More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_0024 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_5031  excinuclease ABC, C subunit  55.84 
 
 
603 aa  694  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3221  excinuclease ABC, C subunit  56.16 
 
 
602 aa  715  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.0605848 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0726  excinuclease ABC subunit C  53.82 
 
 
597 aa  647  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.305976  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1283  excinuclease ABC subunit C  53.49 
 
 
596 aa  644  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0859  hypothetical protein  62.71 
 
 
598 aa  731  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00473 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0024  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 
596 aa  1222  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04670  excinuclease ABC, C subunit  51.81 
 
 
598 aa  629  1e-179  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0175  excinuclease ABC, subunit C  50.26 
 
 
596 aa  598  1e-170  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.149834  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0387  excinuclease ABC, C subunit  51.17 
 
 
598 aa  601  1e-170  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.971851 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0477  excinuclease ABC, C subunit  48.38 
 
 
615 aa  575  1e-163  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.966563  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1993  excinuclease ABC subunit C  46.77 
 
 
599 aa  546  1e-154  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.589477 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1254  excinuclease ABC, C subunit  42.95 
 
 
615 aa  486  1e-136  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1795  excinuclease ABC subunit C  40.96 
 
 
619 aa  465  1e-129  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625929  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0710  excinuclease ABC subunit C  42.22 
 
 
631 aa  461  1e-128  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.314555  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1772  excinuclease ABC subunit C  41.16 
 
 
628 aa  455  1e-126  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.736337 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1341  excinuclease ABC subunit C  41.74 
 
 
629 aa  449  1e-125  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1652  excinuclease ABC subunit C  41.36 
 
 
616 aa  451  1e-125  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  39.77 
 
 
607 aa  446  1e-124  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2063  excinuclease ABC subunit C  39.9 
 
 
627 aa  446  1e-124  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.760061  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0485  excinuclease ABC subunit C  39.05 
 
 
628 aa  437  1e-121  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2610  excinuclease ABC subunit C  40.35 
 
 
591 aa  409  1e-113  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0835945  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0841  excinuclease ABC subunit C  39.13 
 
 
590 aa  401  1e-110  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3117  excinuclease ABC subunit C  37.79 
 
 
610 aa  402  1e-110  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3219  excinuclease ABC subunit C  40.21 
 
 
596 aa  401  1e-110  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.831244  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1467  excinuclease ABC subunit C  37.9 
 
 
604 aa  398  1e-109  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0063  excinuclease ABC, C subunit  37.52 
 
 
641 aa  397  1e-109  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4628  excinuclease ABC subunit C  39.44 
 
 
594 aa  394  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1804  excinuclease ABC subunit C  38.4 
 
 
599 aa  394  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.919457  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4647  excinuclease ABC subunit C  39.51 
 
 
594 aa  392  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4267  excinuclease ABC subunit C  39.09 
 
 
594 aa  392  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0544521  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4757  excinuclease ABC subunit C  38.92 
 
 
594 aa  390  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4648  excinuclease ABC subunit C  39.34 
 
 
594 aa  391  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4348  excinuclease ABC subunit C  38.99 
 
 
594 aa  392  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4632  excinuclease ABC subunit C  39.09 
 
 
594 aa  392  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4416  excinuclease ABC subunit C  38.92 
 
 
594 aa  390  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0607  excinuclease ABC subunit C  39.34 
 
 
594 aa  390  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4255  excinuclease ABC subunit C  39.09 
 
 
594 aa  392  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2010  excinuclease ABC subunit C  36.38 
 
 
611 aa  386  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_999  excinuclease ABC, C subunit  36.69 
 
 
607 aa  384  1e-105  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1216  excinuclease ABC subunit C  36.53 
 
 
607 aa  381  1e-104  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.423233  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1026  excinuclease ABC subunit C  36.86 
 
 
607 aa  382  1e-104  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0775  excinuclease ABC, C subunit  37.94 
 
 
613 aa  380  1e-104  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2610  excinuclease ABC, C subunit  36.52 
 
 
653 aa  381  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  37.25 
 
 
624 aa  382  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1145  excinuclease ABC, C subunit  38.53 
 
 
613 aa  380  1e-104  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000360051  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1205  excinuclease ABC subunit C  38.79 
 
 
593 aa  380  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1227  excinuclease ABC subunit C  38.79 
 
 
593 aa  380  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0729  excinuclease ABC subunit C  37.92 
 
 
594 aa  375  1e-103  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0254  excinuclease ABC, C subunit  35.46 
 
 
601 aa  375  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0256  excinuclease ABC subunit C  36.12 
 
 
613 aa  375  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0327  excinuclease ABC subunit C  36.33 
 
 
628 aa  372  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  4.67295e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0333  excinuclease ABC subunit C  35.77 
 
 
620 aa  366  1e-100  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3057  excinuclease ABC subunit C  35.75 
 
 
588 aa  366  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2035  excinuclease ABC, C subunit  34.59 
 
 
685 aa  366  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0230334  hitchhiker  0.00678437 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0295  excinuclease ABC, C subunit  33.44 
 
 
614 aa  367  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2526  excinuclease ABC subunit C  34.98 
 
 
666 aa  367  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.775537  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0341  excinuclease ABC subunit C  35.77 
 
 
620 aa  364  2e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1864  excinuclease ABC, C subunit  36.89 
 
 
610 aa  365  2e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0022  excinuclease ABC subunit C  34.79 
 
 
613 aa  363  4e-99  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1321  excinuclease ABC subunit C  38.38 
 
 
516 aa  363  6e-99  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0107777  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1222  excinuclease ABC subunit C  37.85 
 
 
593 aa  363  6e-99  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.11085  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1110  excinuclease ABC subunit C  34.38 
 
 
641 aa  362  8e-99  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.537728  normal  0.126972 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3154  excinuclease ABC, C subunit  35.16 
 
 
669 aa  362  1e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1044  excinuclease ABC, C subunit  35.93 
 
 
616 aa  362  1e-98  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00420676  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1823  excinuclease ABC, C subunit  35.87 
 
 
622 aa  361  2e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1145  excinuclease ABC, C subunit  36.91 
 
 
594 aa  360  3e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2709  excinuclease ABC subunit C  38 
 
 
519 aa  358  2e-97  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.890107  normal  0.0209335 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1120  excinuclease ABC subunit C  36.05 
 
 
617 aa  358  2e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114931  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1091  excinuclease ABC subunit C  36.05 
 
 
617 aa  358  2e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1271  excinuclease ABC subunit C  37 
 
 
606 aa  357  3e-97  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15160  Excinuclease ABC subunit C  35.25 
 
 
650 aa  357  5e-97  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4295  excinuclease ABC subunit C  35.26 
 
 
627 aa  356  5e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30660  excinuclease ABC subunit C  34.63 
 
 
608 aa  355  1e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.385406  hitchhiker  0.0074174 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0044  excinuclease ABC, C subunit  36.14 
 
 
613 aa  354  2e-96  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.101531  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2614  excinuclease ABC subunit C  34.63 
 
 
608 aa  354  2e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137181  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0381  excinuclease ABC subunit C  36.12 
 
 
624 aa  354  2e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00582  excinuclease ABC subunit C  34.4 
 
 
618 aa  354  3e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11300  excinuclease ABC subunit C  35 
 
 
643 aa  353  3e-96  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.222126  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0938  excinuclease ABC, C subunit  33.77 
 
 
644 aa  354  3e-96  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2978  excinuclease ABC, C subunit  33.81 
 
 
665 aa  354  3e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  4.26335e-05 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4536  excinuclease ABC, C subunit  34.93 
 
 
647 aa  353  5e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00719023  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2038  excinuclease ABC subunit C  34.65 
 
 
603 aa  353  7e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.331579  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2059  excinuclease ABC subunit C  34.06 
 
 
692 aa  352  9e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0373675  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2021  excinuclease ABC subunit C  34.49 
 
 
656 aa  352  1e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387091  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2375  excinuclease ABC subunit C  32.5 
 
 
626 aa  352  1e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.467747  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1410  excinuclease ABC subunit C  33.67 
 
 
621 aa  352  1e-95  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1316  excinuclease ABC subunit C  33.67 
 
 
627 aa  352  1e-95  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.235211  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2359  excinuclease ABC, C subunit  31.88 
 
 
671 aa  352  1e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.660798  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0979  excinuclease ABC, C subunit  34.41 
 
 
623 aa  351  2e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0363417 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1362  excinuclease ABC subunit C  33.83 
 
 
611 aa  351  2e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.884945  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1553  excinuclease ABC subunit C  34.07 
 
 
638 aa  351  2e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.081195 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2194  excinuclease ABC, C subunit  32.76 
 
 
684 aa  351  2e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.010209  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3023  excinuclease ABC, C subunit  34.35 
 
 
607 aa  351  3e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.623507  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0853  excinuclease ABC, C subunit  34.3 
 
 
608 aa  350  4e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3228  excinuclease ABC subunit C  35.32 
 
 
614 aa  349  7e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0438177  normal  0.345048 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3342  excinuclease ABC subunit C  33.98 
 
 
622 aa  349  7e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.991937  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2896  excinuclease ABC subunit C  34.06 
 
 
607 aa  349  7e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.189646  normal  0.894143 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1192  excinuclease ABC, C subunit  35.06 
 
 
619 aa  348  1e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0751579  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1879  excinuclease ABC subunit C  33.78 
 
 
617 aa  348  2e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  1.1349e-07  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10610  excinuclease ABC, C subunit  34.05 
 
 
666 aa  347  3e-94  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  3.42389e-08 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>