More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_0180 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010830  Aasi_0180  30S ribosomal protein S5  100 
 
 
171 aa  336  9.999999999999999e-92  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.280256 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0619  30S ribosomal protein S5  67.47 
 
 
172 aa  226  1e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.797529 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05805  30S ribosomal protein S5  59.64 
 
 
174 aa  212  1.9999999999999998e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1164  30S ribosomal protein S5  60.84 
 
 
174 aa  210  5.999999999999999e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00523189  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1632  ribosomal protein S5  62.8 
 
 
172 aa  209  1e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0380  30S ribosomal protein S5  59.64 
 
 
173 aa  208  4e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0859  ribosomal protein S5  63.87 
 
 
182 aa  205  2e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0643  30S ribosomal protein S5  65.19 
 
 
162 aa  203  1e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000275279  hitchhiker  0.000000114757 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2840  30S ribosomal protein S5  64.56 
 
 
162 aa  201  3e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.122031  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2212  30S ribosomal protein S5  59.39 
 
 
172 aa  198  3e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000015537  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1507  ribosomal protein S5  59.88 
 
 
173 aa  198  3.9999999999999996e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.360692  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1921  30S ribosomal protein S5  56.63 
 
 
172 aa  197  6e-50  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2406  30S ribosomal protein S5  59.51 
 
 
172 aa  196  9e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0326698  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5770  ribosomal protein S5  68.71 
 
 
172 aa  195  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.864281  normal  0.931759 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2279  30S ribosomal protein S5  59.88 
 
 
172 aa  195  3e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000167346  hitchhiker  0.00339787 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2694  ribosomal protein S5  61.73 
 
 
164 aa  195  3e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0306  30S ribosomal protein S5  58.54 
 
 
172 aa  194  7e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0963107  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0697  30S ribosomal protein S5  60.76 
 
 
162 aa  193  8.000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2047  30S ribosomal protein S5  57.32 
 
 
172 aa  193  8.000000000000001e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0164309  normal  0.432227 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4360  30S ribosomal protein S5  66.87 
 
 
171 aa  193  1e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000388544  normal  0.0804567 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3145  30S ribosomal protein S5  66.87 
 
 
172 aa  193  1e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00134617  normal  0.549276 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1834  30S ribosomal protein S5  57.58 
 
 
172 aa  192  2e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.459272  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1363  30S ribosomal protein S5  60.13 
 
 
162 aa  192  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00227785  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0198  30S ribosomal protein S5  56.8 
 
 
171 aa  191  3e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.136971  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3311  30S ribosomal protein S5  61.39 
 
 
162 aa  189  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000304124 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1083  30S ribosomal protein S5  60.13 
 
 
162 aa  189  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.237908  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0950  30S ribosomal protein S5  61.39 
 
 
162 aa  189  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00386761  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1243  30S ribosomal protein S5  55.03 
 
 
169 aa  187  4e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00969773  hitchhiker  0.0030984 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2443  30S ribosomal protein S5  61.11 
 
 
166 aa  187  5e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.995236 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0718  30S ribosomal protein S5  57.5 
 
 
163 aa  187  8e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.160468  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01340  ribosomal protein S5  60.37 
 
 
166 aa  186  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.162816  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0303  30S ribosomal protein S5  56.44 
 
 
166 aa  182  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000149284  normal  0.159424 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0232  30S ribosomal protein S5  58.64 
 
 
166 aa  181  3e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010623  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3007  30S ribosomal protein S5  56.1 
 
 
179 aa  181  4.0000000000000006e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.137174  hitchhiker  0.00889655 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0124  30S ribosomal protein S5  58.02 
 
 
166 aa  180  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0439  30S ribosomal protein S5  56.79 
 
 
166 aa  177  4.999999999999999e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0211  SSU ribosomal protein S5P  59.15 
 
 
168 aa  177  5.999999999999999e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.102513  normal  0.321891 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0579  30S ribosomal protein S5  57.69 
 
 
210 aa  177  7e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.898965  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1357  ribosomal protein S5  55.36 
 
 
197 aa  177  8e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09830  SSU ribosomal protein S5P  57.96 
 
 
173 aa  176  1e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0111363  hitchhiker  0.0000146915 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1928  30S ribosomal protein S5  60.65 
 
 
168 aa  176  1e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.69161 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0121  30S ribosomal protein S5  56.79 
 
 
166 aa  176  1e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2920  30S ribosomal protein S5  58.02 
 
 
166 aa  176  1e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000379873  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3888  SSU ribosomal protein S5P  59.87 
 
 
205 aa  176  1e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.361  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0128  30S ribosomal protein S5  56.79 
 
 
166 aa  176  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0242  ribosomal protein S5  55.49 
 
 
168 aa  176  2e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.529563  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1168  30S ribosomal protein S5  58.18 
 
 
180 aa  175  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0459782  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1202  30S ribosomal protein S5  61.84 
 
 
208 aa  176  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.672112  normal  0.0445875 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5141  ribosomal protein S5  58.97 
 
 
200 aa  175  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.675999 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1572  ribosomal protein S5  53.42 
 
 
166 aa  176  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0532593  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1748  30S ribosomal protein S5  54.72 
 
 
163 aa  174  4e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.749725  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4009  30S ribosomal protein S5  57.58 
 
 
180 aa  174  7e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000876107  hitchhiker  0.0000786108 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0127  30S ribosomal protein S5  56.79 
 
 
166 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00181316  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0127  30S ribosomal protein S5  56.79 
 
 
166 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000033601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0123  30S ribosomal protein S5  56.79 
 
 
166 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000320585  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0121  30S ribosomal protein S5  56.79 
 
 
166 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000828927  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0148  30S ribosomal protein S5  56.79 
 
 
166 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000129671  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0127  30S ribosomal protein S5  56.79 
 
 
166 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0304335  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0139  30S ribosomal protein S5  56.79 
 
 
166 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.93712e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0158  30S ribosomal protein S5  56.79 
 
 
166 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000826666  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5178  30S ribosomal protein S5  56.79 
 
 
166 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000595354  unclonable  1.58877e-25 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0323  SSU ribosomal protein S5P  56.6 
 
 
199 aa  173  9.999999999999999e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00179129 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0775  30S ribosomal protein S5  58.97 
 
 
167 aa  173  9.999999999999999e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000409593  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1950  30S ribosomal protein S5  59.35 
 
 
169 aa  172  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0725  ribosomal protein S5  55.06 
 
 
165 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.104359  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2629  30S ribosomal protein S5  57.69 
 
 
200 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.192925  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0096  30S ribosomal protein S5  51.57 
 
 
163 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0990487 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0122  30S ribosomal protein S5  56.17 
 
 
166 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00008348  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2035  30S ribosomal protein S5  59.35 
 
 
169 aa  172  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34488  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2959  30S ribosomal protein S5  56.13 
 
 
236 aa  172  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0103501  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2671  30S ribosomal protein S5  56.13 
 
 
238 aa  171  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1929  30S ribosomal protein S5  58.71 
 
 
169 aa  171  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0230  30S ribosomal protein S5  54.19 
 
 
168 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000259388  unclonable  0.00000856318 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0175  30S ribosomal protein S5  52.12 
 
 
167 aa  171  5e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000490298  decreased coverage  0.0000558993 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0884  30S ribosomal protein S5  56.1 
 
 
167 aa  171  5e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.560186  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1728  30S ribosomal protein S5  55.76 
 
 
168 aa  171  5e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000123427  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5030  30S ribosomal protein S5  55.48 
 
 
222 aa  170  6.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00000382419  normal  0.598493 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0864  SSU ribosomal protein S5P  54.66 
 
 
177 aa  170  6.999999999999999e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0107209  hitchhiker  0.00625642 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2697  30S ribosomal protein S5  57.41 
 
 
165 aa  170  7.999999999999999e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2382  30S ribosomal protein S5  57.41 
 
 
165 aa  170  7.999999999999999e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1061  30S ribosomal protein S5  54.84 
 
 
223 aa  170  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.000257421  normal  0.422171 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4304  ribosomal protein S5  58.06 
 
 
205 aa  169  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2240  30S ribosomal protein S5  52.2 
 
 
163 aa  169  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.109311  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0599  30S ribosomal protein S5  58.44 
 
 
202 aa  169  1e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1032  30S ribosomal protein S5  54.84 
 
 
223 aa  170  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00000681641  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1049  30S ribosomal protein S5  54.84 
 
 
223 aa  170  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00405345  normal  0.132345 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0732  ribosomal protein S5  55.62 
 
 
190 aa  170  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6032  30S ribosomal protein S5  58.44 
 
 
202 aa  169  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2161  ribosomal protein S5  54.14 
 
 
175 aa  169  2e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0929942  normal  0.978944 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2757  30S ribosomal protein S5  51.9 
 
 
163 aa  169  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0511806  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3988  ribosomal protein S5  56.77 
 
 
166 aa  169  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0501123  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0248  30S ribosomal protein S5  50.91 
 
 
167 aa  168  3e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0187  30S ribosomal protein S5  52.9 
 
 
167 aa  168  3e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000820766  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0216  30S ribosomal protein S5  50.91 
 
 
167 aa  168  3e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000901319  unclonable  0.0000000000154128 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0211  30S ribosomal protein S5  50.91 
 
 
167 aa  168  3e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0010203  hitchhiker  0.00711343 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0165  30S ribosomal protein S5  52.9 
 
 
167 aa  168  3e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000786846  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0216  30S ribosomal protein S5  50.91 
 
 
167 aa  168  3e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000281151  hitchhiker  0.00000000127878 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1339  30S ribosomal protein S5  55.92 
 
 
225 aa  168  4e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000696393  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3742  30S ribosomal protein S5  52.9 
 
 
167 aa  167  5e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000003426  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10735  30S ribosomal protein S5  54.19 
 
 
220 aa  167  5e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000927793  normal  0.43056 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>