More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_0446 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010830  Aasi_1444  hypothetical protein  53.05 
 
 
1170 aa  721    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0449  hypothetical protein  54.61 
 
 
1126 aa  733    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.812136 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0446  hypothetical protein  100 
 
 
726 aa  1451    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.722173 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1038  hypothetical protein  39.12 
 
 
487 aa  315  9.999999999999999e-85  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1041  hypothetical protein  37.14 
 
 
485 aa  291  2e-77  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.880803 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0327  hypothetical protein  36.33 
 
 
489 aa  255  2.0000000000000002e-66  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0924  twin-arginine translocation pathway signal  32.21 
 
 
452 aa  220  8.999999999999998e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.839391  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0041  sodium/pantothenate symporter  31.34 
 
 
468 aa  193  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.3030600000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0939  hypothetical protein  29.61 
 
 
1157 aa  184  7e-45  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.186942 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0563  hypothetical protein  29.69 
 
 
1121 aa  182  2e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0552395 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0040  metal-dependent phosphohydrolase  29.49 
 
 
1109 aa  177  6e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0697  hypothetical protein  29.41 
 
 
953 aa  175  2.9999999999999996e-42  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0694  hypothetical protein  25.95 
 
 
958 aa  171  7e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1503  hypothetical protein  27.68 
 
 
1085 aa  162  2e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1501  hypothetical protein  27.68 
 
 
1085 aa  162  2e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0839  hypothetical protein  26.71 
 
 
1105 aa  160  8e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0994214 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1009  hypothetical protein  25.6 
 
 
1116 aa  142  1.9999999999999998e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.804907 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0927  hypothetical protein  27.96 
 
 
1156 aa  139  2e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0257155 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0355  hypothetical protein  27.95 
 
 
1111 aa  136  9.999999999999999e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0552395 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1743  hypothetical protein  29.82 
 
 
485 aa  133  1.0000000000000001e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.60384 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1040  hypothetical protein  40.32 
 
 
643 aa  132  2.0000000000000002e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1039  hypothetical protein  36.11 
 
 
447 aa  115  4.0000000000000004e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  24.16 
 
 
472 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1650  SSS sodium solute transporter superfamily  26.42 
 
 
483 aa  108  5e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.888495  normal  0.420592 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3406  Na+/solute symporter  26.18 
 
 
461 aa  103  9e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183888  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0801  SSS sodium solute transporter superfamily  25.48 
 
 
487 aa  101  5e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  23.66 
 
 
474 aa  100  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25 
 
 
526 aa  96.3  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0592432  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3347  putative osmoregulated proline transporter  22.63 
 
 
486 aa  92.8  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2709  Na+/solute symporter  23.3 
 
 
483 aa  92.8  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1146  Na+/solute symporter  24.29 
 
 
469 aa  92  4e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.497129  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5121  Na+/solute symporter  25.86 
 
 
462 aa  89.7  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0575  Na+/solute symporter  24.48 
 
 
479 aa  89  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000227559  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.31 
 
 
533 aa  88.2  5e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.3 
 
 
526 aa  88.2  5e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0491  SSS sodium solute transporter superfamily  23.68 
 
 
509 aa  85.5  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0375697  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2774  SSS sodium solute transporter superfamily  23.99 
 
 
529 aa  85.9  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00224729  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46110  putative sodium:solute symport protein  25 
 
 
463 aa  84.7  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0497302  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3921  sodium:solute symport protein  25 
 
 
463 aa  84.3  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1817  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.26 
 
 
484 aa  82.4  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03377  sodium:solute symporter family protein  23.29 
 
 
523 aa  82.4  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06350  hypothetical protein  25.41 
 
 
506 aa  81.6  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1454  Na+/solute symporter  25.25 
 
 
459 aa  80.9  0.00000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0563954  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1387  Na+/solute symporter  24.5 
 
 
459 aa  80.9  0.00000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.557678 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2906  Na+/solute symporter  26.97 
 
 
463 aa  80.5  0.00000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4524  Na+/solute symporter  24.5 
 
 
459 aa  80.5  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  23.62 
 
 
551 aa  80.1  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  24.37 
 
 
483 aa  79.7  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.81 
 
 
522 aa  79  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135189  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0378  sodium:solute symporter  28.31 
 
 
461 aa  78.6  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5240  Na+/solute symporter  22.07 
 
 
460 aa  77.4  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2298  Na+/solute symporter  22.54 
 
 
503 aa  77  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3709  SSS sodium solute transporter superfamily  21.05 
 
 
564 aa  77  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.174317  normal  0.0274266 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2845  Na+/solute symporter  26.61 
 
 
474 aa  77.4  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04650  sodium/panthothenate symporter  28.35 
 
 
496 aa  77  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00393427  hitchhiker  0.0000895838 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  22.85 
 
 
523 aa  76.6  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3321  sodium/panthothenate symporter  24.43 
 
 
494 aa  75.9  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2286  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.78 
 
 
519 aa  74.7  0.000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0255  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.81 
 
 
542 aa  73.9  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0835  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.62 
 
 
522 aa  73.6  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.172463  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03760  putative sodium:solute symporter  26.54 
 
 
461 aa  73.6  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188515  normal  0.0159939 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4030  Na+/solute symporter  24.5 
 
 
459 aa  73.9  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.110038  normal  0.104242 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0871  Na+/solute symporter  22.86 
 
 
482 aa  73.6  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.857902  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3816  Na+/solute symporter  25.37 
 
 
459 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.101715 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3696  sodium/panthothenate symporter  21.91 
 
 
483 aa  72.8  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2574  hypothetical protein  32.93 
 
 
420 aa  72  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2428  hypothetical protein  32.32 
 
 
420 aa  72  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1379  sodium/panthothenate symporter  24.32 
 
 
492 aa  72  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0385274  normal  0.372154 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4170  Na+/solute symporter  24.16 
 
 
526 aa  72.4  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0688566  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1620  Na+/solute symporter  25.7 
 
 
460 aa  72.4  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0163738 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5457  Na+/solute symporter  23.15 
 
 
482 aa  72.4  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.692749  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0367  Na+/solute symporter  24.67 
 
 
446 aa  71.6  0.00000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.101074  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1074  SSS sodium solute transporter superfamily  23.49 
 
 
520 aa  71.2  0.00000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.729495  normal  0.0148232 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13128  sodium/glucose cotransporter  22.71 
 
 
575 aa  71.2  0.00000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.194229  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0800  Na+/solute symporter  22.63 
 
 
483 aa  70.9  0.00000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1298  Na+/solute symporter  25.71 
 
 
472 aa  70.9  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.537823 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4898  solute/sodium symporter (SSS) family protein  26.7 
 
 
489 aa  70.9  0.00000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.19 
 
 
520 aa  70.9  0.00000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.736166  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00590  Sodium:solute symporter  25.41 
 
 
460 aa  70.5  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000130807  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3587  Na+/solute symporter  22.54 
 
 
556 aa  70.5  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2710  Na+/solute symporter  24.21 
 
 
462 aa  69.7  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.308556  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2086  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.86 
 
 
520 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.275016  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.91 
 
 
526 aa  69.7  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.495731  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3036  sodium/proline symporter  21.93 
 
 
488 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000692388  normal  0.0245093 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1057  Na+/solute symporter  22.54 
 
 
476 aa  68.9  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0416  sodium/proline symporter  22.25 
 
 
495 aa  68.6  0.0000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.292846  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1786  Na+/solute symporter  23.66 
 
 
483 aa  67  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.483787  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1569  hypothetical protein  26.57 
 
 
468 aa  66.6  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1911  Na+/solute symporter  24.11 
 
 
460 aa  65.9  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.504205  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2177  sodium/proline symporter  22.6 
 
 
482 aa  66.2  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000107736  normal  0.0804917 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2874  sodium/panthothenate symporter  23.82 
 
 
495 aa  66.2  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0389  sodium/panthothenate symporter  24.05 
 
 
484 aa  65.9  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00229851  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0455  sodium/panthothenate symporter  24.05 
 
 
484 aa  65.9  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1209  sodium/panthothenate symporter  24.05 
 
 
484 aa  65.9  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00169799  normal  0.818802 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1716  GTP-binding protein, HSR1-releated protein  22.22 
 
 
498 aa  65.9  0.000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.066858  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3541  Na+/solute symporter  23.04 
 
 
597 aa  65.5  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.165749  normal  0.131888 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1619  sodium/proline symporter  20.94 
 
 
483 aa  65.1  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000146301  decreased coverage  0.00000122936 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1090  sodium/glucose cotransport protein  24.13 
 
 
520 aa  65.1  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.133382 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1901  sodium/panthothenate symporter  25.9 
 
 
512 aa  65.5  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000150828 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0324  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  19.7 
 
 
567 aa  64.7  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.549745 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>