More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_0107 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010830  Aasi_0107  50S ribosomal protein L21  100 
 
 
103 aa  206  7e-53  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1465  50S ribosomal protein L21  53.92 
 
 
208 aa  124  3e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4884  ribosomal protein L21  54.9 
 
 
103 aa  118  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.125132  normal  0.112158 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02720  50S ribosomal protein L21  53.47 
 
 
224 aa  115  1.9999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  51.49 
 
 
104 aa  108  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1545  50S ribosomal protein L21  57.43 
 
 
147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4338  50S ribosomal protein L21  50.5 
 
 
103 aa  106  9.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  2.9959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0528  LSU ribosomal protein L21P  46.53 
 
 
105 aa  102  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000314721  normal  0.0648097 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 
103 aa  100  9e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2551  50S ribosomal protein L21  50.5 
 
 
102 aa  99.8  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000316052  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2238  ribosomal protein L21  44.12 
 
 
104 aa  99.4  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0929508  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2542  50S ribosomal protein L21  49.5 
 
 
102 aa  97.8  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107252  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0453  50S ribosomal protein L21  53.47 
 
 
102 aa  97.4  5e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0898  ribosomal protein L21  44.55 
 
 
103 aa  97.1  7e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000121247  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2481  ribosomal protein L21  53.4 
 
 
105 aa  97.1  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.726202  normal  0.224153 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0908  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 
102 aa  97.1  8e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2182  ribosomal protein L21  43.56 
 
 
103 aa  97.1  8e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.035762  normal  0.921653 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4536  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 
102 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000024347  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3159  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 
102 aa  95.5  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000681834  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4577  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 
102 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2692  50S ribosomal protein L21P  45.54 
 
 
149 aa  95.1  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00184818  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1624  ribosomal protein L21  51.49 
 
 
103 aa  94.7  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.511326 
 
 
-
 
NC_002950  PG0314  50S ribosomal protein L21  46.67 
 
 
105 aa  94.4  4e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.396717 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1113  ribosomal protein L21  51.96 
 
 
118 aa  94.4  5e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.582987  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001673  LSU ribosomal protein L21p  44.55 
 
 
103 aa  94.4  5e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000280256  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  39.6 
 
 
104 aa  94.4  5e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2058  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 
102 aa  94  6e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.550778  normal  0.848803 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2853  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 
103 aa  93.6  7e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000634591  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00800  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 
103 aa  93.6  7e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3315  ribosomal protein L21  47.06 
 
 
103 aa  93.6  9e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000262091  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4342  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 
102 aa  92.8  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000792007  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4178  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 
102 aa  92.8  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4189  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 
102 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000221763  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4524  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 
102 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.227549 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4290  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 
102 aa  92.8  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000204563  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4676  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 
102 aa  92.8  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000541425  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0672  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 
102 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058928  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0361  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 
103 aa  92.8  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000287252  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1380  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 
102 aa  92.8  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4562  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 
102 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0525  ribosomal protein L21  42.57 
 
 
103 aa  92  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60460  50S ribosomal protein L21  39.6 
 
 
103 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0123186 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1613  ribosomal protein L21  44.12 
 
 
104 aa  90.5  7e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000143983  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  39.6 
 
 
103 aa  89.7  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1452  ribosomal protein L21  43.56 
 
 
103 aa  89.7  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000000564167  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  39.6 
 
 
103 aa  89.4  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5208  50S ribosomal protein L21  39.6 
 
 
103 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.123983  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2385  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 
103 aa  89  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26832  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2097  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 
103 aa  89  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000174433  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3639  50S ribosomal protein L21  40.2 
 
 
106 aa  89  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.211161  normal  0.460303 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2535  ribosomal protein L21  44.55 
 
 
114 aa  89.4  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00752962  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2246  ribosomal protein L21  40.59 
 
 
103 aa  88.6  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000000579103  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14120  ribosomal protein L21  44.55 
 
 
132 aa  88.2  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000020004  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2117  50S ribosomal protein L21  44.23 
 
 
104 aa  88.2  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000135569  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4288  50S ribosomal protein L21  39.22 
 
 
104 aa  87.8  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.997468  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3757  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 
103 aa  87.8  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000620592  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0839  ribosomal protein L21  44.55 
 
 
103 aa  88.2  4e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.0819000000000001e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3974  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 
103 aa  87.8  4e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000270537  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0473  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 
103 aa  87.8  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000637379  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1320  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 
103 aa  87.8  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0375246  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3612  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 
103 aa  87.8  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  5.09393e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0855  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 
103 aa  88.2  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4860  50S ribosomal protein L21  39.6 
 
 
103 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1118  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 
146 aa  87.4  5e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00565538  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1336  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 
104 aa  87.4  6e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000100172  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0418  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 
103 aa  87  7e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.217833 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0646  50S ribosomal protein L21  42 
 
 
130 aa  87  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.362263  normal  0.661162 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1242  50S ribosomal protein L21P  41.84 
 
 
100 aa  86.7  9e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0797  ribosomal protein L21  40.59 
 
 
103 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3682  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 
103 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.885821  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1350  50S ribosomal protein L21  42.16 
 
 
104 aa  86.7  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0226901  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0701  50S ribosomal protein L21  39.6 
 
 
103 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1192  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 
102 aa  85.9  2e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000108547  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3479  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 
103 aa  85.9  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000647108  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0245  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 
103 aa  85.5  2e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000276317  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0488  ribosomal protein L21  40.2 
 
 
103 aa  85.9  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2047  ribosomal protein L21  42.31 
 
 
100 aa  85.1  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0979  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 
103 aa  85.1  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128697  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03731  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 
103 aa  85.1  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000230006  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4238  ribosomal protein L21  38.61 
 
 
102 aa  85.1  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000144419  hitchhiker  0.000000201625 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1107  ribosomal protein L21  41.18 
 
 
134 aa  84.7  3e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000212125  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2250  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 
102 aa  85.1  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00445864  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1136  50S ribosomal protein L21  40.2 
 
 
134 aa  85.1  3e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000463579  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0270  ribosomal protein L21  37.62 
 
 
103 aa  85.1  3e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0770  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 
103 aa  84.7  4e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0285  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 
103 aa  84.3  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.253807  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0462  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 
103 aa  84.3  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00315446 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40790  50S ribosomal protein L21  39.6 
 
 
103 aa  84.7  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200722  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3360  50S ribosomal protein L21  39.6 
 
 
103 aa  84.3  5e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000107263  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0745  ribosomal protein L21  40.59 
 
 
156 aa  84.3  5e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000031212  hitchhiker  0.00014666 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2005  ribosomal protein L21  41.58 
 
 
103 aa  84.3  5e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0841  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 
103 aa  84.3  5e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.498603 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3470  50S ribosomal protein L21  35.64 
 
 
103 aa  84  6e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235402  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0557  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 
104 aa  84  6e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13981  50S ribosomal protein L21  41 
 
 
170 aa  84.3  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.510472 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0688  50S ribosomal protein L21  37 
 
 
104 aa  84  7e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468756  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0720  50S ribosomal protein L21  37 
 
 
104 aa  84  7e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7553  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0967  50S ribosomal protein L21  37.62 
 
 
103 aa  84  7e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000186548  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1815  50S ribosomal protein L21  37.62 
 
 
103 aa  84  7e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1069  50S ribosomal protein L21  37.62 
 
 
103 aa  84  7e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000190707  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>