More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_0026 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010830  Aasi_0026  queuine tRNA-ribosyltransferase  100 
 
 
374 aa  787  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4079  queuine tRNA-ribosyltransferase  65.69 
 
 
376 aa  516  1e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.137728 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3359  queuine tRNA-ribosyltransferase  65.52 
 
 
377 aa  514  1e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.142206  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1985  queuine tRNA-ribosyltransferase  63.83 
 
 
376 aa  506  1e-142  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1430  queuine tRNA-ribosyltransferase  63.3 
 
 
376 aa  497  1e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.143529  normal  0.876583 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1197  queuine tRNA-ribosyltransferase (tRNA-guanine transglycosylase)  60.37 
 
 
376 aa  495  1e-139  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.196997  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0045  queuine tRNA-ribosyltransferase  61.97 
 
 
376 aa  492  1e-138  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.642849  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6918  queuine tRNA-ribosyltransferase  62.5 
 
 
376 aa  489  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.625358  normal  0.464203 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00865  queuine tRNA-ribosyltransferase  61.17 
 
 
376 aa  486  1e-136  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0500  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.51 
 
 
376 aa  461  1e-129  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.260336 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0710  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.12 
 
 
376 aa  450  1e-125  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0931  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.95 
 
 
394 aa  385  1e-106  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1457  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.44 
 
 
375 aa  382  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000844701  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0382  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.25 
 
 
357 aa  380  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0712  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.73 
 
 
377 aa  381  1e-104  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1404  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.92 
 
 
376 aa  380  1e-104  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.2387 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0521  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.69 
 
 
371 aa  377  1e-103  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1259  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.92 
 
 
379 aa  376  1e-103  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0632  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.25 
 
 
392 aa  372  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1759  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.92 
 
 
377 aa  372  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1756  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.12 
 
 
377 aa  373  1e-102  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.185271  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12290  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.4 
 
 
373 aa  371  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  3.56741e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0530  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.7 
 
 
373 aa  371  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00176978  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0964  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.22 
 
 
377 aa  371  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1927  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.14 
 
 
383 aa  371  1e-101  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000713351  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1591  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.2 
 
 
379 aa  365  1e-100  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00100827  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0579  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.59 
 
 
370 aa  364  2e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.350695  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1512  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.39 
 
 
379 aa  363  4e-99  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0852  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.52 
 
 
370 aa  362  7e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1791  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.57 
 
 
370 aa  361  1e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  3.78979e-06  hitchhiker  0.00274251 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1194  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.84 
 
 
367 aa  360  2e-98  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2619  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.32 
 
 
373 aa  360  2e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1716  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.06 
 
 
371 aa  359  3e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.2965  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.03 
 
 
369 aa  360  3e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0231453  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2026  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.36 
 
 
407 aa  358  6e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3622  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.59 
 
 
372 aa  358  6e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00110996  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0907  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.98 
 
 
372 aa  358  1e-97  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2844  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.04 
 
 
377 aa  357  2e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1278  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.18 
 
 
394 aa  356  3e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0958  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.51 
 
 
374 aa  356  4e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0452051  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2647  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.92 
 
 
381 aa  355  6e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  9.56702e-08  hitchhiker  0.00180241 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1428  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.48 
 
 
369 aa  355  8e-97  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00175971  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2757  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.18 
 
 
386 aa  355  9e-97  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.717518 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1359  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.96 
 
 
372 aa  355  1e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000569759  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1114  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.31 
 
 
373 aa  353  2e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.34463  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0218  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.66 
 
 
376 aa  353  2e-96  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.989201  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3278  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.38 
 
 
369 aa  354  2e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.275264  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2017  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.59 
 
 
380 aa  353  2e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000528319  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1315  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.99 
 
 
376 aa  353  2e-96  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1606  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.99 
 
 
388 aa  353  3e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.894963  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1019  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.75 
 
 
381 aa  352  4e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1524  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.35 
 
 
383 aa  352  5e-96  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000558338  normal  0.0203734 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1703  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.1 
 
 
383 aa  352  6e-96  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108277  normal  0.62465 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01046  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.63 
 
 
378 aa  352  7e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3361  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.63 
 
 
472 aa  352  8e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0872044  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2337  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.37 
 
 
374 aa  351  1e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00144843  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1267  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.51 
 
 
373 aa  351  1e-95  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2892  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.37 
 
 
377 aa  351  1e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.103545  hitchhiker  0.000645764 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3990  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.92 
 
 
396 aa  351  1e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.259551 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1187  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.4 
 
 
384 aa  351  1e-95  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00200873  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1203  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.22 
 
 
379 aa  351  1e-95  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.261953  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0276  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.58 
 
 
377 aa  350  2e-95  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000356589  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1666  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.52 
 
 
370 aa  350  2e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.098612  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2573  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.63 
 
 
397 aa  350  2e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2193  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.37 
 
 
374 aa  350  2e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0616046  normal  0.0257357 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3328  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.63 
 
 
397 aa  350  2e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.162119  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2387  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.63 
 
 
397 aa  350  2e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1165  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.63 
 
 
397 aa  350  2e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.179436  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2011  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.99 
 
 
380 aa  350  2e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.638578  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0303  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.63 
 
 
397 aa  350  2e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1382  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.81 
 
 
374 aa  350  3e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000246245  hitchhiker  1.18913e-05 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1447  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.81 
 
 
374 aa  350  3e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  3.28041e-06  normal  0.0357414 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2702  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.03 
 
 
374 aa  350  3e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  6.54614e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3291  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.47 
 
 
381 aa  350  3e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3371  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.63 
 
 
397 aa  350  3e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1435  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.81 
 
 
374 aa  350  3e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  6.52098e-07  hitchhiker  0.000858372 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1470  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.47 
 
 
377 aa  350  3e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00097364  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2484  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.54 
 
 
374 aa  349  4e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  5.74895e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2882  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.54 
 
 
374 aa  349  5e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  3.63226e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2787  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.54 
 
 
374 aa  349  5e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  1.35544e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3097  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.7 
 
 
387 aa  349  5e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141745  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1570  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.54 
 
 
374 aa  349  5e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  1.09087e-05  hitchhiker  1.08069e-07 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2807  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.54 
 
 
374 aa  348  7e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  3.11087e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1782  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.68 
 
 
372 aa  348  7e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114635 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1800  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.15 
 
 
374 aa  348  8e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3123  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.63 
 
 
374 aa  348  1e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00561158  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3264  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.63 
 
 
374 aa  348  1e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000400897  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1729  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.94 
 
 
379 aa  347  1e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37523  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3384  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.63 
 
 
374 aa  348  1e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000344335  normal  0.488605 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1696  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.94 
 
 
379 aa  347  1e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3810  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.84 
 
 
395 aa  347  2e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2518  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.01 
 
 
380 aa  347  3e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00624233  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0605  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.96 
 
 
395 aa  346  3e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004367  tRNA-guanine transglycosylase  45.82 
 
 
382 aa  347  3e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.41 
 
 
372 aa  346  4e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0833  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.88 
 
 
371 aa  346  5e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.936074  normal  0.0233256 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0863  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.88 
 
 
377 aa  346  5e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.313127 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1228  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.09 
 
 
369 aa  345  5e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.14064e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1401  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.09 
 
 
377 aa  345  6e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  3.97481e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3113  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.54 
 
 
374 aa  345  7e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>