26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_0028 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010830  Aasi_0028  hypothetical protein  100 
 
 
914 aa  1894  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1741  hypothetical protein  29.72 
 
 
977 aa  421  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1427  hypothetical protein  28.25 
 
 
936 aa  315  2e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6241  hypothetical protein  27.24 
 
 
919 aa  292  2e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.950662  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5623  WD40 domain protein beta Propeller  22.73 
 
 
956 aa  97.8  8e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.101899 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0966  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  20.85 
 
 
976 aa  89.4  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000198927  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2492  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  20.23 
 
 
970 aa  81.6  5e-14  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1737  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  20.55 
 
 
1021 aa  75.5  4e-12  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.349792  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2102  WD40 domain protein beta Propeller  20 
 
 
1078 aa  71.2  9e-11  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2193  WD40 domain protein beta Propeller  20.97 
 
 
1077 aa  70.5  1e-10  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08230  WD40 domain protein beta Propeller  18.83 
 
 
918 aa  58.5  5e-07  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0629  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  25.88 
 
 
1028 aa  57.4  1e-06  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2423  WD40 domain protein beta Propeller  21.43 
 
 
881 aa  51.6  6e-05  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0538  hypothetical protein  24.75 
 
 
885 aa  51.2  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000796497  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2806  WD40 domain protein beta Propeller  30.28 
 
 
509 aa  49.7  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1988  hypothetical protein  23.75 
 
 
923 aa  49.3  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.36521  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2573  amidohydrolase family protein  27.91 
 
 
1071 aa  47  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.186395  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2060  WD40 domain-containing protein  22.42 
 
 
1206 aa  47  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.456517  normal  0.995925 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1914  WD40 domain protein beta Propeller  21.59 
 
 
1060 aa  47  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.657093  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0068  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  27.18 
 
 
422 aa  46.2  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0067  tol-pal system beta propeller repeat protein TolB  27.18 
 
 
422 aa  46.2  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.518188  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  25.95 
 
 
407 aa  45.8  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  2.66488e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0249  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  25.86 
 
 
497 aa  45.8  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1775  amidohydrolase  28.97 
 
 
1010 aa  45.4  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0563559  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5713  peptidase S41  25.79 
 
 
1097 aa  45.4  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0183414 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0566  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  23.91 
 
 
428 aa  45.1  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.22163  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>