More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2967 on replicon NC_013206
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013206  Aaci_2967  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 
451 aa  925    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.335517  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2331  lytic transglycosylase, catalytic  40.88 
 
 
242 aa  77.8  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.194183  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3191  lytic transglycosylase catalytic  38.75 
 
 
254 aa  77.8  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.1009  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3687  lytic transglycosylase, catalytic  39.86 
 
 
300 aa  74.3  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2657  lytic transglycosylase, catalytic  38.52 
 
 
484 aa  74.3  0.000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.142351  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1508  lytic transglycosylase, catalytic  40.29 
 
 
254 aa  73.6  0.000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3554  lytic transglycosylase, catalytic  39.13 
 
 
241 aa  72  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.930583  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0754  lytic transglycosylase catalytic  38.26 
 
 
253 aa  72  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3847  lytic transglycosylase, catalytic  40.15 
 
 
240 aa  71.2  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.081015  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2492  lytic transglycosylase, catalytic  37.04 
 
 
242 aa  70.9  0.00000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.931024 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0517  lytic transglycosylase, catalytic  37.96 
 
 
254 aa  68.9  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0493773  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0850  lytic transglycosylase, catalytic  32.95 
 
 
336 aa  68.6  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0266609 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3185  lytic transglycosylase, catalytic  37.23 
 
 
268 aa  67.4  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2124  Lytic transglycosylase catalytic  37.78 
 
 
460 aa  67  0.0000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3009  lytic transglycosylase catalytic  37.09 
 
 
238 aa  66.6  0.0000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1007  transglycosylase, putative  42.34 
 
 
209 aa  66.2  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.232372  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1603  Lytic transglycosylase catalytic  41.27 
 
 
217 aa  66.2  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0611  Lytic transglycosylase catalytic  36.2 
 
 
480 aa  66.2  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1028  Lytic transglycosylase catalytic  35.48 
 
 
233 aa  65.5  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.100392  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2791  lytic transglycosylase catalytic  31.43 
 
 
197 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504732  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3350  putative lytic transglycosylase  35.04 
 
 
276 aa  65.1  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.124334  normal  0.958591 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0704  lytic transglycosylase catalytic  39.39 
 
 
251 aa  65.5  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  36 
 
 
206 aa  65.1  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3565  lytic transglycosylase, catalytic  34.75 
 
 
209 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1484  soluble lytic murein transglycosylase, putative  40 
 
 
747 aa  65.1  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.180895  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  32.7 
 
 
260 aa  65.1  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3082  Lytic transglycosylase catalytic  38.41 
 
 
257 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3631  Lytic transglycosylase catalytic  34.04 
 
 
209 aa  64.3  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3705  Lytic transglycosylase catalytic  34.04 
 
 
209 aa  64.7  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3375  lytic transglycosylase, catalytic  35.29 
 
 
272 aa  64.3  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.877408  normal  0.240376 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0633  Lytic transglycosylase catalytic  37.59 
 
 
439 aa  64.3  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0452827 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0348  lytic transglycosylase, catalytic  35.04 
 
 
204 aa  64.3  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2003  Lytic transglycosylase catalytic  41.44 
 
 
217 aa  63.9  0.000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3823  lytic transglycosylase catalytic  37.23 
 
 
310 aa  63.5  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.78856  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2873  lytic transglycosylase catalytic  39.39 
 
 
258 aa  63.2  0.000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0739843 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1491  putative lytic transglycosylase  35.23 
 
 
338 aa  62.4  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.937536  normal  0.466263 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3537  lytic transglycosylase catalytic  34.53 
 
 
259 aa  62.8  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.401934  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1198  lytic transglycosylase catalytic  34.53 
 
 
259 aa  62.8  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0358  Lytic transglycosylase catalytic  36.04 
 
 
247 aa  62.4  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.77747e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0360  lytic transglycosylase, catalytic  36.81 
 
 
233 aa  62.8  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0137  lytic transglycosylase, catalytic  34.31 
 
 
231 aa  62.8  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.158623  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  35.51 
 
 
260 aa  62  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1974  lytic transglycosylase, catalytic  32.86 
 
 
203 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677118  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4010  lytic transglycosylase catalytic  36.5 
 
 
265 aa  61.6  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.132288 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1341  lytic transglycosylase, catalytic  27.83 
 
 
281 aa  61.6  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0557803  normal  0.620551 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  34.58 
 
 
196 aa  61.2  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3535  Lytic transglycosylase catalytic  33.09 
 
 
1160 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1575  lytic transglycosylase, catalytic  50 
 
 
660 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.642421 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2620  lytic transglycosylase, catalytic  35 
 
 
262 aa  60.8  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2804  Lytic transglycosylase catalytic  35.29 
 
 
238 aa  61.2  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3422  lytic transglycosylase  31.43 
 
 
197 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0830  Lytic transglycosylase catalytic  33.82 
 
 
296 aa  60.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0921738  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0901  Lytic transglycosylase catalytic  33.82 
 
 
296 aa  60.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.408914  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  39.29 
 
 
291 aa  60.5  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  35.51 
 
 
258 aa  60.1  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2340  lytic transglycosylase, catalytic  31.43 
 
 
218 aa  60.1  0.00000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0276  soluble lytic transglycosylase  35.71 
 
 
681 aa  59.7  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1888  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 
195 aa  59.3  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2410  lytic transglycosylase, catalytic  29.75 
 
 
208 aa  59.7  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3607  lytic transglycosylase, catalytic  33.93 
 
 
326 aa  59.7  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4016  lytic transglycosylase, catalytic  38.17 
 
 
239 aa  58.5  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0926261  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0941  murein transglycosylase, putative  34.06 
 
 
639 aa  58.5  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6404  lytic transglycosylase catalytic  31.41 
 
 
362 aa  58.9  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0649822  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  37.5 
 
 
199 aa  58.9  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3905  lytic transglycosylase, catalytic  31.76 
 
 
301 aa  58.9  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2529  lytic transglycosylase, catalytic  42.68 
 
 
642 aa  58.5  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0586  lytic transglycosylase catalytic  38.66 
 
 
261 aa  58.9  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.893043  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3686  lytic transglycosylase catalytic  33.58 
 
 
209 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2291  putative transglycosylase protein  30.88 
 
 
198 aa  58.2  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.128594  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1059  Lytic transglycosylase catalytic  34.06 
 
 
658 aa  58.5  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.210137  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1597  soluble lytic murein transglycosylase precursor  37 
 
 
651 aa  58.2  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.116163  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1820  lytic transglycosylase catalytic  38.26 
 
 
251 aa  58.2  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3860  lytic transglycosylase, catalytic  32.43 
 
 
329 aa  58.5  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  37.96 
 
 
174 aa  58.2  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  35.26 
 
 
191 aa  58.2  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2016  lytic transglycosylase catalytic  31.52 
 
 
210 aa  57.8  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.272435  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0977  putative transglycosylase signal peptide protein  30.56 
 
 
285 aa  57.8  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.121304  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0476  lytic transglycosylase, catalytic  35.66 
 
 
256 aa  57.8  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  33.33 
 
 
204 aa  57.8  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3807  lytic transglycosylase, catalytic  35.57 
 
 
215 aa  57.8  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  37.38 
 
 
282 aa  57.8  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2905  lytic transglycosylase, catalytic  33.93 
 
 
237 aa  57.8  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.739036  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2357  lytic transglycosylase, catalytic  32.39 
 
 
260 aa  57.4  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500098  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2518  lytic transglycosylase catalytic  30 
 
 
224 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2131  soluble lytic transglycosylase  36.94 
 
 
690 aa  57.4  0.0000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 
204 aa  57.4  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2520  lytic transglycosylase, catalytic  35.82 
 
 
280 aa  57  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.22403  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2342  Lytic transglycosylase catalytic  31.11 
 
 
219 aa  57  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000870082  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2511  lytic transglycosylase, catalytic  34.75 
 
 
217 aa  57  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0924  lytic transglycosylase, catalytic  31.08 
 
 
663 aa  57  0.0000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9819  type IV system transglycosylase  32.37 
 
 
362 aa  56.6  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1300  Lytic transglycosylase catalytic  35.29 
 
 
218 aa  56.6  0.0000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0023245  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4351  lytic transglycosylase catalytic  32.68 
 
 
194 aa  56.2  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.744622  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2348  Lytic transglycosylase catalytic  37.5 
 
 
763 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0502018  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0720  hypothetical protein  35.59 
 
 
593 aa  56.6  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0700  hypothetical protein  35.59 
 
 
593 aa  56.2  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0975  Lytic transglycosylase catalytic  36.04 
 
 
261 aa  56.2  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.615186 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  34.31 
 
 
196 aa  55.8  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4693  putative lytic transglycosylase, catalytic  30.88 
 
 
215 aa  56.2  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000077507  normal  0.120796 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4176  lytic transglycosylase, catalytic  29.68 
 
 
354 aa  55.8  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500833  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>