114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_0027 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010830  Aasi_0027  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 
357 aa  724  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4679  permease YjgP/YjgQ family protein  46.78 
 
 
360 aa  340  2e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1198  permease  46.39 
 
 
359 aa  332  7e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00112188  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2956  permease YjgP/YjgQ family protein  45.81 
 
 
358 aa  328  7e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.199366  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1429  permease YjgP/YjgQ family protein  37.22 
 
 
367 aa  239  7e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.398459  normal  0.880258 
 
 
-
 
NC_002950  PG0501  hypothetical protein  33.99 
 
 
360 aa  235  9e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.183407 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6917  permease YjgP/YjgQ family protein  36.29 
 
 
359 aa  226  5e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.186439  normal  0.723746 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0044  permease YjgP/YjgQ family protein  32.49 
 
 
362 aa  199  4e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.484166  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00860  hypothetical protein  32.29 
 
 
359 aa  189  8e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1984  permease YjgP/YjgQ family protein  33.05 
 
 
358 aa  188  1e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1695  permease YjgP/YjgQ family protein  27.86 
 
 
361 aa  153  6e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2369  permease YjgP/YjgQ family protein  29.25 
 
 
359 aa  150  2e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.792203  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2033  permease YjgP/YjgQ family protein  26.67 
 
 
360 aa  149  6e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.971288 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0302  hypothetical protein  28.93 
 
 
359 aa  149  9e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1831  permease YjgP/YjgQ family protein  26.23 
 
 
387 aa  144  2e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0389  hypothetical protein  24.86 
 
 
360 aa  130  5e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.534497 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2026  permease YjgP/YjgQ family protein  26.42 
 
 
358 aa  120  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.507643  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0409  permease YjgP/YjgQ family protein  22.59 
 
 
360 aa  109  8e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0106  permease YjgP/YjgQ family protein  22.91 
 
 
356 aa  100  3e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0157  permease YjgP/YjgQ family protein  25.77 
 
 
1111 aa  97.1  4e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  6.84055e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0188  permease YjgP/YjgQ family protein  22.22 
 
 
360 aa  96.7  5e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258028  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  26.69 
 
 
359 aa  91.3  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  4.76298e-05  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1090  permease YjgP/YjgQ family protein  25.28 
 
 
1061 aa  86.7  6e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0453768  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1030  permease YjgP/YjgQ family protein  25.56 
 
 
1061 aa  85.9  9e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3408  permease YjgP/YjgQ family protein  22.29 
 
 
360 aa  85.5  1e-15  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.328575  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3470  permease YjgP/YjgQ family protein  22.6 
 
 
360 aa  84  3e-15  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1510  permease YjgP/YjgQ family protein  22.81 
 
 
396 aa  82.4  1e-14  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000161428 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1543  permease YjgP/YjgQ family protein  23.68 
 
 
1096 aa  80.9  3e-14  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00918394  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2678  permease YjgP/YjgQ family protein  26.04 
 
 
371 aa  81.3  3e-14  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  1.97081e-05  normal  0.64085 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  23.51 
 
 
792 aa  79.7  8e-14  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1352  permease YjgP/YjgQ family protein  22.63 
 
 
1153 aa  79.3  9e-14  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.929762  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1923  hypothetical protein  23.75 
 
 
362 aa  79  1e-13  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.24425e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2733  permease YjgP/YjgQ family protein  23.99 
 
 
360 aa  78.2  2e-13  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.193527  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  19.44 
 
 
356 aa  75.9  9e-13  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1923  hypothetical protein  22.13 
 
 
358 aa  75.9  1e-12  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.765584  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0112  permease YjgP/YjgQ family protein  24.78 
 
 
370 aa  72  2e-11  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.378963  hitchhiker  0.000636313 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0148  permease YjgP/YjgQ family protein  23.16 
 
 
364 aa  71.6  2e-11  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.496142  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1297  permease YjgP/YjgQ family protein  22.6 
 
 
358 aa  71.6  2e-11  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0266045  normal  0.200906 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1307  permease YjgP/YjgQ family protein  21.53 
 
 
356 aa  71.6  2e-11  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  22.5 
 
 
359 aa  70.1  6e-11  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2734  permease YjgP/YjgQ family protein  22.04 
 
 
364 aa  68.9  1e-10  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121109  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  22.96 
 
 
391 aa  67  5e-10  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1542  hypothetical protein  22.74 
 
 
362 aa  65.1  2e-09  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  21.56 
 
 
365 aa  63.9  4e-09  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1639  permease YjgP/YjgQ family protein  20.22 
 
 
359 aa  63.9  4e-09  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  2.66176e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17610  permease YjgP/YjgQ family protein  23.43 
 
 
1040 aa  62.8  9e-09  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0512  hypothetical protein  21.51 
 
 
394 aa  60.5  4e-08  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1512  permease YjgP/YjgQ family protein  20.33 
 
 
374 aa  60.1  6e-08  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2199  YjgP/YjgQ family protein  22.26 
 
 
357 aa  60.1  6e-08  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0311  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1855  permease YjgP/YjgQ family protein  22.26 
 
 
357 aa  60.1  6e-08  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0824  permease YjgP/YjgQ family protein  30.95 
 
 
444 aa  59.3  9e-08  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00713526  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0135  permease YjgP/YjgQ family protein  20.39 
 
 
395 aa  59.7  9e-08  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  1.06292e-06 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1044  hypothetical protein  20.6 
 
 
357 aa  59.3  1e-07  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000929765  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0138  permease YjgP/YjgQ family protein  20.11 
 
 
395 aa  58.2  2e-07  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  32.73 
 
 
441 aa  58.2  2e-07  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  22.96 
 
 
388 aa  57.4  4e-07  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1949  permease, putative  21.7 
 
 
359 aa  56.2  7e-07  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  5.28059e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  20.64 
 
 
418 aa  55.8  1e-06  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  1.03776e-08  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0538  permease YjgP/YjgQ  21.1 
 
 
392 aa  55.5  1e-06  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.914546  decreased coverage  0.0076294 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1837  permease YjgP/YjgQ family protein  18.6 
 
 
434 aa  55.1  2e-06  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  21.22 
 
 
389 aa  54.3  3e-06  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  3.06059e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0201  permease-like  23.53 
 
 
353 aa  53.9  5e-06  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2588  permease YjgP/YjgQ family protein  20.22 
 
 
359 aa  53.5  6e-06  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0679  permease YjgP/YjgQ family protein  23.33 
 
 
350 aa  52  1e-05  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0048  permease YjgP/YjgQ  22.89 
 
 
352 aa  52  2e-05  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.71316 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0948  permease YjgP/YjgQ  22.93 
 
 
368 aa  51.2  3e-05  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.046524  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0764  permease YjgP/YjgQ family protein  21.69 
 
 
360 aa  50.8  3e-05  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.27721 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3066  permease YjgP/YjgQ family protein  21.95 
 
 
355 aa  50.8  3e-05  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.326563 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1462  permease YjgP/YjgQ family protein  23.9 
 
 
495 aa  50.8  4e-05  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3417  permease YjgP/YjgQ family protein  24.58 
 
 
402 aa  50.8  4e-05  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1803  permease YjgP/YjgQ family protein  20.6 
 
 
360 aa  48.9  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1758  permease YjgP/YjgQ  21.97 
 
 
359 aa  48.9  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.111369  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3906  permease YjgP/YjgQ family protein  22.64 
 
 
364 aa  48.9  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101801  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1909  permease YjgP/YjgQ  22.03 
 
 
354 aa  48.1  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2209  permease YjgP/YjgQ family protein  28.35 
 
 
377 aa  48.1  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.145759  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2837  permease YjgP/YjgQ family protein  22.71 
 
 
364 aa  48.1  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.240939  normal  0.233455 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1679  permease YjgP/YjgQ family protein  20.83 
 
 
409 aa  48.9  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.164561  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1901  permease YjgP/YjgQ family protein  24.51 
 
 
441 aa  48.1  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2177  permease YjgP/YjgQ  22.16 
 
 
366 aa  47.8  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1394  permease YjgP/YjgQ family protein  24.27 
 
 
371 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00373064  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1490  permease YjgP/YjgQ family protein  24.27 
 
 
371 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.857253  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2465  permease YjgP/YjgQ  24.27 
 
 
371 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.174888  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  22.3 
 
 
442 aa  47.4  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1407  permease YjgP/YjgQ family protein  24.22 
 
 
378 aa  47.4  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.185064 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  22.66 
 
 
403 aa  46.6  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00813484  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1545  permease YjgP/YjgQ family protein  20.97 
 
 
364 aa  47  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0902  permease YjgP/YjgQ family protein  23.44 
 
 
382 aa  46.6  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0497689 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1746  permease YjgP/YjgQ  22.57 
 
 
370 aa  46.6  0.0007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.108168  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2901  putative permease  20.97 
 
 
364 aa  46.6  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220999  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1120  permease YjgP/YjgQ family protein  22.4 
 
 
364 aa  46.2  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.187975 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0495  permease YjgP/YjgQ  19.43 
 
 
366 aa  46.2  0.0009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1678  permease YjgP/YjgQ family protein  20.95 
 
 
354 aa  45.8  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.936868  normal  0.549476 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2508  permease YjgP/YjgQ family protein  20.5 
 
 
389 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1402  permease YjgP/YjgQ family protein  26.47 
 
 
370 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.999053 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0437  hypothetical protein  25.71 
 
 
443 aa  45.4  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2529  permease YjgP/YjgQ family protein  29.31 
 
 
367 aa  46.2  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.337345  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  23.54 
 
 
382 aa  45.1  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  2.29527e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4924  permease YjgP/YjgQ family protein  21.22 
 
 
369 aa  44.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5426  hypothetical protein  29.85 
 
 
230 aa  45.1  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.521103  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0685  permease YjgP/YjgQ family protein  21.35 
 
 
337 aa  45.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  2.42264e-05  normal  0.0380984 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>