98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_0011 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010830  Aasi_0011  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 
527 aa  1072  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1788  permease  36.67 
 
 
483 aa  344  2e-93  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0970629 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1984  permease YjgP/YjgQ family protein  35.49 
 
 
501 aa  306  5e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  1.94355e-05  normal  0.0100498 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1059  permease YjgP/YjgQ family protein  32.2 
 
 
498 aa  305  1e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.546166  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3562  permease YjgP/YjgQ family protein  30.13 
 
 
480 aa  238  3e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.326279 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1323  permease YjgP/YjgQ family protein  28.82 
 
 
478 aa  234  3e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.976143 
 
 
-
 
NC_002950  PG0598  hypothetical protein  28.32 
 
 
651 aa  222  1e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1462  permease YjgP/YjgQ family protein  25.95 
 
 
495 aa  182  2e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0241  permease YjgP/YjgQ family protein  25.1 
 
 
481 aa  169  9e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06260  hypothetical protein  25.42 
 
 
456 aa  166  1e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0371515  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  25.66 
 
 
442 aa  157  3e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0824  permease YjgP/YjgQ family protein  24.08 
 
 
444 aa  151  2e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00713526  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  25.88 
 
 
441 aa  152  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0723  hypothetical protein  23.63 
 
 
442 aa  148  2e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.20608  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0437  hypothetical protein  24.29 
 
 
443 aa  136  8e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2110  permease YjgP/YjgQ family protein  25.56 
 
 
486 aa  125  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.185125  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1901  permease YjgP/YjgQ family protein  31.42 
 
 
441 aa  117  6e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  27.7 
 
 
403 aa  102  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00813484  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0309  permease YjgP/YjgQ family protein  22.45 
 
 
417 aa  75.9  2e-12  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  26.63 
 
 
356 aa  65.5  2e-09  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  23.57 
 
 
418 aa  64.3  5e-09  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  1.03776e-08  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  26.23 
 
 
359 aa  60.1  1e-07  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  4.76298e-05  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4390  permease YjgP/YjgQ family protein  28.69 
 
 
391 aa  59.7  1e-07  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2677  permease YjgP/YjgQ family protein  31.09 
 
 
392 aa  58.5  3e-07  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00342239  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  25.73 
 
 
382 aa  57  9e-07  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  2.29527e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  24.39 
 
 
389 aa  56.2  1e-06  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  3.06059e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1922  hypothetical protein  24.87 
 
 
399 aa  56.6  1e-06  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  23.66 
 
 
388 aa  56.6  1e-06  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1307  permease YjgP/YjgQ family protein  22.78 
 
 
356 aa  56.2  2e-06  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1923  hypothetical protein  25.82 
 
 
362 aa  55.5  2e-06  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.24425e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1543  permease YjgP/YjgQ family protein  25.11 
 
 
1096 aa  55.5  3e-06  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00918394  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  23.86 
 
 
391 aa  55.5  3e-06  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1030  permease YjgP/YjgQ family protein  25.36 
 
 
1061 aa  55.5  3e-06  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2734  permease YjgP/YjgQ family protein  21.76 
 
 
364 aa  54.7  4e-06  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121109  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1090  permease YjgP/YjgQ family protein  26.01 
 
 
1061 aa  54.7  5e-06  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0453768  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  21.93 
 
 
391 aa  53.1  1e-05  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  26.71 
 
 
792 aa  53.1  1e-05  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1637  permease YjgP/YjgQ  26.04 
 
 
391 aa  52.8  2e-05  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0299198  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0376  permease YjgP/YjgQ family protein  25.7 
 
 
379 aa  52.4  2e-05  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.116859 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0189  permease YjgP/YjgQ family protein  23.39 
 
 
423 aa  52.4  2e-05  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.437061  normal  0.771409 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08021  putative permease  38.36 
 
 
395 aa  52  3e-05  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0111  permease YjgP/YjgQ family protein  25.83 
 
 
364 aa  52  3e-05  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.482303  hitchhiker  0.000636313 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0170  putative permease  36.99 
 
 
395 aa  51.6  3e-05  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.736703  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0135  permease YjgP/YjgQ family protein  26.32 
 
 
395 aa  51.2  5e-05  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  1.06292e-06 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0138  permease YjgP/YjgQ family protein  26.32 
 
 
395 aa  50.8  5e-05  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1831  permease YjgP/YjgQ family protein  34.67 
 
 
387 aa  50.4  7e-05  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0508  YjgP/YjgQ permease  23.31 
 
 
396 aa  50.4  9e-05  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1695  permease YjgP/YjgQ family protein  36.21 
 
 
361 aa  49.7  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16001  putative permease  38.03 
 
 
401 aa  49.7  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245859  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  23.02 
 
 
365 aa  50.1  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2465  permease YjgP/YjgQ  27.39 
 
 
371 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.174888  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2369  permease YjgP/YjgQ family protein  25.35 
 
 
359 aa  50.1  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.792203  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2176  permease YjgP/YjgQ  24.5 
 
 
402 aa  50.1  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.668049 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2943  permease YjgP/YjgQ  24.14 
 
 
396 aa  48.9  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.263942  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17610  permease YjgP/YjgQ family protein  28.8 
 
 
1040 aa  48.9  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2114  permease YjgP/YjgQ family protein  21.57 
 
 
386 aa  48.9  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.774642 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1247  permease  31.03 
 
 
386 aa  48.9  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1232  permease  36.62 
 
 
384 aa  48.9  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1923  hypothetical protein  30.65 
 
 
358 aa  48.5  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.765584  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1482  putative permease  28.26 
 
 
400 aa  48.5  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0253141  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1984  permease YjgP/YjgQ family protein  27.5 
 
 
358 aa  48.5  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1394  permease YjgP/YjgQ family protein  26.75 
 
 
371 aa  48.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00373064  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1837  permease YjgP/YjgQ family protein  30.36 
 
 
434 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0389  hypothetical protein  23.44 
 
 
360 aa  47.8  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.534497 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3469  permease YjgP/YjgQ family protein  26.85 
 
 
391 aa  48.1  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3066  permease YjgP/YjgQ family protein  25.44 
 
 
355 aa  48.1  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.326563 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2122  permease YjgP/YjgQ family protein  25 
 
 
393 aa  47.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0538  permease YjgP/YjgQ  26.35 
 
 
392 aa  47.8  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.914546  decreased coverage  0.0076294 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2601  permease YjgP/YjgQ family protein  20.26 
 
 
402 aa  47.8  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2169  permease YjgP/YjgQ family protein  25 
 
 
393 aa  47.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.330163  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1490  permease YjgP/YjgQ family protein  24.14 
 
 
371 aa  47.4  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.857253  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2340  permease YjgP/YjgQ  23.72 
 
 
389 aa  47.4  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.545488  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1402  permease YjgP/YjgQ family protein  25.76 
 
 
370 aa  47  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.999053 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15721  putative permease  25.94 
 
 
386 aa  46.6  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.868052  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3933  permease YjgP/YjgQ family protein  23.95 
 
 
389 aa  46.6  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0880082 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0560  permease YjgP/YjgQ family protein  25.58 
 
 
360 aa  46.2  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0147721  hitchhiker  3.29056e-06 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1432  permease YjgP/YjgQ family protein  26.96 
 
 
359 aa  46.2  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15831  putative permease  37.7 
 
 
401 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0944857  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2101  hypothetical protein  25.6 
 
 
356 aa  45.8  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2033  permease YjgP/YjgQ family protein  35.48 
 
 
360 aa  45.8  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.971288 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2589  permease YjgP/YjgQ family protein  20.11 
 
 
379 aa  45.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00221006  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1043  hypothetical protein  21.21 
 
 
377 aa  45.4  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0296445  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1677  permease YjgP/YjgQ  24.26 
 
 
390 aa  45.8  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3650  permease YjgP/YjgQ family protein  23.95 
 
 
389 aa  45.4  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2628  permease YjgP/YjgQ family protein  26.67 
 
 
386 aa  45.1  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0687  hypothetical protein  20.24 
 
 
402 aa  45.1  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.658083  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3943  permease YjgP/YjgQ family protein  23.95 
 
 
389 aa  45.4  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0679  hypothetical protein  20.24 
 
 
402 aa  45.4  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2956  permease YjgP/YjgQ family protein  30 
 
 
358 aa  44.7  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.199366  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1512  permease YjgP/YjgQ family protein  25 
 
 
374 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2508  permease YjgP/YjgQ family protein  26.32 
 
 
389 aa  44.3  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0679  permease YjgP/YjgQ family protein  31.88 
 
 
350 aa  44.3  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0397  permease YjgP/YjgQ family protein  27.19 
 
 
354 aa  43.9  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0180892  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1352  permease YjgP/YjgQ family protein  25.56 
 
 
1153 aa  43.5  0.009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.929762  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2313  permease YjgP/YjgQ  20.98 
 
 
388 aa  43.5  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2512  permease YjgP/YjgQ family protein  25.66 
 
 
394 aa  43.5  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1425  permease YjgP/YjgQ family protein  20.36 
 
 
380 aa  43.5  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.308886  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0517  permease  27.27 
 
 
367 aa  43.5  0.01  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0300348  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>