More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_0096 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010830  Aasi_0096  resolvase domain-containing protein  100 
 
 
185 aa  369  1e-101  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0545  hypothetical protein  86.19 
 
 
186 aa  318  3e-86  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0606652 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1104  Resolvase domain  70.72 
 
 
196 aa  263  1e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1579  transposon Tn3 resolvase  70.17 
 
 
185 aa  257  7e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.159821  normal 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0090  resolvase TnpR  67.21 
 
 
183 aa  255  2e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.707126  normal  0.345515 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2381  Resolvase domain  67.96 
 
 
196 aa  251  4e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0011  resolvase, putative  69.44 
 
 
181 aa  249  1e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0273  resolvase/recombinase  52.25 
 
 
213 aa  157  6e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6417  resolvase domain-containing protein  42.7 
 
 
196 aa  121  5e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5628  Resolvase domain  42.31 
 
 
198 aa  121  5e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.526216 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0268  resolvase domain-containing protein  40.44 
 
 
181 aa  121  7e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.268273  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4885  resolvase domain-containing protein  41.3 
 
 
187 aa  120  1e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0747  resolvase domain-containing protein  40.64 
 
 
181 aa  117  7e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  38.76 
 
 
198 aa  117  1e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  7.02686e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5519  Resolvase domain  40.66 
 
 
197 aa  116  2e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.176111  normal  0.515657 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08245  resolvase  37.99 
 
 
179 aa  116  2e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  38.33 
 
 
185 aa  114  7e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5122  resolvase domain-containing protein  38.98 
 
 
290 aa  114  1e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  38.04 
 
 
198 aa  113  1e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0816  resolvase domain-containing protein  39.34 
 
 
185 aa  113  1e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_42  putative resolvase  36.67 
 
 
181 aa  113  2e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0684051  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0246  resolvase domain-containing protein  38.76 
 
 
179 aa  111  5e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.315323  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6810  Resolvase domain protein  39.34 
 
 
185 aa  111  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67902  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5792  resolvase TnpR  38.22 
 
 
212 aa  110  1e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.923438  normal 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0011  RlgA  39.78 
 
 
186 aa  109  2e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.928686  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5066  resolvase domain-containing protein  38.33 
 
 
313 aa  108  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.436238  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  35.87 
 
 
185 aa  108  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  36.61 
 
 
190 aa  108  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6405  resolvase domain-containing protein  38.25 
 
 
185 aa  108  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  36.61 
 
 
191 aa  108  4e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  36.46 
 
 
188 aa  107  7e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1397  invertase/recombinase like protein  41.45 
 
 
176 aa  107  8e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0605  resolvase domain-containing protein  39.23 
 
 
186 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.177837 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  37.16 
 
 
196 aa  106  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0611  Resolvase domain protein  39.23 
 
 
186 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1594  resolvase domain-containing protein  35.11 
 
 
189 aa  107  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.94865  normal  0.455677 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0580  resolvase domain-containing protein  39.23 
 
 
186 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  37.43 
 
 
188 aa  106  2e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  36.36 
 
 
187 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.31801e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  34.97 
 
 
190 aa  106  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7059  hypothetical protein  35.68 
 
 
183 aa  106  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  37.5 
 
 
197 aa  105  3e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  6.4315e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  36.36 
 
 
190 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  35.71 
 
 
192 aa  105  3e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4228  resolvase family site-specific recombinase  34.22 
 
 
187 aa  105  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.623835  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  35.83 
 
 
188 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  8.35062e-05 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  39.2 
 
 
197 aa  105  4e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7006  hypothetical protein  35.87 
 
 
183 aa  105  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3112  Resolvase domain protein  36.96 
 
 
184 aa  104  9e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  36.87 
 
 
185 aa  103  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1326  resolvase domain-containing protein  39.55 
 
 
180 aa  103  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  38.07 
 
 
184 aa  103  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4419  resolvase domain-containing protein  34.05 
 
 
196 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00736052  normal  0.464308 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  35.75 
 
 
185 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2173  resolvase domain-containing protein  34.05 
 
 
196 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2084  resolvase domain-containing protein  34.05 
 
 
196 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  36.87 
 
 
185 aa  103  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D08  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  35.43 
 
 
193 aa  102  3e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.942713  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3423  Resolvase domain protein  36.36 
 
 
185 aa  102  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3662  Resolvase domain protein  36.16 
 
 
188 aa  102  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  34.81 
 
 
181 aa  102  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  37.57 
 
 
182 aa  102  3e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  35.2 
 
 
188 aa  102  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  35.52 
 
 
195 aa  102  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  36.93 
 
 
184 aa  102  4e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0037  transposon Tn21 resolvase  36.61 
 
 
205 aa  101  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4599  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  37.02 
 
 
186 aa  101  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  3.21893e-05  hitchhiker  0.00456228 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4473  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  37.02 
 
 
186 aa  101  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0992302  decreased coverage  0.00348712 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15430  putative resolvase, essential for transposition  37.02 
 
 
186 aa  101  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  7.34084e-16  unclonable  6.55355e-22 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0086  resolvase family site-specific recombinase  32.79 
 
 
196 aa  101  5e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.464664  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4668  resolvase domain-containing protein  37.85 
 
 
189 aa  101  6e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1818  Resolvase domain protein  39.13 
 
 
184 aa  101  6e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.601257  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4775  resolvase domain-containing protein  37.85 
 
 
189 aa  101  6e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3477  resolvase domain-containing protein  32.79 
 
 
196 aa  101  7e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4560  resolvase domain-containing protein  32.24 
 
 
192 aa  100  8e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  35.16 
 
 
185 aa  100  8e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1914  resolvase domain-containing protein  36.07 
 
 
185 aa  100  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2680  resolvase domain-containing protein  36.07 
 
 
185 aa  100  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1256  resolvase domain-containing protein  36.07 
 
 
185 aa  100  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.249423  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3846  resolvase domain-containing protein  36.07 
 
 
185 aa  100  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.40246  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3829  resolvase domain-containing protein  36.07 
 
 
185 aa  100  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  35.14 
 
 
189 aa  100  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1206  Resolvase domain protein  36.56 
 
 
186 aa  100  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0021  resolvase-like protein  35.87 
 
 
189 aa  100  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  36.46 
 
 
197 aa  99.4  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0189  resolvase domain-containing protein  32.24 
 
 
206 aa  100  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3928  resolvase domain-containing protein  37.36 
 
 
191 aa  99.8  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.272515  hitchhiker  7.53359e-05 
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  36.46 
 
 
197 aa  99.4  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1992  resolvase domain-containing protein  32.24 
 
 
206 aa  100  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2239  resolvase domain-containing protein  35.71 
 
 
187 aa  100  2e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4663  resolvase domain-containing protein  35.79 
 
 
197 aa  99.8  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.94015  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1093  Resolvase domain  35.75 
 
 
196 aa  100  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.531001  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6187  resolvase-like protein  35.91 
 
 
186 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0984609  hitchhiker  1.07923e-05 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4379  resolvase-like protein  35.79 
 
 
197 aa  99.8  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.907706  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4555  resolvase-like protein  35.79 
 
 
197 aa  99.8  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.849085  n/a   
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0002  resolvase  33.52 
 
 
190 aa  99.8  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  1.41759e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  35.2 
 
 
185 aa  99.8  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  36.26 
 
 
205 aa  99  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  36.26 
 
 
205 aa  99  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  36.07 
 
 
199 aa  99  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>