More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_0005 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010830  Aasi_0005  TrmA family RNA methyltransferase  100 
 
 
468 aa  974  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3623  RNA methyltransferase, TrmA family  52.92 
 
 
481 aa  522  1e-147  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2518  RNA methyltransferase  50.22 
 
 
479 aa  507  1e-142  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1077  RNA methyltransferase, TrmA family  50.77 
 
 
465 aa  503  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  9.01811e-06  normal  0.660905 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1688  RNA methyltransferase, TrmA family  50.33 
 
 
476 aa  488  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.618499 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08576  putative RNA methyltransferase  49.04 
 
 
470 aa  487  1e-136  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.695835  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2157  RNA methyltransferase, TrmA family  49.25 
 
 
471 aa  484  1e-135  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.615925  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2500  RNA methyltransferase  48.32 
 
 
470 aa  483  1e-135  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1095  RNA methyltransferase  49.35 
 
 
465 aa  465  1e-130  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.31205 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0862  RNA methyltransferase, TrmA family  44.54 
 
 
472 aa  415  1e-115  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2557  RNA methyltransferase, TrmA family  41.76 
 
 
466 aa  385  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2028  23S rRNA methyltransferase/RumA  41.44 
 
 
477 aa  355  7e-97  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2909  RNA methyltransferase, TrmA family  40.86 
 
 
488 aa  353  4e-96  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.501194  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1585  RNA methyltransferase  39.79 
 
 
471 aa  347  2e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.953972  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2126  23S rRNA methyltransferase  38.51 
 
 
476 aa  335  1e-90  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.965938  normal  0.654469 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2518  RNA methyltransferase, TrmA family  38.51 
 
 
482 aa  332  8e-90  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.391256  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2737  RNA methyltransferase  38.94 
 
 
476 aa  331  2e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2332  RNA methyltransferase, TrmA family  38.95 
 
 
478 aa  330  4e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.45026 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2558  RNA methyltransferase, TrmA family  39.09 
 
 
480 aa  328  1e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0289  RNA methyltransferase  38.29 
 
 
488 aa  325  7e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.198099  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2695  RNA methyltransferase  35.68 
 
 
457 aa  305  1e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0782  RNA methyltransferase, TrmA family  35.51 
 
 
456 aa  294  2e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.14607  normal  0.115427 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2060  RNA methyltransferase  34.05 
 
 
468 aa  290  5e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.23059 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1225  RNA methyltransferase, TrmA family  35.54 
 
 
457 aa  290  5e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2868  RNA methyltransferase, TrmA family  34.99 
 
 
460 aa  288  1e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00253017  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1383  RNA methyltransferase, TrmA family  36.19 
 
 
479 aa  287  3e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1751  RNA methyltransferase  34.69 
 
 
453 aa  287  3e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216476  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0311  RNA methyltransferase  33.69 
 
 
458 aa  277  3e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3654  TrmA family RNA methyltransferase  34.61 
 
 
455 aa  275  1e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.412422  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0313  RNA methyltransferase  33.83 
 
 
458 aa  274  2e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0159  RNA methyltransferase  34.27 
 
 
468 aa  274  3e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0407  RNA methyltransferase, TrmA family  33.26 
 
 
458 aa  273  6e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0391  RNA methyltransferase, TrmA family  36.07 
 
 
457 aa  272  7e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3634  23S rRNA methyltransferase/RumA  35.67 
 
 
460 aa  272  9e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.226718 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0381  RNA methyltransferase, TrmA family  33.05 
 
 
454 aa  271  1e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.432112  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3305  RNA methyltransferase, TrmA family  34.39 
 
 
460 aa  271  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0305  RNA methyltransferase  33.05 
 
 
458 aa  270  3e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0517475  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0301  RNA methyltransferase  33.05 
 
 
458 aa  271  3e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4938  RNA methyltransferase, TrmA family  33.05 
 
 
454 aa  270  3e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0464028  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0365  RNA methyltransferase, TrmA family  33.05 
 
 
458 aa  270  5e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0363  RNA methyltransferase  32.48 
 
 
460 aa  270  6e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03000  RNA methyltransferase, TrmA family  34.38 
 
 
453 aa  268  2e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0318  RNA methyltransferase  32.83 
 
 
458 aa  266  8e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.875741  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0333  RNA methyltransferase  32.83 
 
 
458 aa  266  8e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1235  RNA methyltransferase, TrmA family  33.94 
 
 
462 aa  263  7e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0337  RNA methyltransferase, TrmA family  32.53 
 
 
459 aa  262  1e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.95395  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1197  RNA methyltransferase  33.12 
 
 
454 aa  257  2e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  1.42692e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0406  RNA methyltransferase  31.8 
 
 
459 aa  254  2e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0535  RNA methyltransferase  33.77 
 
 
465 aa  254  3e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0241  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  32.76 
 
 
455 aa  252  9e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.468571  normal  0.547918 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0542  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  31.8 
 
 
459 aa  251  1e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  3.51254e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0472  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  31.8 
 
 
459 aa  251  1e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0404  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase  31.8 
 
 
459 aa  251  1e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.039244  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0400  RNA methyltransferase  31.8 
 
 
459 aa  251  1e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.955809  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4122  RNA methyltransferase, TrmA family  32.64 
 
 
461 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.840048 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0491  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  31.8 
 
 
459 aa  251  1e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.116806  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4083  RNA methyltransferase, TrmA family  32.64 
 
 
461 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0542  RNA methyltransferase  31.8 
 
 
459 aa  251  2e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.016081  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1295  RNA methyltransferase, TrmA family  34.71 
 
 
436 aa  250  4e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0426  RNA methyltransferase  31.72 
 
 
459 aa  249  6e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0414  RNA methyltransferase  31.72 
 
 
459 aa  249  6e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.340399  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1216  RNA methyltransferase  33.05 
 
 
452 aa  248  1e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0348  RNA methyltransferase  32.28 
 
 
455 aa  248  1e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.359971  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4832  RNA methyltransferase, TrmA family  31.72 
 
 
459 aa  248  2e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  3.74128e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0357  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  31.92 
 
 
455 aa  248  2e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1355  RNA methyltransferase  32.7 
 
 
463 aa  245  1e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.547923  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0428  RNA methyltransferase, TrmA family  32.02 
 
 
460 aa  244  2e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39526  predicted protein  31.06 
 
 
536 aa  243  4e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.612078  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0703  RNA methyltransferase, TrmA family  32.73 
 
 
448 aa  243  4e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1951  RNA methyltransferase  30.63 
 
 
453 aa  241  3e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.602794  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0412  RNA methyltransferase  30.62 
 
 
458 aa  241  3e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1985  RNA methyltransferase  30.63 
 
 
453 aa  241  3e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1435  RNA methyltransferase  30.67 
 
 
456 aa  239  1e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4802  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  30.74 
 
 
485 aa  239  1e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.810738  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1308  RNA methyltransferase, TrmA family  31.94 
 
 
467 aa  237  3e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2258  RNA methyltransferase, TrmA family  33.56 
 
 
456 aa  233  4e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0702589  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2801  RNA methyltransferase  32.68 
 
 
470 aa  233  7e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2261  RNA methyltransferase  31.15 
 
 
457 aa  231  3e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  5.92232e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0455  RNA methyltransferase, TrmA family  33.47 
 
 
451 aa  229  9e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0994  RNA methyltransferase, TrmA family  33.08 
 
 
457 aa  226  5e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0963  RNA methyltransferase, TrmA family  30.17 
 
 
457 aa  222  1e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.128465  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2082  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  34.45 
 
 
452 aa  222  1e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2370  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  34.45 
 
 
451 aa  222  1e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2893  RNA methyltransferase, TrmA family  32.13 
 
 
572 aa  221  2e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1649  RNA methyltransferase  29.87 
 
 
439 aa  221  3e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0467  RNA methyltransferase, TrmA family  30.65 
 
 
454 aa  220  4e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2704  RNA methyltransferase, TrmA family  30.06 
 
 
397 aa  219  6e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  3.80281e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0702  tRNA methyltransferase, TrmA family  29.85 
 
 
453 aa  219  6e-56  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.307327  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1452  RNA methyltransferase  32.7 
 
 
495 aa  218  1e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2369  RNA methyltransferase  31.37 
 
 
489 aa  218  3e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.13212e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1912  RNA methyltransferase  30.96 
 
 
473 aa  217  4e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  1.82205e-10  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1332  RNA methyltransferase, TrmA family  32.43 
 
 
447 aa  216  8e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.10273e-07 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1722  RNA methyltransferase  29.65 
 
 
439 aa  216  1e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2249  RNA methyltransferase, TrmA family  32.54 
 
 
458 aa  214  3e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.79134  hitchhiker  0.00749966 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1971  23S rRNA methyltransferase/RumA  30.84 
 
 
493 aa  212  1e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.209828  normal  0.0836094 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0406  RNA methyltransferase  34.47 
 
 
387 aa  210  3e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.59395  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0340  RNA methyltransferase  30.96 
 
 
446 aa  210  4e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0121257  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1818  RNA methyltransferase  29.35 
 
 
446 aa  209  9e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1583  RNA methyltransferase, TrmA family  33.48 
 
 
446 aa  207  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  7.30131e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0643  RNA methyltransferase, TrmA family  31.76 
 
 
466 aa  206  6e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>