More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_0077 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010830  Aasi_0077  nucleotidyl transferase  100 
 
 
336 aa  689  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.760983 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0020  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  49.25 
 
 
333 aa  344  2e-93  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.583446  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1064  nucleotidyl transferase  46.59 
 
 
338 aa  328  1e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03545  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, putative  46.87 
 
 
336 aa  326  3e-88  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0729  Nucleotidyl transferase  38.05 
 
 
332 aa  246  5e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1221  nucleotidyl transferase  39.47 
 
 
329 aa  237  2e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2033  Nucleotidyl transferase  37.65 
 
 
328 aa  207  2e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0881  nucleotidyl transferase  35.31 
 
 
331 aa  205  8e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4084  nucleotidyl transferase  35.31 
 
 
331 aa  204  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.313929 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1304  Nucleotidyl transferase  34.32 
 
 
330 aa  194  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2775  Nucleotidyl transferase  33.82 
 
 
324 aa  191  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1640  Nucleotidyl transferase  35.01 
 
 
325 aa  188  1e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0220979  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0923  nucleotidyl transferase  36.39 
 
 
325 aa  183  4e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  7.58587e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2093  Nucleotidyl transferase  35.07 
 
 
325 aa  182  7e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.165042  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0809  Nucleotidyl transferase  33.93 
 
 
326 aa  181  2e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0673  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  35.61 
 
 
325 aa  181  2e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.004796  hitchhiker  0.00242114 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1546  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.2 
 
 
349 aa  180  4e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000479594  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0276  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  31.27 
 
 
331 aa  179  8e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00854948  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7294  Nucleotidyl transferase  32.44 
 
 
330 aa  174  1e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1639  Nucleotidyl transferase  34.51 
 
 
325 aa  166  4e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1800  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  31.49 
 
 
357 aa  135  1e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1817  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30.54 
 
 
355 aa  134  2e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2236  nucleotidyl transferase  29.55 
 
 
328 aa  132  7e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0493  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30.61 
 
 
357 aa  132  9e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.79936  normal  0.265363 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0480  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30.61 
 
 
357 aa  132  1e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0628  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  31.8 
 
 
358 aa  128  1e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.437993  normal  0.532658 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.97 
 
 
355 aa  129  1e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4128  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.21 
 
 
355 aa  128  2e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0631243  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2034  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.83 
 
 
357 aa  125  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0258  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.99 
 
 
356 aa  125  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1687  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.57 
 
 
356 aa  124  2e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2860  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30.03 
 
 
355 aa  123  6e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2508  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30.72 
 
 
344 aa  122  8e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1383  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.27 
 
 
355 aa  121  2e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2643  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29.65 
 
 
354 aa  121  2e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5787  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  24.86 
 
 
358 aa  120  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3356  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, short form  28.53 
 
 
358 aa  120  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.971675  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1537  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.37 
 
 
364 aa  119  6e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.307864 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0713  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.06 
 
 
358 aa  119  7e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.974379 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0413  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.86 
 
 
355 aa  119  9e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0183855  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2754  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.78 
 
 
355 aa  119  1e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0733  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  25.69 
 
 
355 aa  117  2e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4297  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29.65 
 
 
357 aa  118  2e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0340  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.28 
 
 
355 aa  118  2e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830656  normal  0.0393179 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0329  nucleotidyl transferase  29.06 
 
 
411 aa  117  3e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.175272  hitchhiker  0.000673657 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0747  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.37 
 
 
359 aa  117  3e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5901  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  26.18 
 
 
356 aa  116  4e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1450  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30.43 
 
 
376 aa  116  5e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.49 
 
 
355 aa  116  7e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.75 
 
 
355 aa  114  2e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1488  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29.65 
 
 
357 aa  114  2e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.50762e-07 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1583  nucleotidyl transferase  27.93 
 
 
411 aa  114  2e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.605878  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0631  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  26.98 
 
 
355 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0399  nucleotidyl transferase  28.22 
 
 
414 aa  113  4e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0513  nucleotidyl transferase  28.88 
 
 
411 aa  112  7e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4165  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  25.71 
 
 
355 aa  112  9e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2794  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29.57 
 
 
354 aa  112  1e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.181075 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0954  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  26.65 
 
 
354 aa  110  3e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.526326  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27 
 
 
357 aa  110  4e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2874  Nucleotidyl transferase  25.87 
 
 
402 aa  108  1e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1083  Nucleotidyl transferase  24.46 
 
 
402 aa  107  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0192  nucleotidyl transferase  25.21 
 
 
365 aa  106  6e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.415123 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2143  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  24.64 
 
 
357 aa  103  3e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.591307  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0642  nucleotidyl transferase  27.71 
 
 
411 aa  103  4e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.163683  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1845  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.78 
 
 
349 aa  103  4e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0548966  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  27.43 
 
 
397 aa  103  6e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1940  Nucleotidyl transferase  27.65 
 
 
818 aa  102  9e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6491  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  26.47 
 
 
355 aa  100  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1013  nucleotidyl transferase  27.78 
 
 
776 aa  99.8  7e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0124  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29.33 
 
 
351 aa  99.4  8e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  3.22504e-15 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3113  nucleotidyl transferase  28.89 
 
 
349 aa  98.2  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.409116  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03020  mannose-1-phosphate guanylyltransferase, putative  27.2 
 
 
364 aa  97.1  4e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0479  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  26.22 
 
 
320 aa  96.3  7e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  3.31909e-09  decreased coverage  4.39199e-09 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2065  Nucleotidyl transferase  26.79 
 
 
393 aa  95.9  9e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2917  Nucleotidyl transferase  24.86 
 
 
439 aa  95.5  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.118183  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4347  nucleotidyl transferase family protein  25.83 
 
 
784 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.114462  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  26.11 
 
 
400 aa  94.4  3e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4400  nucleotidyl transferase family protein  25.53 
 
 
784 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2341  nucleotidyl transferase  27.46 
 
 
396 aa  93.2  5e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00221584  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0348  Nucleotidyl transferase  28.15 
 
 
810 aa  93.2  6e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2096  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  25.07 
 
 
353 aa  92.8  8e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805861 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4120  nucleotidyl transferase  26.15 
 
 
784 aa  92.4  9e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15980  phosphoglucomutase  26.71 
 
 
820 aa  92  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2854  nucleotidyl transferase  27.68 
 
 
388 aa  92  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1080  Nucleotidyl transferase  24.79 
 
 
391 aa  92.4  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.380619 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4381  nucleotidyl transferase family protein  26.13 
 
 
784 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4017  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  25.81 
 
 
784 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.688327  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4491  nucleotidyl transferase family protein  25.53 
 
 
784 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4007  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  25.53 
 
 
784 aa  91.7  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4169  nucleotidyl transferase family protein  25.53 
 
 
784 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0853  nucleotidyl transferase family protein  26.13 
 
 
784 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0313  Nucleotidyl transferase  26.83 
 
 
384 aa  90.9  3e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.414969 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4287  nucleotidyl transferase family protein  25.53 
 
 
784 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.268164 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74665  Mannose-1-phosphate guanyltransferase (ATP-mannose-1-phosphate guanylyltransferase) (GDP-mannose pyrophosphorylase) (CASRB1)  27.43 
 
 
362 aa  90.5  4e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0126253 
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  26.39 
 
 
400 aa  90.5  4e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2995  nucleotidyl transferase  26.84 
 
 
785 aa  90.5  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0314  Nucleotidyl transferase  27.25 
 
 
400 aa  89.7  7e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.42611 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1801  Nucleotidyl transferase  26.67 
 
 
403 aa  87.8  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0230412  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  26.24 
 
 
400 aa  87.4  3e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0068  nucleotidyl transferase  26.71 
 
 
404 aa  87  4e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0170821  normal  0.011821 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>