222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_0100 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010830  Aasi_0100  30S ribosomal protein S20  100 
 
 
83 aa  163  6e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1511  30S ribosomal protein S20  61.45 
 
 
85 aa  98.2  3e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1851  30S ribosomal protein S20  62.65 
 
 
85 aa  98.2  4e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153363  hitchhiker  0.000963738 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0225  30S ribosomal protein S20  61.45 
 
 
87 aa  98.2  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  4.77404e-11  normal  0.0381808 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0819  30S ribosomal protein S20  59.04 
 
 
84 aa  96.7  9e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4938  30S ribosomal protein S20  55.42 
 
 
83 aa  88.2  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01050  30S ribosomal protein S20  57.5 
 
 
82 aa  85.1  3e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1723  30S ribosomal protein S20  50.6 
 
 
84 aa  82.8  2e-15  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0524  ribosomal protein S20  54.22 
 
 
88 aa  81.6  3e-15  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  4.52156e-11  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6841  ribosomal protein S20  45.78 
 
 
84 aa  74.3  5e-13  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0306  ribosomal protein S20  43.37 
 
 
84 aa  66.6  1e-10  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  1.67926e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0500  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 
90 aa  64.7  4e-10  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.166841  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1678  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 
90 aa  64.7  4e-10  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3035  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 
89 aa  62.8  2e-09  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.051603  normal  0.325405 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2800  ribosomal protein S20  43.02 
 
 
86 aa  61.6  3e-09  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.207865  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2108  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 
87 aa  61.2  5e-09  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  2.04078e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3582  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 
86 aa  60.5  9e-09  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0144899 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3522  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 
86 aa  60.5  9e-09  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.824464  normal  0.131692 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3510  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 
86 aa  60.5  9e-09  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0849  SSU ribosomal protein S20P  44.19 
 
 
88 aa  59.7  1e-08  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12440  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 
86 aa  58.9  2e-08  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1774  30S ribosomal protein S20  38.37 
 
 
87 aa  57.4  6e-08  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  5.8734e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1843  ribosomal protein S20  48.1 
 
 
88 aa  57  8e-08  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2299  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 
87 aa  56.6  1e-07  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00503928  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2014  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 
87 aa  56.6  1e-07  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1854  SSU ribosomal protein S20P  42.5 
 
 
87 aa  55.5  2e-07  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.997447 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2665  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 
86 aa  56.2  2e-07  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213865  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1265  ribosomal protein S20  38.37 
 
 
87 aa  55.5  3e-07  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  6.15154e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0827  SSU ribosomal protein S20P  37.21 
 
 
92 aa  54.7  4e-07  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352915  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1939  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 
90 aa  54.3  5e-07  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2600  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 
90 aa  54.3  5e-07  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2575  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 
90 aa  54.3  5e-07  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.931195 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2551  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 
90 aa  54.3  5e-07  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2470  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 
90 aa  54.3  5e-07  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0125567 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60400  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 
91 aa  53.9  6e-07  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  5.03412e-05 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2281  30S ribosomal protein S20  38.37 
 
 
90 aa  54.3  6e-07  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0218498  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5883  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 
90 aa  53.5  9e-07  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.666229 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12880  ribosomal protein S20  37.21 
 
 
87 aa  53.1  1e-06  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.40535e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3912  30S ribosomal protein S20  37.21 
 
 
86 aa  53.5  1e-06  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0745  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 
90 aa  53.5  1e-06  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.426088 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2087  30S ribosomal protein S20  34.88 
 
 
86 aa  53.1  1e-06  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0701536  normal  0.341221 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1207  ribosomal protein S20  36.05 
 
 
86 aa  52.8  2e-06  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.872926  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2188  30S ribosomal protein S20  36.14 
 
 
91 aa  52.8  2e-06  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0220995  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1552  ribosomal protein S20  38.37 
 
 
86 aa  52.4  2e-06  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0324223  normal  0.177559 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1005  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 
89 aa  52.4  2e-06  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1846  30S ribosomal protein S20  36.14 
 
 
91 aa  52.8  2e-06  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3185  ribosomal protein S20  38.37 
 
 
86 aa  52.4  2e-06  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1979  ribosomal protein S20  39.02 
 
 
85 aa  52.4  2e-06  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  1.76977e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1145  30S ribosomal protein S20  37.97 
 
 
95 aa  52  2e-06  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.576615  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4173  30S ribosomal protein S20  40.48 
 
 
85 aa  52  3e-06  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0124088  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0950  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 
92 aa  52  3e-06  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.466719 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40720  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 
91 aa  52  3e-06  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3049  30S ribosomal protein S20  40.48 
 
 
85 aa  51.6  4e-06  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287118  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2765  30S ribosomal protein S20  40.96 
 
 
88 aa  51.6  4e-06  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3259  ribosomal protein S20  34.88 
 
 
88 aa  51.2  5e-06  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.602906  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4441  30S ribosomal protein S20  39.29 
 
 
85 aa  50.8  6e-06  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  5.91712e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4059  30S ribosomal protein S20  39.29 
 
 
85 aa  50.8  6e-06  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.2501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4069  30S ribosomal protein S20  39.29 
 
 
85 aa  50.8  6e-06  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00157919  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4455  30S ribosomal protein S20  39.29 
 
 
85 aa  50.8  6e-06  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.15322e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4403  30S ribosomal protein S20  39.29 
 
 
85 aa  50.8  6e-06  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4221  30S ribosomal protein S20  39.29 
 
 
85 aa  50.8  6e-06  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000214767  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4344  30S ribosomal protein S20  39.29 
 
 
85 aa  50.8  6e-06  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.53456e-13 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2446  30S ribosomal protein S20  38.37 
 
 
89 aa  50.8  6e-06  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  2.40091e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4547  30S ribosomal protein S20  39.29 
 
 
85 aa  50.8  6e-06  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3546  30S ribosomal protein S20  34.94 
 
 
89 aa  50.4  7e-06  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4855  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 
90 aa  50.4  8e-06  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3037  ribosomal protein S20p  37.35 
 
 
87 aa  50.4  9e-06  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.083141  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0854  ribosomal protein S20  43.02 
 
 
86 aa  50.1  1e-05  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3076  30S ribosomal protein S20  40.26 
 
 
90 aa  49.7  1e-05  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  1.26326e-09  hitchhiker  0.00230121 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3465  30S ribosomal protein S20  37.35 
 
 
88 aa  49.7  1e-05  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1889  30S ribosomal protein S20  38.27 
 
 
86 aa  50.1  1e-05  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3844  30S ribosomal protein S20  37.35 
 
 
88 aa  49.7  1e-05  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.160691  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0776  SSU ribosomal protein S20P  37.66 
 
 
151 aa  50.1  1e-05  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38047  normal  0.149543 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0795  30S ribosomal protein S20  38.1 
 
 
85 aa  49.7  1e-05  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.111102  hitchhiker  1.17943e-11 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2206  30S ribosomal protein S20  34.88 
 
 
87 aa  50.1  1e-05  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.935236  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2211  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 
87 aa  49.3  2e-05  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.829407  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0600  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 
92 aa  49.3  2e-05  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218047  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4562  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 
92 aa  49.3  2e-05  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.251807  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0641  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 
92 aa  49.3  2e-05  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647122  normal  0.196215 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0585  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 
87 aa  48.9  2e-05  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000109999  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2556  30S ribosomal protein S20  38.55 
 
 
88 aa  48.9  2e-05  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0548445  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0646  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 
92 aa  49.3  2e-05  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0571699 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0531  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 
92 aa  48.9  2e-05  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1979  30S ribosomal protein S20  37.21 
 
 
86 aa  49.7  2e-05  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53249e-08 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2678  30S ribosomal protein S20  39.76 
 
 
88 aa  49.3  2e-05  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.855392  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0802  ribosomal protein S20  39.53 
 
 
92 aa  49.3  2e-05  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1556  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 
86 aa  48.9  2e-05  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1039  ribosomal protein S20  38.55 
 
 
115 aa  48.9  2e-05  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  5.62255e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0707  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 
92 aa  49.3  2e-05  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1487  30S ribosomal protein S20  38.37 
 
 
88 aa  48.5  3e-05  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.422821  normal  0.27879 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12640  SSU ribosomal protein S20P  37.21 
 
 
86 aa  48.5  3e-05  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.464272  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0689  ribosomal protein S20  36.05 
 
 
89 aa  48.5  3e-05  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.152983 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1667  30S ribosomal protein S20  38.37 
 
 
88 aa  48.5  3e-05  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00940932  normal  0.076211 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7071  ribosomal protein S20  37.21 
 
 
88 aa  48.1  4e-05  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.595098  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1740  30S ribosomal protein S20  38.37 
 
 
86 aa  47.8  5e-05  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.632163  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1106  30S ribosomal protein S20  35.71 
 
 
93 aa  47.8  5e-05  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00644283  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1581  30S ribosomal protein S20  37.21 
 
 
109 aa  47.8  5e-05  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0756  30S ribosomal protein S20  33.72 
 
 
87 aa  47.8  5e-05  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  1.25202e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1524  30S ribosomal protein S20  37.21 
 
 
109 aa  48.1  5e-05  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2904  30S ribosomal protein S20  38.55 
 
 
88 aa  47.8  5e-05  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.871002 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>