More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_0108 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010830  Aasi_0108  50S ribosomal protein L27  100 
 
 
87 aa  174  4e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1625  ribosomal protein L27  72.62 
 
 
143 aa  125  1e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.388698 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2785  50S ribosomal protein L27  69.88 
 
 
89 aa  125  2e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0242571  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3460  50S ribosomal protein L27  71.08 
 
 
89 aa  125  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159862  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1051  50S ribosomal protein L27  69.88 
 
 
89 aa  124  4e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212456  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1781  50S ribosomal protein L27  67.44 
 
 
89 aa  124  4e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.810643  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1461  50S ribosomal protein L27  67.44 
 
 
89 aa  124  4e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0317862 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0310  50S ribosomal protein L27  69.05 
 
 
89 aa  124  4e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1849  50S ribosomal protein L27  67.44 
 
 
89 aa  124  4e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3006  50S ribosomal protein L27  71.08 
 
 
89 aa  124  5e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.549132 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1682  50S ribosomal protein L27  65.91 
 
 
90 aa  123  9e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  2.49957e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0497  50S ribosomal protein L27  65.91 
 
 
90 aa  123  1e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  3.67607e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0454  50S ribosomal protein L27  66.28 
 
 
89 aa  123  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4883  ribosomal protein L27  67.47 
 
 
92 aa  122  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.113157  normal  0.111687 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3207  ribosomal protein L27  72.94 
 
 
85 aa  121  4e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4102  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 
90 aa  121  4e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.500877 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3870  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 
89 aa  120  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.403314  normal  0.0137956 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4194  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 
89 aa  120  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0417  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 
91 aa  120  8e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.302693 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2480  ribosomal protein L27  67.86 
 
 
100 aa  119  1e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.782187  normal  0.22295 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0152  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 
90 aa  119  1e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.670785  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1482  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 
93 aa  118  2e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4287  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 
90 aa  119  2e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.835773  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2281  50S ribosomal protein L27  65.12 
 
 
89 aa  119  2e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.350544  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2006  ribosomal protein L27  67.44 
 
 
86 aa  118  2e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.962508  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001672  LSU ribosomal protein L27p  70.24 
 
 
85 aa  118  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  2.26464e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00801  50S ribosomal protein L27  70.24 
 
 
85 aa  118  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3282  50S ribosomal protein L27  69.14 
 
 
91 aa  117  5e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0455195 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4211  50S ribosomal protein L27  63.95 
 
 
93 aa  117  6e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.121619 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0846  50S ribosomal protein L27  67.44 
 
 
86 aa  116  1e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40780  50S ribosomal protein L27  69.41 
 
 
85 aa  115  1e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2247  50S ribosomal protein L27  69.41 
 
 
85 aa  116  1e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  4.79005e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2854  50S ribosomal protein L27  67.44 
 
 
86 aa  116  1e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  2.34792e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0362  50S ribosomal protein L27  69.05 
 
 
85 aa  116  1e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000249852  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2143  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 
90 aa  116  1e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.672881 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0232  50S ribosomal protein L27  62.65 
 
 
89 aa  116  1e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0865  50S ribosomal protein L27  69.05 
 
 
87 aa  116  1e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.437144  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0930  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 
89 aa  116  1e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3892  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 
89 aa  116  1e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.624543  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0515  50S ribosomal protein L27  62.79 
 
 
90 aa  115  2e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3800  50S ribosomal protein L27  60.47 
 
 
89 aa  115  2e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3188  50S ribosomal protein L27  64.63 
 
 
89 aa  115  2e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.263255  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0440  50S ribosomal protein L27  63.95 
 
 
90 aa  114  3e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.944777  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0247  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 
89 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0870  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 
84 aa  114  3e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  5.45576e-07  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1201  50S ribosomal protein L27  60.47 
 
 
89 aa  114  4e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.862516  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1009  50S ribosomal protein L27  68.24 
 
 
85 aa  114  4e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  9.11893e-12  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1037  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 
84 aa  114  5e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  9.11721e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3322  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 
84 aa  114  5e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  1.82867e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0955  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 
84 aa  114  5e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.455715  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0968  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 
84 aa  114  5e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  1.60226e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1070  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 
84 aa  114  5e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  1.53229e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4724  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 
88 aa  114  6e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0668122  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0853  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 
84 aa  113  7e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  1.52445e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3975  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 
85 aa  112  1e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  2.19143e-12  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3512  50S ribosomal protein L27  58.14 
 
 
89 aa  112  1e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3218  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 
84 aa  112  1e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  2.70517e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0980  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 
84 aa  112  1e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  1.10997e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3611  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 
85 aa  112  1e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  7.11047e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2828  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 
84 aa  113  1e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  1.13295e-07  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0588  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 
90 aa  113  1e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02725  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 
86 aa  112  1e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3820  50S ribosomal protein L27  58.14 
 
 
89 aa  112  1e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.360985  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1241  50S ribosomal protein L27  65.43 
 
 
85 aa  112  1e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.572861  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3651  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 
84 aa  112  1e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3088  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 
84 aa  113  1e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3756  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 
85 aa  112  1e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  1.37777e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4921  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 
88 aa  112  2e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0271507  normal  0.71556 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4413  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 
88 aa  112  2e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3124  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 
84 aa  112  2e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000107863  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3196  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 
85 aa  112  2e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  8.40306e-15  unclonable  7.87501e-24 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0559  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 
85 aa  112  2e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00191418  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3471  50S ribosomal protein L27  60.92 
 
 
87 aa  112  2e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00282639  normal  0.386116 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3359  ribosomal protein L27  68.29 
 
 
85 aa  112  2e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000421163  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4876  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 
88 aa  112  2e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.387156 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2926  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 
84 aa  112  2e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  3.09766e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0193  50S ribosomal protein L27  64.2 
 
 
90 aa  112  2e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.451706 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0896  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 
84 aa  112  2e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  8.37185e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0195  50S ribosomal protein L27  67.86 
 
 
86 aa  112  2e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000826463  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0315  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 
85 aa  112  2e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.385897 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2217  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 
91 aa  112  2e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.856627  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1005  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 
84 aa  112  2e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  8.76711e-06  decreased coverage  3.56458e-06 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3235  50S ribosomal protein L27  67.86 
 
 
85 aa  112  2e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000158281  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2042  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 
89 aa  112  2e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.20995 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0154  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 
90 aa  111  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1415  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 
85 aa  111  3e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0424  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 
92 aa  111  4e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.85685  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03730  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 
85 aa  110  4e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  3.22672e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0794  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 
85 aa  111  4e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  2.03934e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4511  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 
85 aa  111  4e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0238  ribosomal protein L27  64.29 
 
 
87 aa  110  5e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3478  ribosomal protein L27  67.07 
 
 
85 aa  110  6e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  6.53762e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1466  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 
86 aa  110  7e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.55318  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0213  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 
86 aa  110  8e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.280528 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0474  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 
85 aa  110  8e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  5.37628e-11  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0526  50S ribosomal protein L27  68.29 
 
 
85 aa  110  8e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3670  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 
85 aa  109  1e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  9.67389e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3481  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 
85 aa  109  1e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  4.91459e-09  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0269  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 
85 aa  109  1e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.876975  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0515  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 
85 aa  109  1e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  7.94781e-06  normal  0.0169565 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>