More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_0442 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010830  Aasi_0442  hypothetical protein  100 
 
 
326 aa  678    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3344  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  53.12 
 
 
327 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.430093 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3263  transcriptional regulator, AraC family  50.16 
 
 
326 aa  349  3e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.380473 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3759  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  49.38 
 
 
326 aa  345  4e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3787  transcriptional regulator  49.53 
 
 
321 aa  341  9e-93  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1229  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  50.62 
 
 
327 aa  332  4e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.134279  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1489  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  46.71 
 
 
323 aa  330  3e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.616641 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2426  transcriptional regulator, AraC family  46.39 
 
 
326 aa  327  1.0000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971153  normal  0.0916341 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1778  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  46.39 
 
 
325 aa  321  9.999999999999999e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.545321  normal  0.0235367 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2301  transcriptional regulator  44.06 
 
 
324 aa  311  7.999999999999999e-84  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0634001 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1330  transcriptional regulator, AraC family  42.95 
 
 
326 aa  293  4e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.521973  normal  0.989615 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1772  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  45.17 
 
 
293 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0120296 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1733  transcriptional regulator, AraC family  44.28 
 
 
322 aa  265  8e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1182  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  37.58 
 
 
324 aa  241  1e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.904069 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2762  transcriptional regulator, AraC family  45.6 
 
 
332 aa  228  1e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0171097 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4511  transcriptional regulator, AraC family  36.7 
 
 
339 aa  222  8e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.64274 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5208  transcriptional regulator, AraC family  38.01 
 
 
324 aa  209  7e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000934033  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2142  AraC family transcriptional regulator  35.6 
 
 
324 aa  206  3e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2846  AraC family transcriptional regulator  34.89 
 
 
330 aa  187  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1705  helix-turn-helix domain-containing protein  36.69 
 
 
320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.29723  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4536  AraC family transcriptional regulator  31.6 
 
 
334 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4411  helix-turn-helix domain-containing protein  31.6 
 
 
334 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.321471  normal  0.2451 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0125  transcriptional regulator  29.69 
 
 
325 aa  181  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1313  AraC family transcriptional regulator  32.87 
 
 
306 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.459937  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0920  AraC family transcriptional regulator  30.06 
 
 
334 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01004  Transcriptional regulator containing an amidase domain and an AraC-type DNA-binding HTH domain  33.21 
 
 
329 aa  176  4e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0283206  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2508  transcriptional regulator  30.48 
 
 
336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.207874  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4427  transcriptional regulator, AraC family  31.52 
 
 
336 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.326492  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4121  helix-turn-helix, AraC type  31.27 
 
 
334 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2221  transcriptional regulator  36.8 
 
 
330 aa  171  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4697  transcriptional regulator  29.94 
 
 
331 aa  170  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207414  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0897  transcriptional regulator  31.37 
 
 
335 aa  169  8e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825741  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0720  AraC family transcriptional regulator  33.99 
 
 
326 aa  165  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000016714 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0622  transcriptional regulator  30.06 
 
 
340 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.553854  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4083  AraC family transcriptional regulator  32.94 
 
 
341 aa  164  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0474473  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3712  transcriptional regulator  31.94 
 
 
336 aa  163  5.0000000000000005e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.990015  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0564  AraC family transcriptional regulator  32.93 
 
 
285 aa  161  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.682443  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1918  transcriptional regulator, AraC family  30.38 
 
 
327 aa  162  1e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1599  transcriptional regulator  28.92 
 
 
361 aa  160  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.97604  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2599  AraC family transcriptional regulator  32.53 
 
 
343 aa  159  5e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0860  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
348 aa  159  6e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5008  putative transcriptional regulator  28.44 
 
 
332 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250322  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1003  AraC family transcriptional regulator  31.03 
 
 
332 aa  158  1e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.194559  hitchhiker  0.0000278765 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2573  transcriptional regulator, AraC family with amidase-like domain  30.57 
 
 
345 aa  156  4e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0072  transcriptional regulator  29.79 
 
 
347 aa  155  7e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000158985 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1246  AraC family transcriptional regulator  32.11 
 
 
332 aa  155  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.481495  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05287  transcriptional activator FtrA  30.77 
 
 
320 aa  154  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1602  transcriptional regulator  28.96 
 
 
330 aa  154  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0068  transcriptional regulator  29.79 
 
 
347 aa  154  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0711239 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4194  AraC family transcriptional regulator  31.9 
 
 
335 aa  152  5e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0109567  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57630  AraC family transcriptional regulator  31.2 
 
 
299 aa  153  5e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.963773 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4589  AraC family transcriptional regulator  33.6 
 
 
333 aa  152  1e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1501  transcriptional regulator  29.59 
 
 
347 aa  150  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0070  transcriptional regulator  29.18 
 
 
347 aa  150  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.020859 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3593  AraC family transcriptional regulator  34.14 
 
 
342 aa  150  3e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3778  AraC family transcriptional regulator  28.85 
 
 
329 aa  149  5e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3785  AraC family transcriptional regulator  29.48 
 
 
335 aa  149  6e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5041  transcriptional regulator  28.98 
 
 
331 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00544571 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0104  AraC family transcriptional regulator  30.42 
 
 
328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2675  transcriptional regulator, AraC family  30.74 
 
 
344 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307401  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0189  transcriptional regulator, AraC family  28.09 
 
 
360 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.166962 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3975  transcriptional regulator  32 
 
 
337 aa  144  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3506  AraC family transcriptional regulator  28.92 
 
 
330 aa  142  8e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.939341  normal  0.0589755 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0314  AraC family transcriptional regulator  26.65 
 
 
322 aa  142  8e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5151  AraC family transcriptional regulator  27.81 
 
 
316 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479428  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0974  helix-turn-helix domain-containing protein  28.75 
 
 
314 aa  141  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.998994  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2234  AraC family transcriptional regulator  28.79 
 
 
330 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.962439 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4316  transcriptional regulator, AraC family  28.79 
 
 
320 aa  140  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1553  transcriptional regulator  28.29 
 
 
331 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.741987 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1857  AraC family transcriptional regulator  28.93 
 
 
338 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.18222 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5407  transcriptional regulator, AraC family  28.73 
 
 
313 aa  138  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.439375  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3467  AraC family transcriptional regulator  30.7 
 
 
323 aa  138  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4869  AraC family transcriptional regulator  28.1 
 
 
337 aa  136  4e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1643  transcriptional regulator, AraC family  26.64 
 
 
351 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.671722  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2704  AraC family transcriptional regulator  25.16 
 
 
322 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.561895  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4788  AraC family transcriptional regulator  28.46 
 
 
344 aa  134  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.139915  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2659  AraC family transcriptional regulator  28.46 
 
 
333 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0640  AraC family transcriptional regulator  25.16 
 
 
322 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2686  AraC family transcriptional regulator  24.06 
 
 
324 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4080  transcriptional regulator  25.27 
 
 
348 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6692  transcriptional regulator, AraC family  27.43 
 
 
313 aa  130  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.178977 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2046  AraC family transcriptional regulator  23.75 
 
 
324 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2657  AraC family transcriptional regulator  23.75 
 
 
324 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0449258  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8035  AraC family transcriptional regulator  28.9 
 
 
333 aa  129  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.511507  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2121  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 
341 aa  129  6e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2578  AraC family transcriptional regulator  25.47 
 
 
322 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0419  arac-family transcriptional regulator  26.15 
 
 
317 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000111496  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5985  transcriptional regulator  23.6 
 
 
334 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0571562 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2003  AraC family transcriptional regulator  28.06 
 
 
342 aa  128  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3529  AraC family transcriptional regulator  26.32 
 
 
336 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0051  transcriptional regulator  25.85 
 
 
323 aa  126  5e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.929929  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2375  AraC family transcriptional regulator  23.62 
 
 
351 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.229949  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0488  AraC family transcriptional regulator  26.48 
 
 
335 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3963  AraC family transcriptional regulator  26.48 
 
 
335 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7121  transcriptional activator FtrA  28.52 
 
 
328 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0749123  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3836  AraC family transcriptional regulator  26.48 
 
 
335 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3780  transcriptional regulator, AraC family  26.48 
 
 
335 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2051  transcriptional regulator, AraC family  26.07 
 
 
344 aa  124  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0974748 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  24.65 
 
 
319 aa  124  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2641  transcriptional activator FtrA  28.35 
 
 
322 aa  124  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>