74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_0552 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010830  Aasi_0884  hypothetical protein  100 
 
 
364 aa  181  2e-45  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0934  hypothetical protein  100 
 
 
364 aa  181  2e-45  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0345872 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0956  hypothetical protein  100 
 
 
364 aa  181  2e-45  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0552  hypothetical protein  100 
 
 
86 aa  177  4e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    unclonable  2.00918e-10 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5962  Integrase catalytic region  67.14 
 
 
350 aa  99  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.454691  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3516  Integrase catalytic region  67.14 
 
 
350 aa  99  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.359482  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3016  Integrase catalytic region  66.18 
 
 
353 aa  96.3  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3543  ISSod13, transposase  61.67 
 
 
346 aa  85.5  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3880  ISSod13, transposase  61.67 
 
 
346 aa  85.5  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0119  ISSod13, transposase  61.67 
 
 
346 aa  85.5  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0151  ISSod13, transposase  61.67 
 
 
346 aa  85.5  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0142  ISSod13, transposase  61.67 
 
 
346 aa  85.5  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1763  integrase catalytic subunit  60 
 
 
346 aa  84.3  5e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.274146 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2033  hypothetical protein  59.32 
 
 
344 aa  84  6e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2742  Integrase catalytic region  57.14 
 
 
352 aa  82.8  1e-15  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0453535  normal  0.190345 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1724  Integrase catalytic region  57.14 
 
 
352 aa  82.8  1e-15  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3940  integrase catalytic subunit  58.33 
 
 
346 aa  82.8  1e-15  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1678  Integrase catalytic region  57.14 
 
 
352 aa  82.8  1e-15  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0900  Integrase catalytic region  57.14 
 
 
352 aa  82.8  1e-15  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.552525 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1750  Integrase catalytic region  57.14 
 
 
352 aa  82.8  1e-15  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0719941  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2426  Integrase catalytic region  57.14 
 
 
352 aa  82.8  1e-15  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.523516  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1248  integrase catalytic subunit  61.82 
 
 
347 aa  82.4  2e-15  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113109  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1428  integrase catalytic subunit  61.82 
 
 
347 aa  82.4  2e-15  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1434  integrase catalytic subunit  61.82 
 
 
347 aa  82.4  2e-15  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.522926  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2096  integrase catalytic subunit  61.82 
 
 
347 aa  82.4  2e-15  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.898918  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2098  integrase catalytic subunit  61.82 
 
 
347 aa  82.4  2e-15  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2208  integrase catalytic subunit  61.82 
 
 
347 aa  82.4  2e-15  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2695  Integrase catalytic region  58.33 
 
 
346 aa  82  3e-15  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0101379  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0915  Integrase catalytic region  58.33 
 
 
346 aa  82  3e-15  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.277682  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0434  Integrase catalytic region  58.33 
 
 
346 aa  82  3e-15  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6430  Integrase catalytic region  61.29 
 
 
345 aa  81.6  3e-15  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0663611 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2463  Integrase catalytic region  58.33 
 
 
346 aa  82  3e-15  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.676123  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4777  integrase catalytic region  62.9 
 
 
210 aa  81.6  3e-15  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5019  Integrase catalytic region  62.71 
 
 
344 aa  80.9  6e-15  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.679371  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3580  integrase catalytic subunit  56.67 
 
 
346 aa  80.5  7e-15  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0338  Integrase catalytic region  57.63 
 
 
348 aa  72.8  2e-12  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.465639  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1400  Integrase catalytic region  57.63 
 
 
348 aa  72.8  2e-12  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000187237  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1479  Integrase catalytic region  57.63 
 
 
348 aa  72.8  2e-12  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1821  Integrase catalytic region  57.63 
 
 
348 aa  72.8  2e-12  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.304505  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1832  Integrase catalytic region  57.63 
 
 
348 aa  72.8  2e-12  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.394112  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2693  Integrase catalytic region  57.63 
 
 
348 aa  72.8  2e-12  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1850  Integrase catalytic region  57.63 
 
 
348 aa  72.8  2e-12  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2690  Integrase catalytic region  57.63 
 
 
348 aa  72.8  2e-12  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2551  Integrase catalytic region  57.63 
 
 
348 aa  72.8  2e-12  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000856867  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2553  Integrase catalytic region  57.63 
 
 
348 aa  72.8  2e-12  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  5.02236e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2676  Integrase catalytic region  57.63 
 
 
348 aa  72.8  2e-12  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1220  Integrase catalytic region  57.63 
 
 
348 aa  72.8  2e-12  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0919  Integrase catalytic region  57.63 
 
 
348 aa  72.8  2e-12  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.608605  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0823  Integrase catalytic region  57.63 
 
 
348 aa  72.8  2e-12  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2977  Integrase catalytic region  57.63 
 
 
348 aa  72.8  2e-12  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2972  Integrase catalytic region  57.63 
 
 
348 aa  72.8  2e-12  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0804741  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1838  Integrase catalytic region  57.63 
 
 
348 aa  72.8  2e-12  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2961  Integrase catalytic region  57.63 
 
 
348 aa  72.8  2e-12  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2889  Integrase catalytic region  57.63 
 
 
348 aa  72.8  2e-12  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0567202  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0220  Integrase catalytic region  57.63 
 
 
348 aa  72.8  2e-12  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2708  Integrase catalytic region  57.63 
 
 
348 aa  72.8  2e-12  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0409  Integrase catalytic region  57.63 
 
 
348 aa  72.8  2e-12  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0586  Integrase catalytic region  57.63 
 
 
348 aa  72.8  2e-12  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0674484  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0589  Integrase catalytic region  57.63 
 
 
348 aa  72.8  2e-12  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.02075  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2685  Integrase catalytic region  57.63 
 
 
348 aa  72.8  2e-12  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2149  Integrase catalytic region  55.93 
 
 
348 aa  70.9  6e-12  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.142732  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1966  ISSod13, transposase  50 
 
 
291 aa  55.5  3e-07  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1864  integrase catalytic subunit  50 
 
 
348 aa  54.3  5e-07  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2262  integrase catalytic subunit  50 
 
 
348 aa  54.3  5e-07  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.512462  normal  0.657223 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3186  integrase catalytic subunit  50 
 
 
348 aa  54.3  5e-07  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3733  integrase catalytic subunit  50 
 
 
348 aa  54.3  5e-07  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3191  integrase catalytic subunit  50 
 
 
348 aa  54.3  5e-07  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.826636  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0877  integrase catalytic subunit  43.14 
 
 
349 aa  51.2  4e-06  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.120135  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0852  integrase catalytic subunit  43.14 
 
 
349 aa  51.2  4e-06  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.336174  normal  0.0241758 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7136  hypothetical protein  43.1 
 
 
89 aa  50.1  1e-05  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.908957  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3878  integrase catalytic subunit  39.29 
 
 
344 aa  45.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4480  integrase, catalytic region  40 
 
 
357 aa  45.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  2.14093e-06 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0362  integrase, catalytic region  32.14 
 
 
337 aa  42.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.540687  hitchhiker  8.59615e-05 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1005  Integrase catalytic region  38.71 
 
 
349 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>