More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_0191 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010830  Aasi_0191  30S ribosomal protein S3  100 
 
 		 240 aa  485  1e-136  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.339095 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4349  30S ribosomal protein S3  64.78 
 
 		 275 aa  327  9e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122787  normal  0.048354 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5781  ribosomal protein S3  63.52 
 
 		 302 aa  324  7e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.336905 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3156  30S ribosomal protein S3  68.06 
 
 		 254 aa  317  1e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.65741 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0391  30S ribosomal protein S3  63.13 
 
 		 252 aa  295  3e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0608  ribosomal protein S3  64.76 
 
 		 285 aa  291  8e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1932  30S ribosomal protein S3  58.33 
 
 		 246 aa  286  2e-76  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0848  ribosomal protein S3  58.99 
 
 		 249 aa  284  9e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1153  30S ribosomal protein S3  60.28 
 
 		 246 aa  283  2.0000000000000002e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000018962  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05745  putative 30S ribosomal protein S3  63.55 
 
 		 236 aa  278  4e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0959126  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1621  ribosomal protein S3  63.8 
 
 		 266 aa  271  6e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0221  30S ribosomal protein S3  57 
 
 		 221 aa  266  2e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649554  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0117  30S ribosomal protein S3  57.97 
 
 		 218 aa  259  2e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00121985  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0113  30S ribosomal protein S3  57 
 
 		 218 aa  258  7e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1518  ribosomal protein S3  55.56 
 
 		 220 aa  258  7e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.337721  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0110  30S ribosomal protein S3  56.52 
 
 		 219 aa  257  1e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000133483  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1346  ribosomal protein S3  49.56 
 
 		 395 aa  256  2e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0231  ribosomal protein S3  53.14 
 
 		 218 aa  255  3e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2705  ribosomal protein S3  53.12 
 
 		 226 aa  255  4e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.105872  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2909  SSU ribosomal protein S3P  54.59 
 
 		 226 aa  254  1.0000000000000001e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0116  30S ribosomal protein S3  56.04 
 
 		 219 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000978645  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0116  30S ribosomal protein S3  56.04 
 
 		 219 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000111227  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0112  30S ribosomal protein S3  56.04 
 
 		 219 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.8436400000000006e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0110  30S ribosomal protein S3  56.04 
 
 		 219 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000135438  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0116  30S ribosomal protein S3  56.04 
 
 		 219 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000165133  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0137  30S ribosomal protein S3  56.04 
 
 		 219 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000151619  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0128  30S ribosomal protein S3  56.04 
 
 		 219 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.11451e-61 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5189  30S ribosomal protein S3  56.04 
 
 		 219 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000094199  unclonable  1.62141e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0147  30S ribosomal protein S3  56.04 
 
 		 219 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000084584  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0111  30S ribosomal protein S3  56.04 
 
 		 219 aa  252  3e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000062196  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0292  30S ribosomal protein S3  55.56 
 
 		 220 aa  252  3e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0100891  normal  0.0448261 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2168  30S ribosomal protein S3  48.52 
 
 		 233 aa  252  4.0000000000000004e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000068862  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1477  30S ribosomal protein S3  51.39 
 
 		 221 aa  251  7e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000764619  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0428  30S ribosomal protein S3  54.59 
 
 		 219 aa  251  7e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00750639  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0219  30S ribosomal protein S3  49.79 
 
 		 230 aa  251  8.000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000284252  unclonable  0.00000795871 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0237  30S ribosomal protein S3  50.63 
 
 		 230 aa  251  9.000000000000001e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0205  30S ribosomal protein S3  50.63 
 
 		 230 aa  251  9.000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000415064  unclonable  0.0000000000217557 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0200  30S ribosomal protein S3  50.63 
 
 		 230 aa  251  9.000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00835555  hitchhiker  0.00166911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0205  30S ribosomal protein S3  50.63 
 
 		 230 aa  251  9.000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000069447  hitchhiker  0.00000000149632 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03165  30S ribosomal protein S3  48.95 
 
 		 233 aa  250  1e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00374176  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0399  ribosomal protein S3  48.95 
 
 		 233 aa  250  1e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000257024  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3703  30S ribosomal protein S3  48.95 
 
 		 233 aa  250  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00180602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3630  30S ribosomal protein S3  48.95 
 
 		 233 aa  250  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0724577  normal  0.691725 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3508  30S ribosomal protein S3  48.95 
 
 		 233 aa  250  1e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538349  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0399  30S ribosomal protein S3  48.95 
 
 		 233 aa  250  1e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000141068  hitchhiker  0.0000729403 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3609  30S ribosomal protein S3  48.95 
 
 		 233 aa  250  1e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000291269  normal  0.0112128 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03116  hypothetical protein  48.95 
 
 		 233 aa  250  1e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00261004  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3745  30S ribosomal protein S3  48.95 
 
 		 233 aa  250  1e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000025032  hitchhiker  0.00113301 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3801  30S ribosomal protein S3  48.95 
 
 		 233 aa  250  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0443981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4637  30S ribosomal protein S3  48.95 
 
 		 233 aa  250  1e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00278022  normal  0.0942567 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3630  30S ribosomal protein S3  48.95 
 
 		 233 aa  250  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000937087  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3699  30S ribosomal protein S3  48.95 
 
 		 233 aa  250  1e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000153229  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0475  30S ribosomal protein S3  49.35 
 
 		 232 aa  250  1e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00134596  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001736  SSU ribosomal protein S3p (S3e)  48.95 
 
 		 232 aa  250  1e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000123717  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3797  30S ribosomal protein S3  48.95 
 
 		 233 aa  250  1e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000046077  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3738  30S ribosomal protein S3  48.95 
 
 		 233 aa  250  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.338082  normal  0.0279522 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0064  30S ribosomal protein S3  54.11 
 
 		 217 aa  249  2e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00697995  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0176  30S ribosomal protein S3  54.59 
 
 		 229 aa  250  2e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000179507  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0297  30S ribosomal protein S3  52.97 
 
 		 222 aa  250  2e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.5955900000000001e-28 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00736  30S ribosomal protein S3  48.95 
 
 		 232 aa  249  2e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0154  30S ribosomal protein S3  55.07 
 
 		 229 aa  249  3e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000551432  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2271  30S ribosomal protein S3  53.62 
 
 		 217 aa  248  4e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000428524  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2312  30S ribosomal protein S3  53.62 
 
 		 217 aa  248  4e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000168649  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0326  30S ribosomal protein S3  50.88 
 
 		 232 aa  248  4e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0364603  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3816  30S ribosomal protein S3  48.52 
 
 		 233 aa  248  8e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000890302  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3995  30S ribosomal protein S3  48.52 
 
 		 233 aa  248  8e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000204898  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01230  ribosomal protein S3  51.69 
 
 		 214 aa  247  9e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.845852  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0065  30S ribosomal protein S3  48.12 
 
 		 235 aa  248  9e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0358705  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3753  30S ribosomal protein S3  49.79 
 
 		 230 aa  247  1e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131663  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0411  30S ribosomal protein S3  48.1 
 
 		 233 aa  247  1e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0239377  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4050  30S ribosomal protein S3  49.79 
 
 		 230 aa  247  1e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000595874  unclonable  0.00000000000714498 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0329  30S ribosomal protein S3  48.1 
 
 		 233 aa  247  1e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000157005  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4164  30S ribosomal protein S3  49.79 
 
 		 230 aa  247  1e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000278564  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3518  ribosomal protein S3  49.14 
 
 		 230 aa  247  1e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000668296  hitchhiker  0.00000107065 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0992  30S ribosomal protein S3  49.3 
 
 		 237 aa  247  1e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0174099 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0202  30S ribosomal protein S3  49.79 
 
 		 230 aa  247  1e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000360171  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0206  30S ribosomal protein S3  49.79 
 
 		 230 aa  247  1e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000455667  unclonable  0.00000997439 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1825  30S ribosomal protein S3  53.14 
 
 		 217 aa  246  2e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.652235  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0873  30S ribosomal protein S3  54.03 
 
 		 221 aa  246  2e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000095133  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0289  30S ribosomal protein S3  47.68 
 
 		 232 aa  246  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000655466  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0590  30S ribosomal protein S3  47.68 
 
 		 232 aa  246  2e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000336971  normal  0.465615 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1436  30S ribosomal protein S3  48.37 
 
 		 243 aa  246  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0795815  normal  0.0645739 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1672  30S ribosomal protein S3  48.84 
 
 		 235 aa  246  2e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.356257  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2396  30S ribosomal protein S3  54.11 
 
 		 217 aa  247  2e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0132783  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3909  30S ribosomal protein S3  47.68 
 
 		 232 aa  246  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000178804  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1338  30S ribosomal protein S3  48.37 
 
 		 243 aa  246  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0464681  normal  0.115598 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1620  30S ribosomal protein S3  48.89 
 
 		 249 aa  246  3e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.446751  normal  0.331477 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0255  30S ribosomal protein S3  50.72 
 
 		 239 aa  246  3e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0367  30S ribosomal protein S3  51.2 
 
 		 238 aa  245  4e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1722  30S ribosomal protein S3  51.2 
 
 		 238 aa  245  4e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.094862  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0288  30S ribosomal protein S3  50.72 
 
 		 240 aa  245  4e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3332  30S ribosomal protein S3  52.86 
 
 		 256 aa  245  4.9999999999999997e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000390716  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0164  30S ribosomal protein S3  52.66 
 
 		 229 aa  244  6e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000022982  decreased coverage  0.0000484078 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1901  30S ribosomal protein S3  53.14 
 
 		 217 aa  244  6e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.563087  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4538  30S ribosomal protein S3  47.68 
 
 		 232 aa  244  6e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472984  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0765  30S ribosomal protein S3  48.48 
 
 		 240 aa  244  6e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0970425  normal  0.512197 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0343  ribosomal protein S3  50.67 
 
 		 227 aa  244  6.999999999999999e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000438385  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1848  SSU ribosomal protein S3P  50.67 
 
 		 227 aa  244  6.999999999999999e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00165537  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0843  30S ribosomal protein S3  54.59 
 
 		 228 aa  244  6.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.401464  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08910  30S ribosomal protein S3  54.59 
 
 		 228 aa  244  6.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0180544 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>