More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_0040 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010830  Aasi_0449  hypothetical protein  37.47 
 
 
1126 aa  704  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.812136 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1009  hypothetical protein  52.92 
 
 
1116 aa  1184  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.804907 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0355  hypothetical protein  47.8 
 
 
1111 aa  1028  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0552395 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0563  hypothetical protein  68.01 
 
 
1121 aa  1587  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0552395 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0694  hypothetical protein  44.43 
 
 
958 aa  784  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0697  hypothetical protein  42.15 
 
 
953 aa  731  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0839  hypothetical protein  47.89 
 
 
1105 aa  1042  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0994214 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0927  hypothetical protein  40.72 
 
 
1156 aa  852  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0257155 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0939  hypothetical protein  52.07 
 
 
1157 aa  1199  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.186942 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0040  metal-dependent phosphohydrolase  100 
 
 
1109 aa  2256  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1744  Na-solute symporter  85.65 
 
 
641 aa  1127  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.488974 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1501  hypothetical protein  74.56 
 
 
1085 aa  1664  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1503  hypothetical protein  74.56 
 
 
1085 aa  1664  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1040  hypothetical protein  44.15 
 
 
643 aa  501  1e-140  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1743  hypothetical protein  60.13 
 
 
485 aa  484  1e-135  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.60384 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1444  hypothetical protein  29.15 
 
 
1170 aa  453  1e-126  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0236  hypothetical protein  76.3 
 
 
182 aa  272  3e-71  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0041  sodium/pantothenate symporter  29.91 
 
 
468 aa  171  7e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.30306e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1038  hypothetical protein  29.65 
 
 
487 aa  171  8e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0698  hypothetical protein  47.89 
 
 
197 aa  169  3e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.921082 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0924  twin-arginine translocation pathway signal  29.11 
 
 
452 aa  167  1e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.839391  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0446  hypothetical protein  29.49 
 
 
726 aa  166  3e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.722173 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2058  (p)ppGpp synthetase I  46.55 
 
 
786 aa  142  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.226647  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0327  hypothetical protein  30.12 
 
 
489 aa  141  8e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1039  hypothetical protein  30.16 
 
 
447 aa  139  2e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1041  hypothetical protein  27.56 
 
 
485 aa  137  8e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.880803 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1815  RelA/SpoT family protein  44.25 
 
 
815 aa  136  2e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.093472  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1805  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  43.68 
 
 
827 aa  134  9e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.388708  decreased coverage  7.28185e-06 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0842  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  43.1 
 
 
817 aa  133  2e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.461248  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0998  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  44.81 
 
 
721 aa  131  9e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6106  GTP diphosphokinase  43.1 
 
 
785 aa  131  9e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.364718  normal  0.643206 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15130  (p)ppGpp synthetase, RelA/SpoT family  44.97 
 
 
812 aa  130  1e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0120895  normal  0.467007 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3821  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  44.07 
 
 
787 aa  130  2e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.438652 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3380  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  44.25 
 
 
822 aa  130  2e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000200325  hitchhiker  0.00033219 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1945  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  45.4 
 
 
779 aa  129  2e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.712963  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2090  RelA/SpoT protein  43.1 
 
 
814 aa  130  2e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4475  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  45.56 
 
 
751 aa  129  4e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2359  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  43.1 
 
 
793 aa  129  4e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1338  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  43.68 
 
 
820 aa  129  4e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.865833  normal  0.439631 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0175  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  41.86 
 
 
740 aa  128  7e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.249358 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3048  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  43.68 
 
 
815 aa  127  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4391  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  46.15 
 
 
586 aa  127  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2027  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  43.96 
 
 
763 aa  127  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.74552e-09 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2392  RelA/SpoT family protein  41.95 
 
 
743 aa  126  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.997464  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3171  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  43.68 
 
 
861 aa  126  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100702  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1698  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  43.79 
 
 
766 aa  125  5e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5138  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  40.31 
 
 
927 aa  124  7e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.918699  normal  0.0221462 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0531  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  39.57 
 
 
749 aa  124  9e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.254948  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2308  RelA/SpoT family protein  43.1 
 
 
790 aa  124  1e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0636363  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2442  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  44.72 
 
 
730 aa  124  1e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.224797 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2868  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  39.78 
 
 
719 aa  123  2e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.706713  normal  0.0333863 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2576  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  42.37 
 
 
705 aa  123  2e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0223055 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0379  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  40.84 
 
 
710 aa  123  2e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1728  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  43.98 
 
 
705 aa  123  2e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.258863 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0303  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  42.37 
 
 
705 aa  122  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.480433  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1536  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  42.41 
 
 
719 aa  123  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0616  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  41.94 
 
 
713 aa  122  3e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  1.84713e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1670  RelA/SpoT family protein  42.37 
 
 
705 aa  122  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443961  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1363  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  42.37 
 
 
804 aa  122  3e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.401853  normal  0.596174 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1367  guanosine polyphosphate pyrophosphohydrolase/synthetase  45.93 
 
 
731 aa  122  3e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.709372  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3520  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  40.86 
 
 
743 aa  122  4e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.381195  normal  0.147032 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3392  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  40.86 
 
 
743 aa  122  4e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1361  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  43.01 
 
 
703 aa  122  4e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.011666  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3196  RelA/SpoT family protein  40.86 
 
 
743 aa  122  4e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0189864  normal  0.84291 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0194  GTP pyrophosphokinase  41.71 
 
 
714 aa  122  5e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0587  guanosine polyphosphate pyrophosphohydrolase/synthetase  44.89 
 
 
748 aa  122  5e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00257021  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1904  GTP pyrophosphokinase  42.39 
 
 
726 aa  121  6e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2530  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  42.41 
 
 
789 aa  121  7e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.471952  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1400  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  41.14 
 
 
705 aa  121  7e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.118949 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0514  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  45 
 
 
722 aa  121  7e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1808  guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase  46.78 
 
 
762 aa  121  8e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1801  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  44.83 
 
 
795 aa  121  9e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.203828  normal  0.0273265 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3258  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  43.04 
 
 
720 aa  120  1e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4577  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  40.29 
 
 
762 aa  120  1e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.657251 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1673  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  44 
 
 
781 aa  120  1e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1455  guanosine-3'5'-bis(diphosphate) 3'- pyrophosphohydrolase  44.94 
 
 
707 aa  120  1e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2297  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  42.86 
 
 
797 aa  120  1e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149438  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0806  GTP diphosphokinase  43.53 
 
 
734 aa  120  1e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000171798  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1894  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  39.34 
 
 
753 aa  120  1e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.818102  hitchhiker  0.00061937 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2469  GTP pyrophosphokinase  39.66 
 
 
462 aa  120  1e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17580  (p)ppGpp synthetase, RelA/SpoT family  38.97 
 
 
775 aa  120  2e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.091974 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1680  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  42.25 
 
 
717 aa  120  2e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0127021 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1214  RelA/SpoT protein  41.42 
 
 
709 aa  119  2e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4122  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  46.84 
 
 
774 aa  120  2e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15280  (p)ppGpp synthetase, RelA/SpoT family  42.46 
 
 
740 aa  119  2e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3187  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  42.22 
 
 
714 aa  119  2e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.190275  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12603  GTP pyrophosphokinase relA  41.38 
 
 
790 aa  119  3e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  3.42988e-06  normal  0.752099 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0200  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  43.09 
 
 
714 aa  119  3e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1951  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  41.71 
 
 
726 aa  119  3e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  5.67155e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2260  metal dependent phosphohydrolase  42.29 
 
 
462 aa  119  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.290186  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2193  GTP pyrophosphokinase  41.85 
 
 
726 aa  119  3e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0787  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  43.32 
 
 
722 aa  119  4e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.239727 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14010  (p)ppGpp synthetase, RelA/SpoT family  40.98 
 
 
809 aa  119  4e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.698973  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1146  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  42.7 
 
 
717 aa  119  4e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.144176  normal  0.638752 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1666  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  41.52 
 
 
577 aa  119  4e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00802443  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2565  metal dependent phosphohydrolase  43.04 
 
 
710 aa  118  5e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00145552  hitchhiker  9.02572e-06 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02364  guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase ((ppGpp)ase)  40 
 
 
712 aa  119  5e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1219  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  45.57 
 
 
771 aa  118  5e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1704  GTP diphosphokinase (guanosine 3',5'-polyphosphate synthase)  45.88 
 
 
732 aa  118  6e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0084674  normal  0.280503 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2001  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  43.4 
 
 
723 aa  118  8e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>