More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_0048 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010830  Aasi_0048  tRNA pseudouridine synthase A  100 
 
 		 253 aa  528  1e-149  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2502  tRNA pseudouridine synthase A  49.01 
 
 		 248 aa  246  2e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.419434  normal  0.63805 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0483  tRNA pseudouridine synthase A  48.81 
 
 		 248 aa  240  2e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4667  tRNA pseudouridine synthase A  48.78 
 
 		 284 aa  238  8e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1933  tRNA pseudouridine synthase A  50.2 
 
 		 250 aa  235  4e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1744  tRNA pseudouridine synthase A  49.6 
 
 		 252 aa  231  9e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0785  tRNA pseudouridine synthase A  46.03 
 
 		 252 aa  227  1e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1421  tRNA pseudouridine synthase A  43.6 
 
 		 250 aa  205  6e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.126301  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13523  putative tRNA pseudouridine synthase A  44.4 
 
 		 258 aa  201  8e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0668  tRNA pseudouridine synthase A  42.31 
 
 		 261 aa  199  3e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.252999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3657  tRNA pseudouridine synthase A  40.16 
 
 		 269 aa  180  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2487  tRNA pseudouridine synthase A  36.11 
 
 		 252 aa  157  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2098  tRNA pseudouridine synthase A  35.48 
 
 		 270 aa  149  3e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.831526 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2275  tRNA pseudouridine synthase A  38.17 
 
 		 268 aa  147  2.0000000000000003e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0551657  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01500  pseudouridylate synthase I  35.37 
 
 		 246 aa  145  6e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  8.6087e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02450  pseudouridylate synthase I  35.37 
 
 		 246 aa  145  6e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000086341  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0319  tRNA pseudouridine synthase A  37.1 
 
 		 250 aa  142  4e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000352927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0793  tRNA pseudouridine synthase A  35.66 
 
 		 245 aa  142  4e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000229391  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1452  tRNA pseudouridine synthase A  36.4 
 
 		 256 aa  142  5e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000896278  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0900  tRNA pseudouridine synthase A  36.36 
 
 		 244 aa  141  8e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106944  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5141  tRNA pseudouridine synthase A  34.14 
 
 		 264 aa  140  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.11531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2251  tRNA pseudouridine synthase A  35.22 
 
 		 246 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218051  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0504  tRNA pseudouridine synthase A  33.6 
 
 		 248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00170943  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2299  pseudouridylate synthase  37.05 
 
 		 249 aa  139  6e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000390138  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2939  tRNA pseudouridine synthase A  35.1 
 
 		 244 aa  138  7e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2707  tRNA pseudouridine synthase A  34.55 
 
 		 278 aa  137  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.580118  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0498  tRNA pseudouridine synthase A  33.6 
 
 		 260 aa  136  3.0000000000000003e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.276937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0447  tRNA pseudouridine synthase A  32.53 
 
 		 249 aa  136  3.0000000000000003e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.801238 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0228  tRNA pseudouridine synthase A  33.59 
 
 		 255 aa  136  3.0000000000000003e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0686  tRNA pseudouridine synthase ACD  36.55 
 
 		 246 aa  135  7.000000000000001e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000903127  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0466  tRNA pseudouridine synthase A  35.06 
 
 		 252 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000184743  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3634  tRNA pseudouridine synthase A  36.03 
 
 		 245 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.13903  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2616  tRNA pseudouridine synthase A  32.94 
 
 		 296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0226  tRNA pseudouridine synthase A  35.55 
 
 		 293 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0223  tRNA pseudouridine synthase A  35.55 
 
 		 293 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00472694  normal  0.027676 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2073  tRNA pseudouridine synthase A  30.1 
 
 		 297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0650804 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1248  tRNA pseudouridine synthase A  34.96 
 
 		 248 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1060  tRNA pseudouridine synthase A  34.96 
 
 		 248 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0143  tRNA pseudouridine synthase A  34.16 
 
 		 248 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000160558  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3380  tRNA pseudouridine synthase A  31.87 
 
 		 273 aa  133  3e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1161  tRNA pseudouridine synthase A  34.5 
 
 		 271 aa  132  5e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0226119  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1494  tRNA pseudouridine synthase A  33.2 
 
 		 259 aa  132  6e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.643957  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1712  tRNA pseudouridine synthase A  34.02 
 
 		 243 aa  132  6e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000199289  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0407  tRNA pseudouridine synthase A  33.2 
 
 		 245 aa  131  7.999999999999999e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2150  tRNA pseudouridine synthase A  34.13 
 
 		 261 aa  131  7.999999999999999e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00702762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0696  tRNA pseudouridine synthase A  33.2 
 
 		 259 aa  131  9e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.214001  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1075  tRNA pseudouridine synthase A  34.8 
 
 		 262 aa  130  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0100  tRNA pseudouridine synthase A  34.39 
 
 		 258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0543  tRNA pseudouridine synthase A  33.73 
 
 		 245 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000330857  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2246  tRNA pseudouridine synthase A  33.33 
 
 		 267 aa  131  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000374145  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2287  tRNA pseudouridine synthase A  33.33 
 
 		 267 aa  131  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0252642  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0473  tRNA pseudouridine synthase A  33.2 
 
 		 245 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0520  tRNA pseudouridine synthase A  33.73 
 
 		 264 aa  131  1.0000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0401  tRNA pseudouridine synthase A  33.2 
 
 		 245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1355  tRNA pseudouridine synthase A  35.66 
 
 		 237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0794079  normal  0.0223344 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0966  tRNA pseudouridine synthase A  33.33 
 
 		 284 aa  130  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.982634  normal  0.313334 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0612  tRNA pseudouridine synthase A  32.41 
 
 		 274 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0615  tRNA pseudouridine synthase A  32.58 
 
 		 310 aa  130  2.0000000000000002e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0481  tRNA pseudouridine synthase A  32.79 
 
 		 246 aa  130  3e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000089193  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2986  tRNA pseudouridine synthase A  32.41 
 
 		 272 aa  130  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.130243 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3871  tRNA pseudouridine synthase A  33.85 
 
 		 268 aa  130  3e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0255  tRNA pseudouridine synthase A  34 
 
 		 247 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000251416  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_446  pseudouridylate synthase  31.98 
 
 		 246 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000332106  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2680  tRNA pseudouridine synthase A  33.61 
 
 		 244 aa  129  5.0000000000000004e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000443367  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4288  tRNA pseudouridine synthase A  33.08 
 
 		 288 aa  129  6e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.620065  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0462  tRNA pseudouridine synthase A  32.8 
 
 		 245 aa  128  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0487  tRNA pseudouridine synthase A  32.8 
 
 		 245 aa  128  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002874  tRNA pseudouridine synthase A  33.6 
 
 		 264 aa  128  9.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.28642  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1219  tRNA pseudouridine synthase A  32.55 
 
 		 300 aa  128  9.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0289108 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1258  tRNA pseudouridine synthase A  36.51 
 
 		 269 aa  128  9.000000000000001e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4830  tRNA pseudouridine synthase A  33.33 
 
 		 245 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0152439  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0543  tRNA pseudouridine synthase A  33.2 
 
 		 245 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.432297  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04290  pseudouridylate synthase I  31.73 
 
 		 300 aa  127  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.477492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3334  tRNA pseudouridine synthase A  34 
 
 		 273 aa  127  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000208005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0492  tRNA pseudouridine synthase A  33.33 
 
 		 245 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.138657  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1064  tRNA pseudouridine synthase A  35.43 
 
 		 247 aa  127  1.0000000000000001e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000223537  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0421  tRNA pseudouridine synthase A  33.2 
 
 		 260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000417493  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0405  tRNA pseudouridine synthase A  32.8 
 
 		 245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00300726  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1266  tRNA pseudouridine synthase A  33.73 
 
 		 262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3667  tRNA pseudouridine synthase A  30.12 
 
 		 291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2365  tRNA pseudouridine synthase A  33.2 
 
 		 244 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000187105  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1150  tRNA pseudouridine synthase A  29.44 
 
 		 251 aa  126  3e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00189497  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1265  tRNA pseudouridine synthase A  33.73 
 
 		 262 aa  126  3e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0165  tRNA pseudouridine synthase A  34 
 
 		 248 aa  126  3e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2877  tRNA pseudouridine synthase A  31.97 
 
 		 244 aa  125  5e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00616108  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1033  tRNA pseudouridine synthase A  30.28 
 
 		 251 aa  125  5e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1685  tRNA pseudouridine synthase A  32.65 
 
 		 244 aa  125  5e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0037  tRNA pseudouridine synthase A  32.16 
 
 		 266 aa  125  5e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.848154 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2384  tRNA pseudouridine synthase A  30.98 
 
 		 259 aa  125  5e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0974  tRNA pseudouridine synthase A  30.28 
 
 		 251 aa  125  5e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2995  tRNA pseudouridine synthase ACD  33.87 
 
 		 278 aa  125  7e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00964869 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0717  tRNA pseudouridine synthase A  32.68 
 
 		 282 aa  125  8.000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000371927  normal  0.874871 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0126  tRNA pseudouridine synthase A  34.8 
 
 		 264 aa  125  8.000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000150331  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3303  tRNA pseudouridine synthase A  31.45 
 
 		 245 aa  124  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0316618  normal  0.649703 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3729  tRNA pseudouridine synthase A  33.73 
 
 		 306 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1130  tRNA pseudouridine synthase A  33.07 
 
 		 248 aa  124  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.131343 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4476  tRNA pseudouridine synthase A  32.55 
 
 		 282 aa  124  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17151  tRNA pseudouridine synthase A  34.39 
 
 		 268 aa  123  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.137278  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1800  tRNA pseudouridine synthase A  33.73 
 
 		 267 aa  123  3e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0139  tRNA pseudouridine synthase A  33.46 
 
 		 258 aa  123  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>