More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2987 on replicon NC_013206
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013206  Aaci_2987  phosphoribosylglycinamide synthetase  100 
 
 
410 aa  837    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000000875543  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0292  phosphoribosylglycinamide synthetase, ATP-grasp  43.86 
 
 
407 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0170  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  43.86 
 
 
407 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0573  phosphoribosylglycinamide synthetase  31.36 
 
 
420 aa  142  7e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23534  normal  0.22349 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4648  protein of unknown function DUF201  31.38 
 
 
404 aa  134  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.896666  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2428  protein of unknown function DUF201  26.4 
 
 
402 aa  132  1.0000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.281403  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3192  argininosuccinate lyase  30.1 
 
 
924 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.655648  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1396  argininosuccinate lyase  29.95 
 
 
926 aa  127  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2560  argininosuccinate lyase  29.64 
 
 
904 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2507  argininosuccinate lyase  29.23 
 
 
912 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2646  argininosuccinate lyase  29.38 
 
 
904 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4500  Cysteine synthase  29.91 
 
 
756 aa  124  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.632569  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2122  argininosuccinate lyase  30.1 
 
 
894 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1620  argininosuccinate lyase  29.95 
 
 
896 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0755  protein of unknown function DUF201  28.53 
 
 
398 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33390  biotin carboxylase  27.72 
 
 
428 aa  112  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1971  argininosuccinate lyase  28.73 
 
 
891 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3626  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  28.78 
 
 
432 aa  108  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7725  hypothetical protein  29.01 
 
 
411 aa  108  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10668  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2438  hypothetical protein  29.44 
 
 
410 aa  105  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.658373 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0754  protein of unknown function DUF201  25.56 
 
 
409 aa  105  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2663  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  28.84 
 
 
413 aa  103  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1270  protein of unknown function DUF201  28.81 
 
 
399 aa  99.8  7e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.964812  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2737  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  22.92 
 
 
723 aa  99.8  9e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4068  hypothetical protein  25.98 
 
 
413 aa  98.2  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0619  phosphoribosylglycinamide synthetase  24.76 
 
 
410 aa  97.4  4e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.241949  hitchhiker  0.00233057 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3759  protein of unknown function DUF201  28.82 
 
 
425 aa  97.4  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2020  phosphoribosylglycinamide synthetase  32.69 
 
 
407 aa  96.3  9e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2209  CarB family protein  28.22 
 
 
543 aa  95.9  1e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.304362  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4069  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  29.66 
 
 
389 aa  93.6  6e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2022  argininosuccinate lyase  26.97 
 
 
900 aa  92  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10658  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37420  biotin carboxylase  22.59 
 
 
405 aa  92.4  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.442231 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6153  protein of unknown function DUF201  27.35 
 
 
397 aa  91.7  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.0716856 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0344  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.7 
 
 
424 aa  90.9  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2158  argininosuccinate lyase  26.67 
 
 
914 aa  89  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2148  hypothetical protein  29.88 
 
 
414 aa  89  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.149546 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2002  argininosuccinate lyase  26.67 
 
 
900 aa  89  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.848902  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03057  hypothetical protein  28.8 
 
 
449 aa  87  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.450613  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0194  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain-containing protein ATP-grasp  28.62 
 
 
419 aa  86.3  8e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal  0.160479 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2668  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.53 
 
 
415 aa  86.3  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3093  hypothetical protein  29.89 
 
 
440 aa  84.7  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2144  phosphoribosylglycinamide synthetase  28.86 
 
 
416 aa  84.7  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3064  hypothetical protein  26.18 
 
 
441 aa  83.6  0.000000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000514586 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0449  putative glycolate oxidase  24.21 
 
 
404 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1514  hypothetical protein  29.84 
 
 
412 aa  82.8  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1388  hypothetical protein  24.5 
 
 
395 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6149  hypothetical protein  27.07 
 
 
441 aa  81.3  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.669475 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0240  hypothetical protein  24.42 
 
 
410 aa  80.9  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1164  protein of unknown function DUF201  25.82 
 
 
437 aa  81.3  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1929  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  26.74 
 
 
411 aa  80.1  0.00000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3660  hypothetical protein  30.95 
 
 
411 aa  79.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.853995  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0418  hypothetical protein  26.62 
 
 
411 aa  79  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3265  hypothetical protein  22.7 
 
 
412 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1268  phosphoribosylglycinamide synthetase  22.52 
 
 
400 aa  78.2  0.0000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.584392  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3242  hypothetical protein  24.15 
 
 
432 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6302  hypothetical protein  29.86 
 
 
401 aa  77.8  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0344575  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1119  biotin carboxylase  23.36 
 
 
411 aa  77  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2959  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.16 
 
 
405 aa  77  0.0000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2251  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.56 
 
 
418 aa  75.9  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000511987 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0240  hypothetical protein  23.84 
 
 
410 aa  74.7  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1401  protein of unknown function DUF201  21.36 
 
 
409 aa  73.2  0.000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0730  hypothetical protein  25.9 
 
 
436 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2162  hypothetical protein  26.02 
 
 
414 aa  71.6  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8363  putative siderophore biosynthesis protein  26.13 
 
 
401 aa  71.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2135  phosphoribosylglycinamide synthetase  30.67 
 
 
412 aa  72  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165665  normal  0.504192 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37283  predicted protein  25.48 
 
 
1033 aa  70.9  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4142  hypothetical protein  28.11 
 
 
414 aa  69.3  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.16964  normal  0.023954 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0072  hypothetical protein  28.11 
 
 
414 aa  69.3  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3469  hypothetical protein  26.64 
 
 
429 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4090  hypothetical protein  27.71 
 
 
414 aa  66.6  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.572464  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1498  biotin carboxylase-like  25.9 
 
 
428 aa  66.2  0.0000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7724  putative biotin carboxylase  24.59 
 
 
430 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.211642  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1724  protein of unknown function DUF201  24.06 
 
 
401 aa  66.2  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5090  hypothetical protein  25.27 
 
 
453 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5770  hypothetical protein  25.27 
 
 
453 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0282385 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2986  carbamoyl-phosphate synthase large chain  24.19 
 
 
431 aa  64.3  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.556183  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2484  carbamoyl phosphate synthase-like protein  28.14 
 
 
354 aa  63.9  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.834927  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0416  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.87 
 
 
726 aa  63.5  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0147603  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6388  phosphoribosylglycinamide synthetase  28.25 
 
 
422 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.357309  normal  0.160447 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4524  Biotin carboxylase-like protein  24.49 
 
 
403 aa  63.2  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.799309  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2969  hypothetical protein  24.14 
 
 
402 aa  62.4  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2432  hypothetical protein  26.92 
 
 
430 aa  62.4  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0899  hypothetical protein  24.61 
 
 
406 aa  62  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0732  hypothetical protein  24.61 
 
 
406 aa  62  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0433  hypothetical protein  24.7 
 
 
426 aa  61.6  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0718  hypothetical protein  24.61 
 
 
406 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.555879  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0200  hypothetical protein  22.96 
 
 
405 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.214933  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0996  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.11 
 
 
541 aa  61.2  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000037072 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4786  hypothetical protein  24.3 
 
 
398 aa  61.2  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0319  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.15 
 
 
1084 aa  61.2  0.00000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3245  hypothetical protein  23.66 
 
 
419 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.837509  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5515  phosphoribosylglycinamide synthetase  29.5 
 
 
422 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.330375  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5879  phosphoribosylglycinamide synthetase  29.5 
 
 
422 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.521142  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0875  hypothetical protein  23.53 
 
 
420 aa  60.8  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.728931 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2595  putative carbamoyl-phosphate-synthetase  23.73 
 
 
398 aa  60.1  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.605395  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1202  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  26.67 
 
 
1089 aa  59.3  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2127  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.65 
 
 
1086 aa  59.3  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0870  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.2 
 
 
1087 aa  58.9  0.0000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6975  phosphoribosylglycinamide synthetase  23.17 
 
 
398 aa  59.7  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.646892  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0672  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  20.94 
 
 
1107 aa  58.9  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.715776 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>