More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2954 on replicon NC_013206
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013206  Aaci_2954  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 223 aa  455  1e-127  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000000401895  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1598  LexA repressor  43.2 
 
 		 239 aa  95.1  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313402  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1791  LexA repressor  42.4 
 
 		 239 aa  94.4  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.117655  hitchhiker  0.00108094 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3178  LexA repressor  40.71 
 
 		 237 aa  90.9  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.917089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2104  SOS-response transcriptional repressor, LexA  44.7 
 
 		 231 aa  90.1  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.788745  normal  0.0179142 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2020  LexA repressor  33.33 
 
 		 242 aa  88.6  7e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.775144 
 
 
-
 
NC_004310  BR1144  LexA repressor  39.2 
 
 		 240 aa  88.6  8e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1104  LexA repressor  39.2 
 
 		 240 aa  88.6  8e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2148  transcriptional repressor, LexA family  42.42 
 
 		 230 aa  86.7  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1701  SOS-response transcriptional repressor, LexA  42.42 
 
 		 229 aa  86.7  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1642  LexA repressor  40 
 
 		 236 aa  86.3  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.217888  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2238  SOS-response transcriptional repressor, LexA  42.42 
 
 		 228 aa  86.7  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.778697  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4496  LexA repressor  38.28 
 
 		 232 aa  86.3  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2561  LexA repressor  39.02 
 
 		 239 aa  85.9  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.936148  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7466  LexA repressor  39.37 
 
 		 240 aa  85.9  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0525959  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2045  LexA repressor  38.4 
 
 		 239 aa  84.7  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.613355  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1729  LexA repressor  37.5 
 
 		 233 aa  84.3  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3074  Repressor lexA  37.41 
 
 		 197 aa  83.6  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.459225  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2809  LexA repressor  37.8 
 
 		 234 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.33074  normal  0.312711 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2454  LexA repressor  37.01 
 
 		 237 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.212024  normal  0.397716 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2839  LexA repressor  37.8 
 
 		 235 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.485445 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6716  LexA repressor  40 
 
 		 239 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1678  LexA repressor  37.59 
 
 		 236 aa  83.6  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.29341 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1841  LexA repressor  37.5 
 
 		 233 aa  82.8  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.924658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1419  LexA repressor  40 
 
 		 237 aa  82.4  0.000000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3249  LexA repressor  35.56 
 
 		 236 aa  82  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.633502  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1353  LexA repressor  38.4 
 
 		 238 aa  80.9  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1739  LexA repressor  38.64 
 
 		 202 aa  81.6  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1803  LexA repressor  38.71 
 
 		 231 aa  80.9  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00193546  normal  0.136628 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2782  LexA repressor  40.65 
 
 		 235 aa  80.5  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0386684  hitchhiker  0.000588647 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5225  LexA repressor  39.2 
 
 		 240 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.630242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4371  LexA repressor  36 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.274374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2029  LexA repressor  37.6 
 
 		 234 aa  80.1  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0832  LexA repressor  36.8 
 
 		 227 aa  80.5  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0630209  hitchhiker  0.00461064 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1398  LexA repressor  33.81 
 
 		 232 aa  80.9  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0394498  hitchhiker  0.000716176 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4683  LexA repressor  38.4 
 
 		 240 aa  79.3  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5148  LexA repressor  38.4 
 
 		 240 aa  79.3  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.160291  normal  0.0920185 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1495  LexA repressor  35.86 
 
 		 222 aa  79  0.00000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000262911  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1207  transcriptional repressor, LexA family  37.01 
 
 		 210 aa  78.6  0.00000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000325213  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2883  LexA repressor  35.2 
 
 		 231 aa  77  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1912  putative prophage repressor  30.36 
 
 		 196 aa  77.4  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0145  LexA repressor  37.6 
 
 		 253 aa  76.6  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0813581  normal  0.028375 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1064  transcriptional regulator, XRE family  55.71 
 
 		 206 aa  76.3  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0300833  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2344  LexA repressor  37.01 
 
 		 206 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.53254  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3094  LexA repressor  36.43 
 
 		 228 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.938529  normal  0.561112 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0927  SOS-response transcriptional repressor, LexA  38.76 
 
 		 206 aa  75.9  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0151  LexA family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 214 aa  76.3  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.464426  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2142  LexA repressor  35.83 
 
 		 232 aa  75.9  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.196477  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1617  LexA repressor  32.07 
 
 		 203 aa  75.5  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1932  LexA repressor  39.2 
 
 		 207 aa  75.5  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.424325  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1874  LexA repressor  38.84 
 
 		 228 aa  75.5  0.0000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.879574  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1662  SOS-response transcriptional repressor, LexA  31.07 
 
 		 197 aa  75.1  0.0000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3779  SOS-response transcriptional repressor, LexA  38.4 
 
 		 207 aa  74.7  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1735  LexA family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 197 aa  74.3  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3317  transcriptional regulator, XRE family  28.37 
 
 		 281 aa  73.2  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000786405  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2446  transcriptional repressor, LexA family  42.98 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.575713 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0234  LexA family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3151  Repressor lexA  34.4 
 
 		 154 aa  73.2  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.662921  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3216  LexA repressor  36.59 
 
 		 224 aa  72.4  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0413158 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3750  LexA repressor  35.43 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.596492  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3799  LexA repressor  35.43 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3377  LexA repressor  35.43 
 
 		 204 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.32678  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3708  LexA repressor  35.43 
 
 		 206 aa  72  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000011007 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3727  LexA repressor  35.43 
 
 		 206 aa  72  0.000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3444  LexA repressor  35.43 
 
 		 206 aa  72  0.000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3754  LexA repressor  35.43 
 
 		 206 aa  72  0.000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1516  LexA repressor  35.43 
 
 		 223 aa  71.6  0.000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.142022 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0707  LexA repressor  36.44 
 
 		 227 aa  71.6  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.265887 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1898  LexA repressor  31.78 
 
 		 251 aa  71.6  0.000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1997  LexA repressor  36.44 
 
 		 228 aa  71.6  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1135  LexA repressor  33.08 
 
 		 241 aa  71.6  0.000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.725643  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3395  LexA repressor  35.43 
 
 		 269 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1693  SOS-response transcriptional repressor, LexA  32.21 
 
 		 215 aa  70.9  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.026271  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20950  putative prophage repressor  27.78 
 
 		 200 aa  71.2  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000578065  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0581  LexA repressor  34.96 
 
 		 210 aa  70.9  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.640194  normal  0.502915 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1008  repressor lexA  34.48 
 
 		 204 aa  71.6  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000183008  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2084  SOS-response transcriptional repressor, LexA  32.26 
 
 		 231 aa  70.9  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0507519 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1572  SOS-response transcriptional repressor, LexA  33.11 
 
 		 217 aa  71.2  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0797  transcriptional regulator, XRE family  29.73 
 
 		 206 aa  71.2  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.028007  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1232  transcriptional repressor, LexA family  32.78 
 
 		 209 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0251  transcriptional repressor LexA, putative  30.94 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00843575  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0274  transcriptional repressor LexA, putative  30.94 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0884  transcriptional repressor LexA, putative  30.94 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0403534  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0041  LexA repressor  32.61 
 
 		 201 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3479  LexA repressor  35.43 
 
 		 269 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10800  SOS regulatory protein LexA  37.69 
 
 		 230 aa  70.1  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000176447  unclonable  0.0000000017839 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4562  SOS-response transcriptional repressor, LexA  32.76 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.547089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0696  putative prophage repressor  35.04 
 
 		 157 aa  69.7  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00336277  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1814  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.48 
 
 		 228 aa  70.1  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.105168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0192  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.14 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2118  LexA repressor  34.68 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1901  SOS-response transcriptional repressor, LexA  38.71 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2490  SOS-response transcriptional repressor, LexA  28.65 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2601  LexA repressor  34.27 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.829125 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3116  LexA repressor  34.27 
 
 		 202 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.553087 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1758  transcriptional repressor, LexA family  28.09 
 
 		 201 aa  68.6  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000113097  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0893  SOS-response transcriptional repressor, LexA  36 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0793  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.11 
 
 		 198 aa  67.8  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1611  SOS-response transcriptional repressor, LexA  32.6 
 
 		 212 aa  67.8  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000000160494  unclonable  3.1983e-16 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1204  LexA repressor  35.77 
 
 		 212 aa  67.8  0.0000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000092857  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>