86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_R0079 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_R0079  tRNA-Gln  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  91.18 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  94.55 
 
 		 72 bp  77.8  0.0000000000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0001  tRNA-Gln  89.71 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.275531 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0022  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.598023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0022  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.827155  normal  0.0599368 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0021  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0591367 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0069  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.476746  normal  0.206288 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0023  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0444305  normal  0.71139 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4327  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0074  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.326244  normal  0.181678 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0064  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6012  tRNA-Gln  88.24 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0043  tRNA-Gln  88.24 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.394082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0035  tRNA-Gln  88.24 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.446482  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0011  tRNA-Gln  88.24 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.305007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0515  tRNA-Gln  97.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0008  tRNA-Gln  97.14 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.865665  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0017  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000220842  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t06  tRNA-Gln  97.14 
 
 		 72 bp  61.9  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0008  tRNA-Gln  97.14 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.970868  normal  0.737558 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0007  tRNA-Gln  97.14 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.791549  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0002  tRNA-Gln  97.06 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0019  tRNA-Gln  87.88 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.349932  normal  0.647835 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0077  tRNA-Gln  100 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.273765 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0047  tRNA-Gln  87.88 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.907945  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0014  tRNA-Gln  87.88 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.349887  normal  0.140973 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4346  tRNA-Gln  96.97 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.850854  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0041  tRNA-Gln  96.97 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4559  tRNA-Gln  88.68 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0029  tRNA-Gln  96.97 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0419  tRNA-Gln  92.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0333429  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1847  tRNA-Gln  97.3 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1924  tRNA-Gln  96.88 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00590264  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  100 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0667259  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0034  tRNA-Gln  100 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253342  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0049  tRNA-Gln  86.76 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.296013  normal  0.0255901 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0236  tRNA-Gln  96.88 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0012758  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_896  tRNA-Gln  100 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000031288  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0070  tRNA-Gln  85.33 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000111082  normal  0.043537 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0053  tRNA-Gln  94.29 
 
 		 72 bp  54  0.000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000068806  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0016  tRNA-Gln  94.29 
 
 		 72 bp  54  0.000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000363551  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0168  tRNA-Gln  89.09 
 
 		 72 bp  54  0.000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0072  tRNA-Gln  85.33 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000124926  normal  0.0423905 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0074  tRNA-Gln  85.33 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000739317  normal  0.0440793 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0010  tRNA-Gln  85.07 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.277758  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0092  tRNA-Gln  87.27 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.603959  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1545  tRNA-Gln  94.12 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  3.87406e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0003  tRNA-Gln  96.67 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R24  tRNA-Gln  94.12 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0002  tRNA-Gln  96.67 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0427348  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1538  tRNA-Gln  94.12 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0018  tRNA-Gln  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0829  tRNA-Gln  90.24 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00000799298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0011  tRNA-Gln  93.94 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0043  tRNA-Gln  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.613613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0024  tRNA-Gln  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.578879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0043  tRNA-Gln  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0018  tRNA-Gln  96.55 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000387356  hitchhiker  0.0000000187085 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0062  tRNA-Gln  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.866763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0009  tRNA-Gln  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0012  tRNA-Gln  96.55 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0046  tRNA-Gln  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.450062 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0037  tRNA-Cys  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0040  tRNA-Gln  85.53 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000247527  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0008  tRNA-Gln  93.75 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.112331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0008  tRNA-Gln  93.75 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.629298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAGlnVIMSS1309278  tRNA-Gln  96.43 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAGlnVIMSS1309367  tRNA-Gln  96.43 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0012  tRNA-Gln  96.43 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12185  normal  0.483393 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0012  tRNA-Gln  85.29 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.376695  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0033  tRNA-Gln  96.43 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0022  tRNA-Gln  93.75 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.310652  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0052  tRNA-Gln  91.43 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.138681  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2436  tRNA-Tyr  100 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2438  tRNA-Tyr  100 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2441  tRNA-Tyr  100 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2146  tRNA-Tyr  100 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2148  tRNA-Tyr  100 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2151  tRNA-Tyr  100 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0048  tRNA-Gln  91.43 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.509197 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0032  tRNA-Gln  87.27 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00000308987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0036  tRNA-Gln  84.85 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0017  tRNA-Gln  93.33 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0205795  normal  0.59199 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0053  tRNA-Gln  90.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.203875  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0069  tRNA-Gln  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>