More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_0038 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_1554  ATP-dependent DNA helicase II  59.39 
 
 
749 aa  933  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5601  UvrD/REP helicase  58.9 
 
 
764 aa  915  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2924  UvrD/REP helicase  51.93 
 
 
778 aa  777  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  43.96 
 
 
768 aa  646  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1021  UvrD/REP helicase  50.13 
 
 
783 aa  740  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.751613  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2070  UvrD/REP helicase  53.71 
 
 
789 aa  779  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.535098  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10008  putative helicase  53.21 
 
 
773 aa  784  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1437  UvrD/REP helicase  55.31 
 
 
769 aa  840  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.618729  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3788  UvrD/REP helicase  57.85 
 
 
755 aa  888  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0038  UvrD/REP helicase  100 
 
 
757 aa  1565  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1038  ATP-dependent DNA helicase UvrD/PcrA/Rep family  43.66 
 
 
765 aa  618  1e-175  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.99777e-08 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0794  UvrD/REP helicase  42.84 
 
 
735 aa  598  1e-169  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  44.33 
 
 
732 aa  587  1e-166  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0547  UvrD/REP helicase  42.53 
 
 
741 aa  585  1e-166  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1682  UvrD/REP helicase  42.53 
 
 
743 aa  579  1e-164  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0334  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.57 
 
 
747 aa  568  1e-161  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0453  DNA helicase II  41.81 
 
 
735 aa  568  1e-160  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.723252  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0285  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.36 
 
 
741 aa  566  1e-160  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1516  superfamily I DNA/RNA helicase  41.57 
 
 
757 aa  568  1e-160  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.476962 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0275  ATP-dependent DNA helicase  42.02 
 
 
753 aa  566  1e-160  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2542  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.45 
 
 
751 aa  567  1e-160  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0351  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.36 
 
 
753 aa  564  1e-159  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2219  UvrD/REP helicase  42.42 
 
 
739 aa  564  1e-159  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1415  DNA helicase II  42.63 
 
 
743 aa  564  1e-159  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1142  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.96 
 
 
759 aa  565  1e-159  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00645373  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0305  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.36 
 
 
747 aa  563  1e-159  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2246  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.05 
 
 
751 aa  564  1e-159  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.453558  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0291  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.36 
 
 
751 aa  563  1e-159  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0336  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.23 
 
 
751 aa  564  1e-159  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0286  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.57 
 
 
747 aa  560  1e-158  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4969  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42 
 
 
753 aa  561  1e-158  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0278  ATP-dependent DNA helicase  42.23 
 
 
751 aa  561  1e-158  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0377  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.23 
 
 
751 aa  561  1e-158  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1960  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.91 
 
 
730 aa  556  1e-157  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1994  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.91 
 
 
730 aa  556  1e-157  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0674  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.79 
 
 
734 aa  558  1e-157  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0481  UvrD/REP helicase  40.93 
 
 
736 aa  549  1e-155  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0566  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.05 
 
 
766 aa  551  1e-155  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0426  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.08 
 
 
748 aa  549  1e-155  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0760  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.63 
 
 
737 aa  546  1e-154  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0982  UvrD/REP helicase  40.88 
 
 
731 aa  548  1e-154  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.158215  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1146  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.7 
 
 
725 aa  543  1e-153  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.26 
 
 
729 aa  543  1e-153  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.52 
 
 
715 aa  542  1e-152  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  7.12312e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1445  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.68 
 
 
757 aa  540  1e-152  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.715662  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1222  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.23 
 
 
758 aa  536  1e-151  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0652  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.42 
 
 
786 aa  537  1e-151  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.782155  normal  0.523807 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.55 
 
 
741 aa  536  1e-151  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0994  superfamily I DNA/RNA helicase  39.79 
 
 
770 aa  538  1e-151  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1236  ATP-dependent DNA helicase  38.87 
 
 
762 aa  533  1e-150  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  2.43154e-05 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0537  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.34 
 
 
711 aa  534  1e-150  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.93 
 
 
785 aa  531  1e-149  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16340  DNA/RNA helicase, superfamily I  38.2 
 
 
772 aa  532  1e-149  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0144318 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  41.71 
 
 
735 aa  530  1e-149  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1911  UvrD/REP helicase  39.29 
 
 
742 aa  526  1e-148  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306722  normal  0.156803 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4326  UvrD/REP helicase  39.19 
 
 
744 aa  528  1e-148  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0144266  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.19 
 
 
755 aa  526  1e-148  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2580  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.63 
 
 
754 aa  526  1e-148  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5987  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37 
 
 
851 aa  528  1e-148  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0573497  normal  0.0186357 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7996  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.73 
 
 
806 aa  528  1e-148  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.45 
 
 
729 aa  528  1e-148  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0419  DNA-dependent helicase II  38.86 
 
 
721 aa  525  1e-147  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.590239  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0682  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.5 
 
 
756 aa  524  1e-147  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0445546  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07720  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.55 
 
 
831 aa  521  1e-146  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0752204  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  38.38 
 
 
739 aa  518  1e-145  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3026  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.27 
 
 
829 aa  516  1e-145  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.499575  hitchhiker  0.000248027 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.87 
 
 
742 aa  515  1e-144  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  1.00763e-07 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  38.96 
 
 
707 aa  515  1e-144  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4079  DNA helicase II  38.48 
 
 
724 aa  515  1e-144  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3397  DNA-dependent helicase II  39.14 
 
 
727 aa  514  1e-144  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0186  DNA-dependent helicase II  38.51 
 
 
723 aa  515  1e-144  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3373  DNA-dependent helicase II  37.93 
 
 
722 aa  511  1e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5401  DNA-dependent helicase II  37.69 
 
 
728 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0541595 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0468  DNA-dependent helicase II  38.15 
 
 
721 aa  509  1e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  6.57213e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2793  ATP-dependent DNA helicase  38.41 
 
 
737 aa  511  1e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.78375e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0467  DNA-dependent helicase II  38.19 
 
 
722 aa  511  1e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1352  UvrD/REP helicase  37.17 
 
 
807 aa  508  1e-142  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4015  DNA-dependent helicase II  37.37 
 
 
722 aa  508  1e-142  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0469  DNA-dependent helicase II  37.93 
 
 
722 aa  508  1e-142  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.154526  normal  0.949387 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3385  DNA-dependent helicase II  37.81 
 
 
726 aa  508  1e-142  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5260  DNA-dependent helicase II  37.52 
 
 
728 aa  506  1e-142  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.658271 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0441  DNA-dependent helicase II  37.5 
 
 
722 aa  508  1e-142  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419194  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1619  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.17 
 
 
718 aa  508  1e-142  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3892  DNA-dependent helicase II  37.5 
 
 
722 aa  508  1e-142  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1196  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.29 
 
 
738 aa  508  1e-142  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3818  DNA-dependent helicase II  37.5 
 
 
722 aa  508  1e-142  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5352  DNA-dependent helicase II  37.52 
 
 
728 aa  506  1e-142  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.138491 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_979  UvrD/REP helicase  37.2 
 
 
738 aa  506  1e-142  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0757  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.22 
 
 
773 aa  506  1e-142  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476102  hitchhiker  0.0068011 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3458  UvrD/REP helicase  38.61 
 
 
762 aa  507  1e-142  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4166  DNA helicase II  38.11 
 
 
720 aa  502  1e-141  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5252  DNA-dependent helicase II  38.01 
 
 
720 aa  503  1e-141  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4179  DNA-dependent helicase II  38.01 
 
 
720 aa  503  1e-141  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.654606  normal  0.0232596 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0187  DNA-dependent helicase II  38.4 
 
 
720 aa  503  1e-141  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.276236  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03638  hypothetical protein  38.01 
 
 
720 aa  503  1e-141  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0813  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.75 
 
 
830 aa  504  1e-141  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00156939  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4038  DNA-dependent helicase II  38.11 
 
 
720 aa  503  1e-141  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03689  DNA-dependent ATPase I and helicase II  38.01 
 
 
720 aa  503  1e-141  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3642  DNA-dependent helicase II  37.88 
 
 
726 aa  503  1e-141  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4273  DNA-dependent helicase II  38.01 
 
 
720 aa  502  1e-141  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>