More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_0498 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010830  Aasi_0498  hypothetical protein  100 
 
 		 370 aa  763    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5508  DNA replication and repair protein RecF  45.9 
 
 		 368 aa  333  3e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3886  DNA replication and repair protein RecF  45 
 
 		 365 aa  315  7e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0534  DNA replication and repair protein RecF  42.58 
 
 		 367 aa  311  1e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.921957  hitchhiker  0.00000000241058 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1183  DNA replication and repair protein RecF  41.6 
 
 		 373 aa  301  2e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00164356  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3717  DNA replication and repair protein  42.23 
 
 		 377 aa  295  9e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.329241 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09773  putative DNA replication and repair protein  39.83 
 
 		 359 aa  291  1e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.753312  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0214  DNA replication and repair protein RecF  40.67 
 
 		 359 aa  290  3e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.613838  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5456  DNA replication and repair protein RecF  38.27 
 
 		 360 aa  261  8.999999999999999e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0356472  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0398  recF protein  36.12 
 
 		 364 aa  234  1.0000000000000001e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2750  DNA replication and repair protein RecF  32.11 
 
 		 387 aa  191  1e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.433504  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0003  DNA replication and repair protein RecF  32.18 
 
 		 363 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.222725  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0004  DNA replication and repair protein RecF  29.85 
 
 		 360 aa  179  9e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0004  recombination protein F  29.79 
 
 		 374 aa  178  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0004  recombination protein F  29.37 
 
 		 372 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0003  RecF protein  31.46 
 
 		 364 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.056932  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2238  recombination protein F  30.6 
 
 		 359 aa  174  2.9999999999999996e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0003  recombination protein F  30.11 
 
 		 370 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.715959  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0003  DNA replication and repair protein RecF  31.27 
 
 		 370 aa  173  5e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.152297 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0002  RecF protein  29.26 
 
 		 369 aa  171  1e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000642266  normal  0.645599 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0004  recombination protein F  31.79 
 
 		 374 aa  172  1e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0003  DNA replication and repair protein RecF  29.4 
 
 		 363 aa  169  5e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0003  DNA replication and repair protein RecF  29.67 
 
 		 365 aa  168  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0004  recombination protein F  30.09 
 
 		 375 aa  168  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0004  recombination protein F  30.24 
 
 		 375 aa  166  4e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0003  recombination protein F  30.14 
 
 		 364 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0004  recombination protein F  30.09 
 
 		 375 aa  166  9e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.864622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0004  recombination protein F  30.09 
 
 		 375 aa  166  9e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0004  recombination protein F  30.09 
 
 		 375 aa  166  9e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000104808  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0003  DNA replication and repair protein RecF  27.92 
 
 		 369 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0749386  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0004  recombination protein F  30.09 
 
 		 375 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0004  recombination protein F  30.09 
 
 		 375 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0004  recombination protein F  30.09 
 
 		 375 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.340003 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0004  recombination protein F  30.09 
 
 		 375 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5316  recombination protein F  29.94 
 
 		 375 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0155044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1991  recombination protein F  29.52 
 
 		 366 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0004  recombination protein F  30.09 
 
 		 373 aa  164  3e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.177605  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2450  DNA replication and repair protein RecF  32.52 
 
 		 366 aa  163  4.0000000000000004e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00040  DNA replication and repair protein RecF  28.82 
 
 		 375 aa  163  5.0000000000000005e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0003  DNA replication and repair protein RecF  30.43 
 
 		 364 aa  162  8.000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2156  recombination protein F  27.54 
 
 		 369 aa  162  1e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000779125  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0004  recombination protein F  29.14 
 
 		 374 aa  160  3e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0004  DNA replication and repair protein RecF  29.89 
 
 		 372 aa  159  6e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370076  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0003  recombination protein F  29.86 
 
 		 364 aa  159  7e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0004  recombination protein F  28.04 
 
 		 361 aa  158  1e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0004  recombination protein F  28.04 
 
 		 361 aa  158  1e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0004  DNA replication and repair protein RecF  28.53 
 
 		 386 aa  157  3e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00780262  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1772  DNA replication and repair protein RecF  27.43 
 
 		 371 aa  155  9e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0004  DNA replication and repair protein RecF  28.25 
 
 		 380 aa  155  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0004  DNA replication and repair protein RecF  28.01 
 
 		 373 aa  155  1e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00040  recombination protein F  27.99 
 
 		 390 aa  154  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.0000332989  normal  0.373412 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0004  DNA replication and repair protein RecF  28.69 
 
 		 376 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0004  recombination protein F  26.93 
 
 		 374 aa  152  7e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.60396e-25 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0003  recombination protein F  28.57 
 
 		 368 aa  152  7e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00792918  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0005  DNA replication and repair protein RecF  30.46 
 
 		 370 aa  150  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000369508  hitchhiker  0.000000145417 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5273  recombination protein F  28.4 
 
 		 384 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0402761 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2550  recombination protein F  26.53 
 
 		 371 aa  150  4e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0191996  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0004  DNA replication and repair protein RecF  31.17 
 
 		 359 aa  149  6e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0003  DNA replication and repair protein  30.17 
 
 		 363 aa  149  8e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0241212  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0004  DNA replication and repair protein RecF  27.49 
 
 		 377 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.780515  decreased coverage  0.00205006 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0004  recombination protein F  26.06 
 
 		 370 aa  147  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.188075  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0004  recombination protein F  26.06 
 
 		 370 aa  147  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.320094  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0003  DNA replication and repair protein RecF  28.17 
 
 		 382 aa  147  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2374  DNA replication and repair protein RecF  29.11 
 
 		 369 aa  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0003  recombination protein F  27.6 
 
 		 371 aa  146  5e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0003  recombination protein F  28 
 
 		 365 aa  145  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0004  recombination protein F  26.67 
 
 		 362 aa  145  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0004  DNA replication and repair protein RecF  28.31 
 
 		 399 aa  145  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3391  recombination protein F  25.96 
 
 		 376 aa  143  4e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1725  recombination protein F  28.35 
 
 		 390 aa  143  5e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0002  recombination protein F  27.75 
 
 		 365 aa  142  9e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0004  DNA replication and repair protein RecF  27.65 
 
 		 371 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.244423  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0004  DNA replication and repair protein RecF  26.27 
 
 		 378 aa  140  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.332828  normal  0.294433 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0005  Recombinational DNA repair ATPase (RecF pathway)- like protein  25.82 
 
 		 390 aa  140  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.518698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0824  recombination protein F  27.42 
 
 		 389 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1094  recombination protein F  29.06 
 
 		 380 aa  139  6e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1123  recombination protein F  29.06 
 
 		 380 aa  139  6e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.633638 
 
 
-
 
NC_002620  TC0346  recombination protein F  28.32 
 
 		 365 aa  138  1e-31  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.105676  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0004  recombination protein F  26.53 
 
 		 399 aa  139  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000897119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0003  DNA replication and repair protein RecF  26.63 
 
 		 365 aa  138  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.390569  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0004  recombination protein F  26.63 
 
 		 377 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0533102  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0004  recombination protein F  26.19 
 
 		 402 aa  137  4e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000215476 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00030  recF protein  27.54 
 
 		 378 aa  136  5e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.172429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0004  recombination protein F  26.86 
 
 		 401 aa  136  5e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.582462  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0004  DNA replication and repair protein RecF  26.13 
 
 		 398 aa  136  6.0000000000000005e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0005  DNA replication and repair protein RecF  28.1 
 
 		 401 aa  136  7.000000000000001e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2998  DNA replication and repair protein RecF  29.36 
 
 		 357 aa  135  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0957887  normal  0.356139 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0004  DNA replication and repair protein RecF  24.8 
 
 		 401 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0234523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0003  DNA replication and repair protein RecF  26.96 
 
 		 397 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00040  DNA replication and repair protein RecF  27.95 
 
 		 390 aa  134  1.9999999999999998e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0004  DNA replication and repair protein RecF  26.24 
 
 		 381 aa  134  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.321306  normal  0.933031 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00030  recF protein  28.09 
 
 		 376 aa  133  3.9999999999999996e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000612951  decreased coverage  0.0000132668 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2248  recombination protein F  28.42 
 
 		 377 aa  133  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0003  DNA replication and repair protein RecF  26.76 
 
 		 358 aa  133  6e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0004  recombination protein F  26.46 
 
 		 386 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.187663 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0940  DNA replication and repair protein RecF  25.81 
 
 		 355 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00040  DNA replication and repair protein RecF  25.18 
 
 		 414 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0004  recombination protein F  26.99 
 
 		 371 aa  131  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00656338  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0005  recombination protein F  25.66 
 
 		 377 aa  130  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000288317  hitchhiker  0.00404548 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10003  recombination protein F  27.47 
 
 		 385 aa  130  3e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>