More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_0226 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03930  excinuclease ABC subunit A  43.82 
 
 
940 aa  748    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.166439  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3934  excinuclease ABC, A subunit  43.82 
 
 
940 aa  748    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0546  excinuclease ABC, A subunit  45.42 
 
 
946 aa  798    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0457921  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2758  excinuclease ABC family protein  41.23 
 
 
1855 aa  739    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3325  excinuclease ABC, A subunit  46.23 
 
 
937 aa  827    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0483  excinuclease ABC subunit A  43.86 
 
 
944 aa  782    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000649364 
 
 
-
 
NC_002950  PG2210  excinuclease ABC, A subunit  51.66 
 
 
952 aa  941    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1010  excinuclease ABC subunit A  43.67 
 
 
954 aa  761    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0427  excinuclease ABC subunit A  45.48 
 
 
944 aa  781    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2694  excinuclease ABC, A subunit  42.34 
 
 
942 aa  734    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0916  excinuclease ABC, A subunit  44.74 
 
 
931 aa  766    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0420  excinuclease ABC subunit A  44.28 
 
 
954 aa  760    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.790766  normal  0.236129 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5271  excinuclease ABC subunit A  45.71 
 
 
958 aa  825    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0920  excinuclease ABC, A subunit  44.19 
 
 
943 aa  757    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1709  excinuclease ABC subunit A  44.56 
 
 
942 aa  753    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0152505  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1104  excinuclease ABC subunit A  44.2 
 
 
974 aa  751    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.807702  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4030  excinuclease ABC, A subunit  43.07 
 
 
950 aa  741    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0654  excinuclease ABC, A subunit  44.02 
 
 
992 aa  788    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5015  excinuclease ABC subunit A  45.61 
 
 
958 aa  823    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.93666  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4844  excinuclease ABC subunit A  45.61 
 
 
958 aa  823    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4859  excinuclease ABC subunit A  45.81 
 
 
958 aa  823    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0451  excinuclease ABC subunit A  43.92 
 
 
951 aa  759    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0427  excinuclease ABC subunit A  43.92 
 
 
951 aa  759    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4520  excinuclease ABC subunit A  44.07 
 
 
961 aa  788    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.308582 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1685  excinuclease ABC subunit A  42.98 
 
 
968 aa  748    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0473  excinuclease ABC subunit A  45.14 
 
 
941 aa  756    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.78914 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2024  excinuclease ABC subunit A  45.72 
 
 
945 aa  826    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.136428  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1323  excinuclease ABC subunit A  42.44 
 
 
980 aa  752    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0367  excinuclease ABC subunit A  43.49 
 
 
954 aa  739    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2710  excinuclease ABC subunit A  44.62 
 
 
1008 aa  789    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00698098 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0436  excinuclease ABC subunit A  43.96 
 
 
940 aa  751    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.64292  normal  0.354082 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1568  excinuclease ABC subunit A  45.23 
 
 
993 aa  762    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.524179  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3591  excinuclease ABC subunit A  42.6 
 
 
965 aa  751    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.240208  normal  0.0431372 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5051  excinuclease ABC subunit A  43.81 
 
 
944 aa  788    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0371407 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0087  excinuclease ABC, A subunit  46.21 
 
 
937 aa  819    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000141309  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0539  excinuclease ABC subunit A  47.15 
 
 
956 aa  860    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.111546  normal  0.557 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2317  excinuclease ABC subunit A  42.89 
 
 
976 aa  741    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.458787  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1301  excinuclease ABC subunit A  48.28 
 
 
942 aa  873    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0773804  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2691  excinuclease ABC subunit A  43.12 
 
 
987 aa  760    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0128  excinuclease ABC subunit A  45.7 
 
 
937 aa  815    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2486  excinuclease ABC subunit A  42.67 
 
 
926 aa  741    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000102064  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0324  excinuclease ABC, A subunit  43.36 
 
 
935 aa  749    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.71267  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5395  excinuclease ABC subunit A  45.61 
 
 
958 aa  823    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1804  excinuclease ABC subunit A  43.12 
 
 
967 aa  751    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0848  excinuclease ABC subunit A  41.59 
 
 
1003 aa  738    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.23949 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2229  excinuclease ABC, A subunit  44.7 
 
 
944 aa  772    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.748559  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1752  excinuclease ABC subunit A  45.76 
 
 
950 aa  778    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.72619  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0255  excinuclease ABC subunit A  46.12 
 
 
971 aa  806    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1127  excinuclease ABC subunit A  44.98 
 
 
966 aa  802    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1631  excinuclease ABC subunit A  42.77 
 
 
976 aa  764    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.978501  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2715  excinuclease ABC subunit A  44.39 
 
 
1011 aa  759    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.325053  normal  0.199737 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1192  excinuclease ABC subunit A  43.37 
 
 
970 aa  766    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.548367  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1160  excinuclease ABC, A subunit  43.28 
 
 
953 aa  747    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.216625  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0993  excinuclease ABC subunit A  42.81 
 
 
946 aa  756    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.883407  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2757  excinuclease ABC subunit A  45.06 
 
 
1001 aa  743    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.30708  normal  0.666672 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2426  excinuclease ABC subunit A  43.69 
 
 
939 aa  741    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.106022  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4108  excinuclease ABC subunit A  43.01 
 
 
957 aa  736    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1158  excinuclease ABC subunit A  44.74 
 
 
941 aa  809    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2758  excinuclease ABC subunit A  44.49 
 
 
1008 aa  762    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0448  excinuclease ABC subunit A  44.08 
 
 
957 aa  749    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.775809  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2081  excinuclease ABC subunit A  44.12 
 
 
1013 aa  752    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0851595  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1960  excinuclease ABC, A subunit  42.61 
 
 
968 aa  748    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0313  excinuclease ABC subunit A  43.65 
 
 
955 aa  738    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0776  excinuclease ABC subunit A  43.74 
 
 
981 aa  760    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.839433  normal  0.0723742 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2022  excinuclease ABC subunit A  46.13 
 
 
973 aa  855    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0926  excinuclease ABC subunit A  44 
 
 
967 aa  771    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.160818  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2988  excinuclease ABC subunit A  44.85 
 
 
973 aa  780    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2016  excinuclease ABC subunit A  45.61 
 
 
923 aa  754    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0146  excinuclease ABC, A subunit  44.34 
 
 
942 aa  749    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1396  excinuclease ABC subunit A  43.59 
 
 
970 aa  743    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.398652  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0158  excinuclease ABC subunit A  44.98 
 
 
947 aa  768    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.509879 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3698  excinuclease ABC subunit A  60.75 
 
 
944 aa  1135    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0337  excinuclease ABC subunit A  45.81 
 
 
939 aa  827    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0329  excinuclease ABC subunit A  45.81 
 
 
939 aa  825    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1128  excinuclease ABC subunit A  44.39 
 
 
943 aa  750    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0168519  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4529  excinuclease ABC subunit A  41.24 
 
 
1004 aa  747    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.388668 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3421  excinuclease ABC subunit A  42.9 
 
 
950 aa  738    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00603968  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0531  excinuclease ABC subunit A  42.9 
 
 
950 aa  738    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0391224  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3712  excinuclease ABC, A subunit  43.22 
 
 
953 aa  738    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0944752  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0252  excinuclease ABC (subunit A)  45.25 
 
 
942 aa  808    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00117135  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1885  excinuclease ABC subunit A  44.93 
 
 
957 aa  763    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.414426  normal  0.621255 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09180  excinuclease ABC subunit A  44.13 
 
 
945 aa  781    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.533075 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2009  excinuclease ABC subunit A  44 
 
 
943 aa  761    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.407568  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0374  excinuclease ABC subunit A  43.88 
 
 
952 aa  761    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1317  excinuclease ATPase subunit  44.5 
 
 
953 aa  771    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.133455  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0393  excinuclease ABC subunit A  42.98 
 
 
952 aa  738    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1722  excinuclease ABC subunit A  43.82 
 
 
941 aa  755    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2079  excinuclease ABC subunit A  44.73 
 
 
975 aa  773    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.224045  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3616  excinuclease ABC subunit A  44.86 
 
 
950 aa  790    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0557208 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3592  excinuclease ABC subunit A  43.11 
 
 
950 aa  742    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0287106  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1109  excinuclease ABC subunit A  44.5 
 
 
947 aa  809    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.57709  normal  0.229428 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3515  excinuclease ABC, A subunit  47.07 
 
 
954 aa  824    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000620303  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0517  excinuclease ABC subunit A  43.33 
 
 
962 aa  736    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.516633  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1939  excinuclease ABC subunit A  48.4 
 
 
950 aa  843    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0317613  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2524  excinuclease ABC subunit A  42.92 
 
 
1019 aa  771    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.247426  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0514  excinuclease ABC, A subunit  43.75 
 
 
942 aa  749    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3032  excinuclease ABC subunit A  44.85 
 
 
973 aa  780    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.69865 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0369  excinuclease ABC, A subunit  43.11 
 
 
945 aa  741    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3339  excinuclease ABC subunit A  44.18 
 
 
967 aa  772    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.818177 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0746  excinuclease ABC, A subunit  44.37 
 
 
940 aa  757    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>