47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_0454 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010830  Aasi_0454  hypothetical protein  100 
 
 
969 aa  1998    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0460  hypothetical protein  100 
 
 
969 aa  1998    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0517  hypothetical protein  27.49 
 
 
960 aa  323  6e-87  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0137071 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4179  ATP-dependent nuclease subunit B  26.98 
 
 
951 aa  307  7e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0186449 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0696  hypothetical protein  26.22 
 
 
919 aa  292  2e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03200  hypothetical protein  26.05 
 
 
911 aa  275  2.0000000000000002e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.358674  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1837  hypothetical protein  26.22 
 
 
909 aa  268  4e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.57891  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2374  hypothetical protein  25.42 
 
 
968 aa  254  6e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1658  hypothetical protein  27.05 
 
 
1039 aa  155  5e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.450453  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1165  hypothetical protein  21.91 
 
 
984 aa  130  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.5757 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1587  hypothetical protein  20.69 
 
 
997 aa  115  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0978  hypothetical protein  23.32 
 
 
1000 aa  114  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.263512  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0765  hypothetical protein  21.57 
 
 
1100 aa  102  4e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.166845 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1911  hypothetical protein  23.27 
 
 
780 aa  87.4  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0088  hypothetical protein  24.12 
 
 
781 aa  81.6  0.00000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.217564  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0896  UvrD/REP helicase  23.85 
 
 
1066 aa  70.5  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.380602  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0385  hypothetical protein  22.17 
 
 
786 aa  67.4  0.000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.412498  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1655  hypothetical protein  22.49 
 
 
788 aa  62  0.00000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0722  hypothetical protein  22.17 
 
 
930 aa  61.6  0.00000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.851206  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1475  hypothetical protein  22.22 
 
 
788 aa  60.1  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0853402  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0381  hypothetical protein  23.23 
 
 
794 aa  59.3  0.0000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0210586  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2223  hypothetical protein  21.89 
 
 
858 aa  58.5  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1829  hypothetical protein  22.97 
 
 
788 aa  58.2  0.0000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.423033  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2195  hypothetical protein  21.98 
 
 
858 aa  57.4  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0909  hypothetical protein  22.19 
 
 
783 aa  56.6  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3266  DNA-dependent ATPase I and helicase II  24.35 
 
 
1041 aa  56.6  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.951374  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1287  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  23.45 
 
 
994 aa  55.8  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1392  hypothetical protein  20.47 
 
 
803 aa  55.8  0.000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1562  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  22.12 
 
 
957 aa  55.1  0.000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3877  hypothetical protein  25.37 
 
 
1151 aa  53.1  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1752  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  24.03 
 
 
940 aa  52.8  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.894533 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1156  hypothetical protein  22.14 
 
 
865 aa  52.8  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22140  RecB family exonuclease  26.07 
 
 
333 aa  52  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.180752  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1066  UvrD/REP helicase  20.06 
 
 
1048 aa  52  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0645  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  21.34 
 
 
989 aa  51.2  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0840  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  23.57 
 
 
1048 aa  49.3  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.564215  hitchhiker  0.00099262 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0735  hypothetical protein  20.91 
 
 
781 aa  49.3  0.0004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0055  double-strand break repair protein AddB  27.84 
 
 
1062 aa  48.5  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2004  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  24.93 
 
 
935 aa  48.9  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4020  hypothetical protein  25.79 
 
 
1079 aa  48.5  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3983  hypothetical protein  25.27 
 
 
1100 aa  47.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.588967  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5903  RecB family exonuclease-like protein  25.12 
 
 
295 aa  47.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.016661  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2110  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  27.38 
 
 
1226 aa  45.8  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1499  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  24.11 
 
 
1049 aa  45.4  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1482  RecB family exonuclease-like protein  28.33 
 
 
302 aa  45.4  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0985  ATP-dependent nuclease subunit AddB  27.82 
 
 
1157 aa  45.1  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0966  ATP-dependent nuclease subunit AddB  27.82 
 
 
1157 aa  45.1  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>