytic region  53.61 
 
 
330 aa  345  6e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.562875  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2422  Integrase catalytic region  53.29 
 
 
330 aa  343  2e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1875  Integrase catalytic region  53.29 
 
 
355 aa  341  8e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0702445 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2291  Integrase catalytic region  53.29 
 
 
348 aa  341  8e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.152349 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0481  integrase catalytic region  53 
 
 
463 aa  337  2e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0053  integrase catalytic subunit  54.55 
 
 
319 aa  336  3e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.142705  normal  0.776199 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0224  integrase catalytic subunit  53.75 
 
 
316 aa  336  3e-91  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1054  integrase catalytic subunit  53.75 
 
 
316 aa  336  3e-91  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.161609  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1353  integrase catalytic subunit  53.75 
 
 
316 aa  336  3e-91  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.4232  normal  0.0729626 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1767  integrase catalytic subunit  53.75 
 
 
316 aa  336  3e-91  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.417793 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3839  hypothetical protein  54.55 
 
 
319 aa  336  3e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.247548  normal  0.0595051 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3743  hypothetical protein  54.55 
 
 
319 aa  336  3e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1814  integrase catalytic subunit  54.55 
 
 
319 aa  336  3e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0485004  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2400  integrase catalytic subunit  53.75 
 
 
316 aa  336  3e-91  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.61618  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1780  integrase catalytic subunit  53.75 
 
 
316 aa  336  3e-91  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0228632  normal  0.851382 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5447  Integrase catalytic region  57.03 
 
 
277 aa  314  1e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.681137  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0838  integrase, catalytic region  61.44 
 
 
286 aa  310  2e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.204021  hitchhiker  0.00436144 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2850  integrase, catalytic region  61.44 
 
 
329 aa  309  4e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3372  integrase catalytic region  49.03 
 
 
321 aa  303  2e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25530  Integrase, catalytic domain-containing protein  52.65 
 
 
265 aa  286  4e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7134  Integrase catalytic core  58.04 
 
 
303 aa  267  1e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0529  integrase, catalytic core  55.46 
 
 
259 aa  254  2e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0122  integrase, catalytic region  56.86 
 
 
221 aa  244  2e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3474  hypothetical protein  55.05 
 
 
206 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.180544 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2557  integrase, catalytic region  63.46 
 
 
188 aa  206  4e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.805017  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1515  integrase catalytic region  58.76 
 
 
178 aa  204  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.60322  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1631  Integrase catalytic region  37.46 
 
 
329 aa  186  6e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4152  transposase ISRme5 (copy d)  38.82 
 
 
321 aa  183  4e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.29962  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1301  integrase catalytic subunit  38.82 
 
 
321 aa  183  4e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.117909 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1251  integrase catalytic subunit  38.82 
 
 
333 aa  182  5e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.093017 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1280  integrase catalytic subunit  38.82 
 
 
463 aa  181  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.722165  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2660  integrase catalytic subunit  38.74 
 
 
323 aa  176  4e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.271661 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1401  integrase catalytic subunit  36.51 
 
 
323 aa  171  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1424  integrase catalytic subunit  36.51 
 
 
323 aa  169  4e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1128  integrase catalytic subunit  45 
 
 
280 aa  167  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2535  integrase catalytic subunit  35.78 
 
 
323 aa  162  8e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.557756 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2839  integrase, catalytic region  54.96 
 
 
153 aa  161  1e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.489873  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3709  Integrase catalytic region  37.13 
 
 
325 aa  159  4e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.108327 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0344  Integrase catalytic region  37.13 
 
 
325 aa  159  5e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  8.45152e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2728  putative transposase  37.58 
 
 
441 aa  159  8e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2194  putative transposase  37.58 
 
 
329 aa  159  8e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2179  transposase  37.58 
 
 
325 aa  158  9e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2493  transposase, putative  37.58 
 
 
325 aa  158  9e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0917  transposase  37.58 
 
 
327 aa  158  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2250  putative transposase  37.58 
 
 
333 aa  158  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0120  hypothetical protein  37.58 
 
 
497 aa  158  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0793  putative integrase  34.09 
 
 
343 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.638394 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0021  putative integrase  34.09 
 
 
332 aa  157  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.468061 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1782  putative integrase  37.25 
 
 
325 aa  156  4e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1378  putative integrase  37.25 
 
 
325 aa  156  4e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00372186  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0142  integrase, catalytic region  63.39 
 
 
111 aa  151  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7791  Integrase catalytic region  31.58 
 
 
323 aa  150  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.562755  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3549  integrase catalytic region  42.51 
 
 
216 aa  147  2e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.032093 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5037  Integrase catalytic region  32.98 
 
 
274 aa  127  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4022  Integrase catalytic region  30 
 
 
330 aa  125  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.500717  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3472  hypothetical protein  60 
 
 
170 aa  116  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.119399 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2447  integrase catalytic subunit  34.55 
 
 
238 aa  112  1e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01280  transposase  39.09 
 
 
216 aa  108  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0995831  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00518  transposase  39.09 
 
 
216 aa  108  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33450  integrase, catalytic core  31.02 
 
 
185 aa  102  7e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3295  integrase catalytic subunit  28.57 
 
 
316 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.102565  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4870  integrase catalytic subunit  28.57 
 
 
316 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5566  integrase catalytic region  27.79 
 
 
316 aa  93.6  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0200505  normal  0.0677233 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0801  integrase catalytic region  28.25 
 
 
316 aa  92.8  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6848  integrase catalytic subunit  28.25 
 
 
316 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1371  Fis family transcriptional regulator  36.47 
 
 
179 aa  89.4  7e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0199142  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6859  integrase catalytic region  28.57 
 
 
316 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0984063  normal  0.439407 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0733  transposase, putative  30.88 
 
 
229 aa  87.8  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0458  integrase catalytic subunit  28.47 
 
 
338 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3767  hypothetical protein  52.5 
 
 
128 aa  82  1e-14  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1116  transcriptional regulator, putative  37.98 
 
 
272 aa  80.9  2e-14  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8690  putative integrase  31.54 
 
 
157 aa  80.5  3e-14  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5325  hypothetical protein  54.79 
 
 
197 aa  78.2  2e-13  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.969651  normal  0.742207 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2665  transcriptional regulator, putative  36.92 
 
 
289 aa  77.8  2e-13  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2839  transcriptional regulator, putative  36.15 
 
 
289 aa  76.6  5e-13  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2732  transcriptional regulator, putative  36.15 
 
 
289 aa  76.6  5e-13  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1603  transcriptional regulator, putative  36.15 
 
 
302 aa  76.3  7e-13  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2664  transcriptional regulator, putative  26.81 
 
 
284 aa  75.9  8e-13  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3733  Integrase catalytic region  25.91 
 
 
330 aa  75.1  1e-12  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0167687  normal  0.270652 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3083  Integrase catalytic region  25.91 
 
 
330 aa  75.1  1e-12  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00428734  hitchhiker  2.89484e-05 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>