More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_0015 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010830  Aasi_0015  thioredoxin reductase  100 
 
 
315 aa  647    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6236  thioredoxin reductase  61.31 
 
 
314 aa  413  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.215918  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1780  thioredoxin reductase  64.97 
 
 
323 aa  408  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.720835 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0086  thioredoxin reductase  64.17 
 
 
320 aa  409  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.585746 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7121  thioredoxin reductase  62.58 
 
 
327 aa  402  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1778  thioredoxin-disulfide reductase  61.64 
 
 
315 aa  404  1e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.246241  decreased coverage  0.00675935 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1613  thioredoxin reductase  61.64 
 
 
322 aa  401  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11253  putative thioredoxin reductase  60.51 
 
 
326 aa  394  1e-108  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  60.07 
 
 
334 aa  380  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1354  thioredoxin reductase  58.82 
 
 
313 aa  373  1e-102  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0199  thioredoxin reductase  57.83 
 
 
315 aa  367  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1134  thioredoxin reductase  54.93 
 
 
313 aa  355  6.999999999999999e-97  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.788555 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0414  thioredoxin reductase  56.11 
 
 
314 aa  348  9e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0681074  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4061  thioredoxin reductase  57 
 
 
314 aa  346  2e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4094  thioredoxin reductase  57 
 
 
314 aa  347  2e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00339774  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2441  thioredoxin reductase  52.79 
 
 
345 aa  330  2e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0877885  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1544  thioredoxin reductase  53.31 
 
 
311 aa  328  7e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  54.46 
 
 
348 aa  325  7e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3951  thioredoxin reductase  57.33 
 
 
314 aa  325  8.000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0814  thioredoxin reductase  52.65 
 
 
311 aa  324  1e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0056  thioredoxin reductase  53.46 
 
 
326 aa  324  1e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1151  thioredoxin reductase  52.67 
 
 
311 aa  324  1e-87  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000793818  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1026  thioredoxin reductase  54.13 
 
 
324 aa  324  1e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.15779  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1092  thioredoxin reductase  53.47 
 
 
324 aa  323  3e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1260  thioredoxin reductase  51.82 
 
 
311 aa  323  3e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2898  thioredoxin reductase  56.11 
 
 
314 aa  323  3e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0473  thioredoxin reductase  56.67 
 
 
314 aa  322  4e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.499551 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  52.79 
 
 
332 aa  322  5e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1197  thioredoxin reductase  52.32 
 
 
311 aa  322  5e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.711369  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1221  thioredoxin reductase  53.47 
 
 
324 aa  321  8e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3203  thioredoxin reductase  52.29 
 
 
361 aa  320  1.9999999999999998e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.121454  normal  0.627549 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3338  thioredoxin reductase  51.83 
 
 
331 aa  320  1.9999999999999998e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1207  thioredoxin reductase  52.33 
 
 
311 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.12437  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3812  thioredoxin reductase  51.79 
 
 
460 aa  319  3e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2370  thioredoxin reductase  53.5 
 
 
316 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274866  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6803  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  53.47 
 
 
321 aa  318  7e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2043  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3793  thioredoxin reductase  53.64 
 
 
325 aa  318  7e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119595  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  51.63 
 
 
319 aa  317  1e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0256  thioredoxin reductase  51.28 
 
 
335 aa  317  2e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.464072 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1248  thioredoxin reductase  52.08 
 
 
324 aa  317  2e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.335568  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2880  thioredoxin reductase  52.48 
 
 
321 aa  317  2e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.805293  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4027  thioredoxin reductase  50.65 
 
 
323 aa  316  3e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2753  thioredoxin reductase  52.4 
 
 
320 aa  316  3e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0375  thioredoxin-disulfide reductase  52.65 
 
 
323 aa  315  4e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0545  thioredoxin reductase  52.65 
 
 
323 aa  315  4e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.192083  hitchhiker  0.00000399991 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2453  thioredoxin reductase  52.15 
 
 
321 aa  315  7e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1576  thioredoxin reductase  51.82 
 
 
317 aa  315  7e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0228  thioredoxin reductase  51.82 
 
 
312 aa  315  8e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0563  thioredoxin reductase  54.43 
 
 
326 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0552475  normal  0.0148693 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0145  thioredoxin reductase  52.49 
 
 
321 aa  314  9.999999999999999e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3139  thioredoxin-disulfide reductase  52.58 
 
 
338 aa  313  1.9999999999999998e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0803  thioredoxin reductase  53.55 
 
 
318 aa  313  2.9999999999999996e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2343  thioredoxin reductase  50.16 
 
 
322 aa  313  2.9999999999999996e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1226  thioredoxin reductase  55.41 
 
 
325 aa  312  3.9999999999999997e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0763  thioredoxin reductase  51.12 
 
 
319 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3686  thioredoxin reductase  55.56 
 
 
316 aa  312  4.999999999999999e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000489943  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2982  thioredoxin reductase  52.77 
 
 
324 aa  312  5.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0371232 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2112  thioredoxin reductase  50.48 
 
 
324 aa  312  5.999999999999999e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0614  thioredoxin reductase  50 
 
 
313 aa  311  6.999999999999999e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.305667  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0703  thioredoxin reductase  52.05 
 
 
321 aa  311  7.999999999999999e-84  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0791  thioredoxin reductase  52.05 
 
 
321 aa  311  7.999999999999999e-84  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3781  thioredoxin reductase  55.74 
 
 
316 aa  311  1e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0887  thioredoxin reductase  51.16 
 
 
319 aa  311  1e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1838  thioredoxin reductase  54.1 
 
 
321 aa  310  2e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2145  thioredoxin reductase  53.14 
 
 
314 aa  310  2e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.610006 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2721  thioredoxin reductase  52.44 
 
 
324 aa  310  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.137171  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1072  thioredoxin reductase  53.5 
 
 
322 aa  309  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00976208  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0991  thioredoxin reductase  53.5 
 
 
322 aa  309  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0860266  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2006  thioredoxin reductase  53.27 
 
 
317 aa  309  4e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0963  thioredoxin reductase  53.5 
 
 
322 aa  309  4e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000679645  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1057  thioredoxin reductase  53.5 
 
 
322 aa  309  4e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00951777  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1023  thioredoxin reductase  53.5 
 
 
322 aa  309  4e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00170984  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2812  thioredoxin reductase  51.12 
 
 
326 aa  309  4e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4859  thioredoxin reductase  50.98 
 
 
310 aa  308  6.999999999999999e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2233  thioredoxin reductase  53.97 
 
 
321 aa  308  8e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000186252  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1694  thioredoxin-disulfide reductase  53.7 
 
 
317 aa  308  9e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0030  thioredoxin reductase  51.76 
 
 
320 aa  308  9e-83  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3654  thioredoxin reductase  51.13 
 
 
458 aa  308  9e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.24215  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1611  thioredoxin reductase  52.38 
 
 
320 aa  308  1.0000000000000001e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000152855  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2598  thioredoxin-disulfide reductase  52.38 
 
 
320 aa  308  1.0000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000212052  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2687  thioredoxin reductase  52.38 
 
 
320 aa  308  1.0000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.643501  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1664  thioredoxin reductase  54.05 
 
 
324 aa  307  1.0000000000000001e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.28715  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2342  thioredoxin reductase oxidoreductase protein  53.18 
 
 
318 aa  306  2.0000000000000002e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.187147 
 
 
-
 
NC_004310  BR1499  thioredoxin reductase  53.33 
 
 
324 aa  306  2.0000000000000002e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.770592  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5827  thioredoxin reductase  53.31 
 
 
325 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0638947  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00892  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  53.65 
 
 
321 aa  306  3e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2755  thioredoxin reductase  53.65 
 
 
321 aa  306  3e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000254011  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2708  thioredoxin reductase  53.65 
 
 
321 aa  306  3e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000108143  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0992  thioredoxin reductase  53.65 
 
 
321 aa  306  3e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000016798  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  50.66 
 
 
310 aa  306  3e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2441  thioredoxin reductase  53.65 
 
 
321 aa  306  3e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000126981  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0962  thioredoxin reductase  53.65 
 
 
321 aa  306  3e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000099736  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00899  hypothetical protein  53.65 
 
 
321 aa  306  3e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1050  thioredoxin reductase  53.65 
 
 
321 aa  306  3e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000235297  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01640  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding protein  53.11 
 
 
310 aa  305  5.0000000000000004e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00689976  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0488  thioredoxin reductase  55.23 
 
 
316 aa  305  6e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.723059  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2654  thioredoxin reductase  50.16 
 
 
332 aa  305  6e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4637  thioredoxin reductase  50.16 
 
 
456 aa  305  7e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000231293  normal  0.140967 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3838  thioredoxin reductase  52.3 
 
 
321 aa  305  7e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2362  thioredoxin reductase  51.91 
 
 
318 aa  305  7e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>