More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2910 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_2910  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  100 
 
 
228 aa  457  9.999999999999999e-129  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000263786  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2429  Multidrug resistance efflux pump-like protein  56.81 
 
 
214 aa  236  2e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.310054  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2447  hypothetical protein  49.3 
 
 
212 aa  210  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1834  multidrug resistance protein A  47.42 
 
 
212 aa  201  8e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00170419  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2377  hypothetical protein  42.06 
 
 
215 aa  191  8e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2423  hypothetical protein  42.06 
 
 
215 aa  191  8e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4700  hypothetical protein  44.86 
 
 
217 aa  187  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000255246  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4677  hypothetical protein  46.73 
 
 
217 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000225895  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3255  multidrug resistance protein A  48.15 
 
 
217 aa  181  6e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4684  hypothetical protein  46.26 
 
 
217 aa  181  7e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.12554e-48 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4465  hypothetical protein  46.26 
 
 
217 aa  181  7e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.147837  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4300  multidrug resistance protein A  46.26 
 
 
217 aa  181  7e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000026909  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4311  multidrug resistance protein A  46.26 
 
 
217 aa  181  7e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.276592  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0560  hypothetical protein  46.26 
 
 
217 aa  181  7e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000264688  hitchhiker  1.67598e-16 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4813  hypothetical protein  46.26 
 
 
217 aa  181  7e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0590873  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4693  hypothetical protein  46.26 
 
 
217 aa  181  7e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000853008  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1945  drug transporter, putative  40.93 
 
 
215 aa  166  4e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4400  hypothetical protein  44.39 
 
 
217 aa  157  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0106934  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2323  secretion protein HlyD  39.61 
 
 
231 aa  138  7.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000671168  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4149  hypothetical protein  35.75 
 
 
218 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.247441  hitchhiker  0.00000117092 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0454  secretion protein HlyD  36.19 
 
 
217 aa  122  4e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2016  secretion protein HlyD family protein  34.1 
 
 
517 aa  116  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0099  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  29.61 
 
 
220 aa  95.5  5e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3361  secretion protein HlyD family protein  34.51 
 
 
373 aa  82.4  0.000000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48280  putative multidrug resistance efflux pump  33.87 
 
 
383 aa  78.2  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0160418  normal  0.0591644 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3279  secretion protein HlyD  37.7 
 
 
385 aa  77.8  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.119493  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0207  secretion protein HlyD  35.2 
 
 
371 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.387162 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4494  secretion protein HlyD family protein  37.12 
 
 
374 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.001486  normal  0.244602 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2921  secretion protein HlyD family protein  36.72 
 
 
344 aa  76.6  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1157  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  36.72 
 
 
344 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2360  secretion protein HlyD family protein  35.71 
 
 
344 aa  76.3  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4975  secretion protein HlyD family protein  38.1 
 
 
363 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710374  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1624  HlyD family secretion protein  35.94 
 
 
377 aa  75.9  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5332  secretion protein HlyD family protein  38.4 
 
 
347 aa  75.5  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.588118 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4521  secretion protein HlyD family protein  30.82 
 
 
351 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.170966 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4511  secretion protein HlyD family protein  40 
 
 
397 aa  75.5  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.654674 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4283  secretion protein HlyD family protein  34.13 
 
 
365 aa  75.5  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.638187  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3991  secretion protein HlyD family protein  34.38 
 
 
371 aa  75.1  0.0000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3406  secretion protein HlyD family protein  31.51 
 
 
358 aa  75.1  0.0000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1445  secretion protein HlyD family protein  39.25 
 
 
444 aa  74.7  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0736  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  40.86 
 
 
375 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3095  secretion protein HlyD  33.88 
 
 
410 aa  74.7  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3768  secretion protein HlyD family protein  37.14 
 
 
364 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.20986 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4416  secretion protein HlyD family protein  40.86 
 
 
366 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.401076  normal  0.621386 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2726  multidrug ABC transporter transmembrane protein  38.52 
 
 
388 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.874339  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3632  secretion protein HlyD family protein  37.14 
 
 
363 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3490  secretion protein HlyD family protein  37.17 
 
 
448 aa  73.9  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.592297  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3235  secretion protein HlyD  37.27 
 
 
465 aa  73.9  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.265062  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4608  secretion protein HlyD  37.14 
 
 
364 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5486  secretion protein HlyD family protein  37.14 
 
 
363 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.707329  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3755  secretion protein HlyD family protein  37.14 
 
 
364 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.178549  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3253  secretion protein HlyD family protein  26.74 
 
 
373 aa  73.2  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2191  HlyD family secretion protein  34.71 
 
 
373 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201005  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1013  secretion protein HlyD  34.38 
 
 
394 aa  73.6  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3276  secretion protein HlyD family protein  35.83 
 
 
372 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3406  secretion protein HlyD  30.86 
 
 
419 aa  72.8  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0814588  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2082  secretion protein HlyD  28.57 
 
 
371 aa  72.8  0.000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.565949 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3626  secretion protein HlyD family protein  35.29 
 
 
374 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382081  normal  0.990317 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1512  secretion protein HlyD family protein  37.9 
 
 
405 aa  72.8  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4465  secretion protein HlyD  35.29 
 
 
374 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3901  secretion protein HlyD family protein  35.29 
 
 
374 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0262  secretion protein HlyD family protein  35.43 
 
 
405 aa  72  0.000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00123427 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0257  secretion protein HlyD family protein  35.43 
 
 
402 aa  72.4  0.000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1515  secretion protein HlyD  35 
 
 
405 aa  72  0.000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.498978  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1920  secretion protein HlyD  36.22 
 
 
383 aa  72  0.000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00498247  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1774  secretion protein HlyD family protein  30.67 
 
 
355 aa  72  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3484  secretion protein HlyD  35.37 
 
 
354 aa  71.6  0.000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.956784  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1980  secretion protein HlyD  31.68 
 
 
411 aa  71.6  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539609  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4202  hypothetical protein  31.18 
 
 
355 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4248  secretion protein HlyD family protein  31.82 
 
 
397 aa  71.2  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0400018  normal  0.0754484 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2528  secretion protein HlyD family protein  36.13 
 
 
349 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2004  secretion protein HlyD family protein  38.58 
 
 
380 aa  71.2  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6488  secretion protein HlyD family protein  35.54 
 
 
394 aa  71.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0618  secretion protein HlyD family protein  31.21 
 
 
392 aa  70.5  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2068  multidrug efflux MFS membrane fusion protein, putative  33.06 
 
 
425 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.851411 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0522  secretion protein HlyD family protein  29.75 
 
 
351 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.889598  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5998  secretion protein HlyD family protein  37.7 
 
 
394 aa  70.1  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2344  HlyD family secretion protein  36.19 
 
 
364 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2928  HlyD family secretion protein  36.07 
 
 
372 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3675  secretion protein HlyD family protein  33.06 
 
 
381 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0460  multidrug resistance protein  33.6 
 
 
403 aa  70.5  0.00000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0558  secretion protein HlyD family protein  33.33 
 
 
375 aa  70.5  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3795  secretion protein HlyD family protein  34.17 
 
 
373 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.327061 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6361  secretion protein HlyD family protein  36.07 
 
 
355 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1481  multidrug resistance protein, putative  36.97 
 
 
372 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318452  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4682  secretion protein HlyD family protein  35 
 
 
372 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.384444  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0524  HlyD family secretion protein  31.25 
 
 
301 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2180  secretion protein HlyD  29.01 
 
 
408 aa  70.1  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1467  secretion protein HlyD  36.07 
 
 
342 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0027674  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4968  secretion protein HlyD  33.88 
 
 
374 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3192  secretion protein HlyD family protein  33.88 
 
 
374 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5067  secretion protein HlyD family protein  33.33 
 
 
367 aa  69.3  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.592232 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1088  MFP family transporter  41.94 
 
 
368 aa  69.7  0.00000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.802038  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3743  secretion protein HlyD family protein  34.4 
 
 
453 aa  69.3  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00143217  normal  0.519955 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4261  secretion protein HlyD family protein  35.16 
 
 
347 aa  69.3  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  35.59 
 
 
383 aa  68.9  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2675  secretion protein HlyD family protein  35.2 
 
 
360 aa  68.6  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0834  secretion protein HlyD family protein  36.21 
 
 
396 aa  68.9  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.541495 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4053  secretion protein HlyD family protein  37.01 
 
 
349 aa  68.6  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.861449 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2795  secretion protein HlyD family protein  37.01 
 
 
402 aa  68.6  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.758551 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>