More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_3004 on replicon NC_013206
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013206  Aaci_3004  DNA repair protein RadC  100 
 
 		 147 aa  290  3e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00190795  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3111  DNA repair protein RadC  53.9 
 
 		 169 aa  152  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000111017  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1825  DNA repair protein RadC  59.2 
 
 		 233 aa  144  5e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2549  DNA repair protein RadC  53.23 
 
 		 227 aa  137  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3340  DNA repair protein RadC  52.14 
 
 		 233 aa  134  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000661948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0536  DNA repair protein RadC  56.91 
 
 		 229 aa  134  3.0000000000000003e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.604905 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2262  DNA repair proteins  50 
 
 		 206 aa  132  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.195306  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0983  DNA repair protein RadC  50.81 
 
 		 231 aa  131  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4572  DNA repair protein RadC  52.34 
 
 		 225 aa  131  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0345161  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4545  DNA repair protein RadC  52.34 
 
 		 225 aa  130  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4351  DNA repair protein RadC  52.34 
 
 		 225 aa  130  6.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.579867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4187  DNA repair protein RadC  52.34 
 
 		 225 aa  130  6.999999999999999e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4685  DNA repair protein RadC  52.34 
 
 		 225 aa  130  6.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.92537  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0662  DNA repair protein RadC  51.56 
 
 		 225 aa  129  9e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1412  DNA repair protein RadC  54.47 
 
 		 227 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4299  DNA repair protein RadC  51.56 
 
 		 225 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4198  DNA repair protein RadC  52.34 
 
 		 225 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000602972  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4587  DNA repair protein RadC  52.34 
 
 		 225 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.46911  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1467  DNA repair protein RadC  52.03 
 
 		 230 aa  127  4.0000000000000003e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4352  DNA repair protein RadC  52.42 
 
 		 227 aa  127  5.0000000000000004e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000113857  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2550  DNA repair protein RadC  50 
 
 		 226 aa  125  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.727412  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0899  DNA repair protein RadC  52.89 
 
 		 226 aa  125  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2135  DNA repair protein RadC  52.85 
 
 		 236 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000438114  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2303  DNA repair protein RadC  49.59 
 
 		 229 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.432419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0037  DNA repair protein RadC  51.64 
 
 		 233 aa  124  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1530  DNA repair protein RadC  48.98 
 
 		 227 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0606843  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1642  DNA repair protein RadC  50.39 
 
 		 235 aa  124  5e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000389911  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0382  DNA repair protein RadC  51.67 
 
 		 229 aa  122  1e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14250  DNA repair protein RadC  50.81 
 
 		 228 aa  122  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326992  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0244  DNA repair protein  47.92 
 
 		 151 aa  121  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.483345  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0767  DNA repair protein RadC  51.22 
 
 		 233 aa  121  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488652 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_511  DNA repair protein RadC  45.32 
 
 		 228 aa  121  4e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000324187  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0216  DNA repair protein RadC  45.71 
 
 		 163 aa  119  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2168  DNA repair protein RadC  45 
 
 		 163 aa  118  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00702134  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2564  DNA repair protein RadC  49.57 
 
 		 229 aa  117  3.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0275  DNA repair protein RadC  54.81 
 
 		 163 aa  117  7.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00125645  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2374  DNA repair protein RadC  43.88 
 
 		 165 aa  116  9e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3737  DNA repair protein RadC  43.57 
 
 		 168 aa  116  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0572  RadC family DNA repair protein  44.62 
 
 		 222 aa  115  3e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.611512  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1463  DNA repair protein RadC  53.61 
 
 		 167 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.794646 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2277  DNA repair protein RadC  48.18 
 
 		 166 aa  114  5e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1630  DNA repair protein RadC  45.67 
 
 		 234 aa  114  6e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1319  DNA repair protein RadC  46.49 
 
 		 228 aa  113  6.9999999999999995e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000567698  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0386  DNA repair protein RadC  54.81 
 
 		 229 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0777  DNA repair protein RadC  48.33 
 
 		 229 aa  112  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0546  DNA repair protein RadC  45.38 
 
 		 228 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3582  DNA repair protein RadC  53.27 
 
 		 229 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0523  DNA repair protein RadC  56.84 
 
 		 230 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0786  DNA repair protein RadC  48.18 
 
 		 166 aa  111  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2111  DNA repair protein RadC  48.08 
 
 		 227 aa  111  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1541  DNA repair protein RadC  46.46 
 
 		 232 aa  110  6e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000897994  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3868  DNA repair protein RadC  53.06 
 
 		 231 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.956659 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2399  DNA repair protein RadC  47.12 
 
 		 227 aa  109  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3784  DNA repair protein RadC  53.06 
 
 		 231 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1307  DNA repair protein RadC  45.9 
 
 		 231 aa  107  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00169173  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0514  DNA repair protein RadC  44.44 
 
 		 241 aa  107  5e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.120777  hitchhiker  0.000000000242554 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4138  DNA repair protein RadC  50 
 
 		 228 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.592557  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0803  DNA repair protein, RadC-like  49.55 
 
 		 166 aa  105  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1885  DNA repair protein RadC  50.96 
 
 		 166 aa  105  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2739  DNA repair protein RadC  50 
 
 		 225 aa  105  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1619  DNA repair protein RadC  41.13 
 
 		 166 aa  105  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2479  DNA repair protein RadC  41.96 
 
 		 245 aa  104  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0065  DNA repair protein RadC  50 
 
 		 227 aa  104  4e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02919  DNA repair protein RadC  52.43 
 
 		 225 aa  103  6e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2505  RadC domain-containing protein  45.54 
 
 		 105 aa  103  8e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0044  DNA repair protein RadC  45.54 
 
 		 105 aa  103  8e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0044  DNA repair protein RadC  45.54 
 
 		 105 aa  103  8e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3561  DNA repair protein RadC  36.17 
 
 		 147 aa  102  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0081  DNA repair protein RadC  45.53 
 
 		 220 aa  101  3e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1220  DNA repair protein RadC  48.96 
 
 		 215 aa  101  4e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1235  DNA repair protein RadC  48.96 
 
 		 222 aa  101  4e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1818  DNA repair protein RadC  42.03 
 
 		 222 aa  100  5e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.852458  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0831  DNA repair protein RadC  37.41 
 
 		 223 aa  99.4  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.950681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0061  DNA repair protein RadC  51.96 
 
 		 223 aa  99.8  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001836  DNA repair protein RadC  47 
 
 		 158 aa  99.8  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0302  DNA repair protein RadC  43.61 
 
 		 225 aa  99.4  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.473834 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1257  DNA repair protein RadC  41.67 
 
 		 157 aa  98.2  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.502332 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0675  DNA repair protein RadC  43.18 
 
 		 253 aa  97.4  5e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.461756  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3048  DNA repair protein RadC  44.95 
 
 		 221 aa  97.4  6e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000891178  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1383  putative DNA repair protein RadC  43.81 
 
 		 158 aa  96.3  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1455  RadC family DNA repair protein  44.35 
 
 		 157 aa  95.9  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0735  DNA repair protein RadC  38.13 
 
 		 223 aa  96.3  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2376  DNA repair protein RadC  51.85 
 
 		 232 aa  96.7  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000665213  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0598  DNA repair protein RadC  40.48 
 
 		 223 aa  96.3  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2888  DNA repair protein RadC  40.35 
 
 		 157 aa  96.3  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1789  DNA repair protein  37.1 
 
 		 224 aa  96.3  1e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.582251  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0159  DNA repair protein RadC  41.67 
 
 		 221 aa  95.9  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.130887  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0935  DNA repair protein RadC  38.76 
 
 		 222 aa  95.1  3e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.266168  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0973  DNA repair protein RadC  39.29 
 
 		 225 aa  94.4  5e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0497584  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1778  DNA repair protein RadC  42.42 
 
 		 243 aa  94.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.69629 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1513  DNA repair protein RadC  37.78 
 
 		 222 aa  93.2  9e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1465  DNA repair protein RadC  39.47 
 
 		 222 aa  93.2  9e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1383  DNA repair protein RadC  39.47 
 
 		 157 aa  92.8  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2664  DNA repair protein RadC  43.7 
 
 		 224 aa  93.2  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.649783  hitchhiker  0.0000127675 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3960  DNA repair protein RadC  41.03 
 
 		 221 aa  92  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0193359  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0176  DNA repair protein RadC  41.58 
 
 		 225 aa  92  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.260187  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0100  DNA repair protein RadC  42.86 
 
 		 223 aa  92  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.234069  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1362  DNA repair protein RadC  37.19 
 
 		 228 aa  92  3e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1761  DNA repair protein RadC  40.48 
 
 		 223 aa  92  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3564  DNA repair protein RadC  40.65 
 
 		 224 aa  90.9  5e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.469153  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>