16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_0045 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010830  Aasi_0045  hypothetical protein  100 
 
 
263 aa  537  1e-152  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0043  HSR1-like GTP-binding protein  53.85 
 
 
578 aa  241  1e-62  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0451  hypothetical protein  51.47 
 
 
1071 aa  219  3e-56  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0044  hypothetical protein  44.77 
 
 
463 aa  205  5e-52  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1058  hypothetical protein  44.98 
 
 
746 aa  186  3e-46  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.506927 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1060  hypothetical protein  44.98 
 
 
690 aa  186  4e-46  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.681476 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0976  GTP-binding protein HSR1-related  29.51 
 
 
201 aa  46.2  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.173134 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0380  GTP-binding protein HSR1-related  31.76 
 
 
201 aa  45.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000322823  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1359  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  31.73 
 
 
195 aa  43.1  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.162562  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1273  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  32.65 
 
 
195 aa  43.5  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.256422  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0453  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  29.82 
 
 
205 aa  42.7  0.005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3148  GTP-binding protein Era  38.46 
 
 
300 aa  43.1  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0159525  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0600  GTP-binding protein  37.88 
 
 
230 aa  42.7  0.006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.358533  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1327  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  30.77 
 
 
195 aa  42.4  0.007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00220989  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0380  GTPase EngC  37.88 
 
 
351 aa  42.7  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3053  GTP-binding protein Era  40 
 
 
301 aa  42  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.23462  normal  0.0104922 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>