More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_0138 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010830  Aasi_0138  transcription elongation factor NusA  100 
 
 		 411 aa  814    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1214  NusA antitermination factor  67.63 
 
 		 414 aa  576  1.0000000000000001e-163  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.75759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0033  transcription elongation factor NusA  66.83 
 
 		 413 aa  552  1e-156  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.122242  normal  0.232116 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3421  transcription elongation factor NusA  63.64 
 
 		 418 aa  541  1e-153  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0140  transcription elongation factor NusA  60.53 
 
 		 411 aa  492  9.999999999999999e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0652  transcription elongation factor NusA  55.9 
 
 		 415 aa  463  1e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.020983  normal  0.100842 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01340  transcription elongation factor NusA  56.76 
 
 		 410 aa  460  9.999999999999999e-129  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1629  transcription elongation factor NusA  55.4 
 
 		 417 aa  455  1e-127  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1262  transcription elongation factor NusA  55.58 
 
 		 410 aa  452  1.0000000000000001e-126  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0254  transcription elongation factor NusA  51.7 
 
 		 444 aa  404  1e-111  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1308  NusA antitermination factor  49.64 
 
 		 421 aa  385  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17701  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0366  transcription elongation factor NusA  42.36 
 
 		 517 aa  254  2.0000000000000002e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000647313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0401  transcription elongation factor NusA  40.33 
 
 		 521 aa  249  4e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000166  normal  0.293714 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1227  transcription elongation factor NusA  37.75 
 
 		 449 aa  248  1e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000158035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1463  transcription elongation factor NusA  41.48 
 
 		 527 aa  244  3e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0965243  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0368  transcription elongation factor NusA  40.46 
 
 		 518 aa  242  1e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00190694  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0299  transcription elongation factor NusA  40.76 
 
 		 513 aa  241  1e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000558254  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1780  transcription elongation factor NusA  40.36 
 
 		 553 aa  241  2e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0199707  normal  0.0564295 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3928  transcription elongation factor NusA  38.42 
 
 		 534 aa  238  1e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0397  transcription elongation factor NusA  40.16 
 
 		 514 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00167375  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2163  transcription elongation factor NusA  38.42 
 
 		 537 aa  234  2.0000000000000002e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2075  transcription elongation factor NusA  38.42 
 
 		 537 aa  234  2.0000000000000002e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0749  transcription elongation factor NusA  38.01 
 
 		 535 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1049  NusA antitermination factor  37.1 
 
 		 538 aa  232  8.000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3729  NusA antitermination factor  35.35 
 
 		 506 aa  231  2e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00128644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3626  NusA antitermination factor  36.73 
 
 		 536 aa  229  9e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475474 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1899  transcription elongation factor NusA  35.73 
 
 		 383 aa  228  1e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000368219  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0961  transcription elongation factor NusA  37.31 
 
 		 401 aa  227  2e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.462921  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1252  transcription elongation factor NusA  39.46 
 
 		 537 aa  227  3e-58  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0233  transcription elongation factor NusA  35.16 
 
 		 540 aa  227  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.157572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1667  transcription elongation factor NusA  37.01 
 
 		 385 aa  226  6e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1432  NusA antitermination factor  35.14 
 
 		 373 aa  226  6e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000109855  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1300  transcription elongation factor NusA  34.64 
 
 		 383 aa  226  7e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000861889  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2983  transcription elongation factor NusA  34.64 
 
 		 382 aa  226  7e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0049800000000001e-28 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07820  NusA antitermination factor  36.66 
 
 		 377 aa  225  9e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0478  transcription elongation factor NusA  35.16 
 
 		 541 aa  225  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.779193  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1665  NusA antitermination factor  35.57 
 
 		 365 aa  225  1e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000721447  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2699  transcription termination factor NusA  37.32 
 
 		 545 aa  224  2e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.311383  normal  0.577361 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2412  transcription elongation factor NusA  33.33 
 
 		 441 aa  224  2e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.659924  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2755  transcription elongation factor NusA  37.39 
 
 		 534 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0382786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2297  NusA antitermination factor  36.44 
 
 		 532 aa  224  2e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0358902 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2925  NusA antitermination factor  36.19 
 
 		 545 aa  224  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624825  normal  0.0501763 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3036  transcription elongation factor NusA  37.03 
 
 		 475 aa  224  2e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00201036  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0994  NusA antitermination factor  37.36 
 
 		 404 aa  224  2e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000558995  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1584  transcription elongation factor NusA  36.12 
 
 		 381 aa  224  3e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0442  transcription elongation factor NusA  35.28 
 
 		 537 aa  224  3e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1586  transcription elongation factor NusA  34.72 
 
 		 385 aa  223  4e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00876176  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4616  NusA antitermination factor  37.03 
 
 		 536 aa  223  4e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0831604  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0029  transcription elongation factor NusA  35.36 
 
 		 536 aa  223  4e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1047  transcription elongation factor NusA  38.53 
 
 		 344 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000699393  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2821  NusA antitermination factor  37.03 
 
 		 560 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.143768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0598  transcription elongation factor NusA  35.36 
 
 		 539 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0055  transcription elongation factor NusA  34.99 
 
 		 537 aa  223  6e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.255127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4069  transcription elongation factor NusA  36.15 
 
 		 535 aa  220  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0295  transcription elongation factor NusA  36.07 
 
 		 531 aa  221  3e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0917388  normal  0.0106159 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2613  NusA antitermination factor  36.73 
 
 		 544 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.109477  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0022  transcription elongation factor NusA  34.78 
 
 		 538 aa  220  3.9999999999999997e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0361846 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0166  transcription elongation factor NusA  36.05 
 
 		 538 aa  219  6e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.590136  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1065  transcription elongation factor NusA  37.65 
 
 		 344 aa  219  7e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123432  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4389  transcription elongation factor NusA  35.86 
 
 		 533 aa  219  7e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1163  transcription elongation factor NusA  37.28 
 
 		 535 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.605286  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3779  transcription elongation factor NusA  35.73 
 
 		 516 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.530973  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2824  transcription elongation factor NusA  37.28 
 
 		 535 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3439  transcription elongation factor NusA  36.36 
 
 		 552 aa  219  8.999999999999998e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.787039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3729  NusA antitermination factor  36.44 
 
 		 545 aa  218  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0217708 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1553  transcription elongation factor NusA  33.89 
 
 		 406 aa  218  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.02973e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1047  NusA antitermination factor  33.82 
 
 		 362 aa  218  2e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000154988  unclonable  0.0000000137146 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0223  transcription elongation factor NusA  36.86 
 
 		 506 aa  217  2e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4218  NusA antitermination factor  31.39 
 
 		 534 aa  217  2e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000184689  normal  0.152678 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0497  transcription elongation factor NusA  35.53 
 
 		 440 aa  218  2e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3819  transcription elongation factor NusA  35.82 
 
 		 529 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0301891 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2492  transcription elongation factor NusA  36.12 
 
 		 544 aa  217  4e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0183695  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0735  transcription elongation factor NusA  38.73 
 
 		 344 aa  216  4e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000302084  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1441  NusA antitermination factor  36.75 
 
 		 380 aa  216  5.9999999999999996e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0429547  normal  0.129125 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0897  transcription elongation factor NusA  34.07 
 
 		 378 aa  216  7e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0054777  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0610  transcription elongation factor NusA  34.63 
 
 		 548 aa  215  9.999999999999999e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.131908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0607  NusA antitermination factor  36.56 
 
 		 433 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457156  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3679  NusA antitermination factor  35 
 
 		 493 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000224558  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2910  transcription elongation factor NusA  35.19 
 
 		 538 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2431  transcription elongation factor NusA  36.1 
 
 		 428 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.786529  normal  0.585225 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0666  NusA antitermination factor  33.25 
 
 		 463 aa  214  2.9999999999999995e-54  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0123778 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1648  transcription elongation factor NusA  35.57 
 
 		 346 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000247005  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3191  transcription elongation factor NusA  34.99 
 
 		 381 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000141994  normal  0.115207 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0061  transcription elongation factor NusA  33.7 
 
 		 449 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.941395  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1134  NusA antitermination factor  35.5 
 
 		 442 aa  213  3.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000746814  normal  0.939177 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0473  NusA antitermination factor  35.59 
 
 		 444 aa  213  4.9999999999999996e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000679634  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3561  transcription elongation factor NusA  35.67 
 
 		 544 aa  212  7e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3161  transcription elongation factor NusA  33.79 
 
 		 429 aa  212  1e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00111335  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1152  transcription elongation factor NusA  32.95 
 
 		 382 aa  212  1e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000162475  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3749  NusA antitermination factor  35.61 
 
 		 442 aa  211  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00409142  unclonable  0.0000152852 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0912  NusA antitermination factor  34.43 
 
 		 372 aa  210  3e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1107  transcription elongation factor NusA  39.15 
 
 		 495 aa  210  4e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3855  NusA antitermination factor  34.54 
 
 		 538 aa  209  6e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0719337  normal  0.0942338 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3041  transcription elongation factor NusA  34.9 
 
 		 572 aa  209  6e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2044  transcription elongation factor NusA  32.85 
 
 		 383 aa  209  8e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0530  transcription elongation factor NusA  37.24 
 
 		 341 aa  208  1e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2515  transcription elongation factor NusA  34.51 
 
 		 443 aa  208  1e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0031  transcription elongation factor NusA  35.48 
 
 		 568 aa  208  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.351795 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0811  transcription elongation factor NusA  32.51 
 
 		 423 aa  208  1e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000010954  hitchhiker  0.00234388 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1960  transcription elongation factor NusA  34.4 
 
 		 384 aa  208  2e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0055359  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>